Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZSB3

LINC00299, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00299, humanhuman

Predictions only

Length 139 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00299Q6ZSB3 FAM149A-202ENST00000356371 2997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
LINC00299Q6ZSB3 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
LINC00299Q6ZSB3 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
LINC00299Q6ZSB3 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
LINC00299Q6ZSB3 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
LINC00299Q6ZSB3 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
LINC00299Q6ZSB3 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
LINC00299Q6ZSB3 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
LINC00299Q6ZSB3 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
LINC00299Q6ZSB3 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
LINC00299Q6ZSB3 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
LINC00299Q6ZSB3 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
LINC00299Q6ZSB3 FGD5P1-202ENST00000614866 2498 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
LINC00299Q6ZSB3 C5orf66-206ENST00000624272 2479 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
LINC00299Q6ZSB3 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
LINC00299Q6ZSB3 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
LINC00299Q6ZSB3 SAFB-205ENST00000588852 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
LINC00299Q6ZSB3 RBM46-204ENST00000514866 2315 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
LINC00299Q6ZSB3 IL17RD-208ENST00000640796 2345 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
LINC00299Q6ZSB3 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
LINC00299Q6ZSB3 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
LINC00299Q6ZSB3 CASC2-203ENST00000435944 3270 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
LINC00299Q6ZSB3 PRR23C-201ENST00000413199 2791 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
LINC00299Q6ZSB3 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
LINC00299Q6ZSB3 MEOX1-202ENST00000329168 2129 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
LINC00299Q6ZSB3 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
LINC00299Q6ZSB3 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
LINC00299Q6ZSB3 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
LINC00299Q6ZSB3 SIGLEC9-202ENST00000440804 1960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
LINC00299Q6ZSB3 CAMKK2-211ENST00000538733 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
LINC00299Q6ZSB3 CYB5R3-205ENST00000407623 2153 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
LINC00299Q6ZSB3 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
LINC00299Q6ZSB3 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
LINC00299Q6ZSB3 ACER2-201ENST00000340967 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
LINC00299Q6ZSB3 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
LINC00299Q6ZSB3 MUM1-201ENST00000415183 2837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
LINC00299Q6ZSB3 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
LINC00299Q6ZSB3 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
LINC00299Q6ZSB3 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
LINC00299Q6ZSB3 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
LINC00299Q6ZSB3 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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LINC00299Q6ZSB3 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
LINC00299Q6ZSB3 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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LINC00299Q6ZSB3 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
LINC00299Q6ZSB3 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
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LINC00299Q6ZSB3 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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LINC00299Q6ZSB3 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
LINC00299Q6ZSB3 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
LINC00299Q6ZSB3 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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LINC00299Q6ZSB3 ZFP41-203ENST00000520584 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
LINC00299Q6ZSB3 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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LINC00299Q6ZSB3 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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LINC00299Q6ZSB3 ADAM15-203ENST00000356955 2949 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
LINC00299Q6ZSB3 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
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LINC00299Q6ZSB3 SEPT9-228ENST00000590294 2816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
LINC00299Q6ZSB3 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
LINC00299Q6ZSB3 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
LINC00299Q6ZSB3 TRPC6-203ENST00000360497 2631 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
LINC00299Q6ZSB3 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
LINC00299Q6ZSB3 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
LINC00299Q6ZSB3 GPKOW-201ENST00000156109 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
LINC00299Q6ZSB3 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
LINC00299Q6ZSB3 LINC00910-206ENST00000592135 2438 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
LINC00299Q6ZSB3 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
LINC00299Q6ZSB3 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
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