Protein–RNA interactions for Protein: Q86UT8

CCDC84, Coiled-coil domain-containing protein 84, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC84Q86UT8 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCDC84Q86UT8 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCDC84Q86UT8 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCDC84Q86UT8 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCDC84Q86UT8 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCDC84Q86UT8 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCDC84Q86UT8 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCDC84Q86UT8 MRPL53-201ENST00000258105 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCDC84Q86UT8 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCDC84Q86UT8 UFL1-AS1-201ENST00000430796 548 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCDC84Q86UT8 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCDC84Q86UT8 CHMP4A-204ENST00000530996 967 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCDC84Q86UT8 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCDC84Q86UT8 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCDC84Q86UT8 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCDC84Q86UT8 IER3IP1-202ENST00000639845 832 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCDC84Q86UT8 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCDC84Q86UT8 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCDC84Q86UT8 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCDC84Q86UT8 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCDC84Q86UT8 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCDC84Q86UT8 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCDC84Q86UT8 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCDC84Q86UT8 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCDC84Q86UT8 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCDC84Q86UT8 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCDC84Q86UT8 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCDC84Q86UT8 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCDC84Q86UT8 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCDC84Q86UT8 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCDC84Q86UT8 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCDC84Q86UT8 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCDC84Q86UT8 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
CCDC84Q86UT8 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCDC84Q86UT8 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCDC84Q86UT8 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCDC84Q86UT8 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCDC84Q86UT8 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCDC84Q86UT8 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCDC84Q86UT8 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCDC84Q86UT8 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
CCDC84Q86UT8 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
CCDC84Q86UT8 HDDC2-203ENST00000608284 538 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCDC84Q86UT8 CECR7-204ENST00000609932 568 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCDC84Q86UT8 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCDC84Q86UT8 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
CCDC84Q86UT8 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCDC84Q86UT8 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCDC84Q86UT8 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCDC84Q86UT8 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
CCDC84Q86UT8 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCDC84Q86UT8 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCDC84Q86UT8 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCDC84Q86UT8 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CCDC84Q86UT8 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CCDC84Q86UT8 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CCDC84Q86UT8 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CCDC84Q86UT8 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CCDC84Q86UT8 CRB3P1-201ENST00000449338 276 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
CCDC84Q86UT8 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CCDC84Q86UT8 AC095060.1-201ENST00000502455 549 ntTSL 4 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CCDC84Q86UT8 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CCDC84Q86UT8 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CCDC84Q86UT8 PTHLH-206ENST00000538310 854 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CCDC84Q86UT8 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
CCDC84Q86UT8 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CCDC84Q86UT8 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CCDC84Q86UT8 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CCDC84Q86UT8 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CCDC84Q86UT8 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CCDC84Q86UT8 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CCDC84Q86UT8 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CCDC84Q86UT8 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CCDC84Q86UT8 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CCDC84Q86UT8 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CCDC84Q86UT8 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CCDC84Q86UT8 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CCDC84Q86UT8 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CCDC84Q86UT8 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CCDC84Q86UT8 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CCDC84Q86UT8 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CCDC84Q86UT8 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CCDC84Q86UT8 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CCDC84Q86UT8 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CCDC84Q86UT8 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CCDC84Q86UT8 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CCDC84Q86UT8 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CCDC84Q86UT8 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CCDC84Q86UT8 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CCDC84Q86UT8 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CCDC84Q86UT8 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CCDC84Q86UT8 EDF1-203ENST00000371649 790 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CCDC84Q86UT8 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CCDC84Q86UT8 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CCDC84Q86UT8 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CCDC84Q86UT8 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CCDC84Q86UT8 PRKAG2-AS1-202ENST00000467458 1064 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CCDC84Q86UT8 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CCDC84Q86UT8 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
CCDC84Q86UT8 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.6 ms