Protein–RNA interactions for Protein: Q567U6

CCDC93, Coiled-coil domain-containing protein 93, humanhuman

Predictions only

Length 631 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC93Q567U6 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC93Q567U6 PXMP4-202ENST00000344022 989 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC93Q567U6 CLCN6-207ENST00000376497 814 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC93Q567U6 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC93Q567U6 OSM-203ENST00000403463 464 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC93Q567U6 RASL12-203ENST00000434605 982 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC93Q567U6 NUTM2A-AS1-212ENST00000458739 733 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC93Q567U6 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC93Q567U6 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC93Q567U6 AC021054.1-202ENST00000543884 599 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC93Q567U6 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC93Q567U6 PIMREG-202ENST00000570337 891 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC93Q567U6 PIMREG-203ENST00000571373 1002 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC93Q567U6 AC004790.1-201ENST00000612686 536 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC93Q567U6 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC93Q567U6 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC93Q567U6 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC93Q567U6 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC93Q567U6 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC93Q567U6 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC93Q567U6 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC93Q567U6 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC93Q567U6 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC93Q567U6 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC93Q567U6 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC93Q567U6 OTUB1-206ENST00000535715 1391 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC93Q567U6 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC93Q567U6 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC93Q567U6 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC93Q567U6 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC93Q567U6 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC93Q567U6 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC93Q567U6 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC93Q567U6 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC93Q567U6 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC93Q567U6 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC93Q567U6 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC93Q567U6 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC93Q567U6 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC93Q567U6 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC93Q567U6 KIAA0907-201ENST00000368319 1155 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC93Q567U6 IFITM3-201ENST00000399808 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC93Q567U6 AC087294.1-202ENST00000439136 487 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC93Q567U6 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC93Q567U6 AL606760.2-202ENST00000452466 524 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC93Q567U6 SLC35B4-204ENST00000470969 1033 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC93Q567U6 LCN10-203ENST00000474369 564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC93Q567U6 NEIL2-207ENST00000528323 998 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC93Q567U6 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC93Q567U6 AC105339.1-202ENST00000559535 1283 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC93Q567U6 AC087294.1-201ENST00000580291 1152 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC93Q567U6 TXNL4A-212ENST00000592957 546 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC93Q567U6 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC93Q567U6 AC007431.3-201ENST00000623221 587 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC93Q567U6 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC93Q567U6 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC93Q567U6 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC93Q567U6 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC93Q567U6 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC93Q567U6 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC93Q567U6 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC93Q567U6 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC93Q567U6 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC93Q567U6 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC93Q567U6 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC93Q567U6 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC93Q567U6 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC93Q567U6 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CCDC93Q567U6 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CCDC93Q567U6 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CCDC93Q567U6 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CCDC93Q567U6 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CCDC93Q567U6 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CCDC93Q567U6 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CCDC93Q567U6 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
CCDC93Q567U6 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CCDC93Q567U6 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CCDC93Q567U6 HOPX-203ENST00000381255 1164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CCDC93Q567U6 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CCDC93Q567U6 AL133456.1-201ENST00000415655 577 ntTSL 4 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CCDC93Q567U6 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CCDC93Q567U6 HOPX-210ENST00000553379 1001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CCDC93Q567U6 HOPX-212ENST00000555760 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CCDC93Q567U6 HOPX-213ENST00000556376 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CCDC93Q567U6 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CCDC93Q567U6 ELOF1-206ENST00000590700 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CCDC93Q567U6 AC008770.3-202ENST00000591944 567 ntTSL 4 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CCDC93Q567U6 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CCDC93Q567U6 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CCDC93Q567U6 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC20.33■□□□□ 0.84
CCDC93Q567U6 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CCDC93Q567U6 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
CCDC93Q567U6 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CCDC93Q567U6 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CCDC93Q567U6 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CCDC93Q567U6 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
CCDC93Q567U6 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCDC93Q567U6 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCDC93Q567U6 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCDC93Q567U6 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.2 ms