Protein–RNA interactions for Protein: Q53HC0

CCDC92, Coiled-coil domain-containing protein 92, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC92Q53HC0 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCDC92Q53HC0 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CCDC92Q53HC0 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CCDC92Q53HC0 PDPK1-201ENST00000268673 4728 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CCDC92Q53HC0 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CCDC92Q53HC0 ROCK1-201ENST00000399799 9484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CCDC92Q53HC0 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CCDC92Q53HC0 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CCDC92Q53HC0 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
CCDC92Q53HC0 TRPM2-204ENST00000397932 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CCDC92Q53HC0 MINK1-201ENST00000347992 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CCDC92Q53HC0 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CCDC92Q53HC0 LINC00841-201ENST00000451929 2126 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CCDC92Q53HC0 CLCN7-201ENST00000262318 3717 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CCDC92Q53HC0 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CCDC92Q53HC0 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC92Q53HC0 AC138969.2-201ENST00000532739 9932 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC92Q53HC0 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC92Q53HC0 TOMM40L-201ENST00000367987 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC92Q53HC0 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC92Q53HC0 HELZ2-204ENST00000467148 8064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC92Q53HC0 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC92Q53HC0 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC92Q53HC0 IFNAR1-201ENST00000270139 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC92Q53HC0 LINC01305-201ENST00000420866 3123 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC92Q53HC0 SLC22A7-203ENST00000372589 2549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC92Q53HC0 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC92Q53HC0 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC92Q53HC0 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC92Q53HC0 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC92Q53HC0 UNC13A-202ENST00000519716 9838 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC92Q53HC0 GPN1-201ENST00000264718 2496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC92Q53HC0 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC92Q53HC0 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC92Q53HC0 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC92Q53HC0 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC92Q53HC0 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC92Q53HC0 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC92Q53HC0 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC92Q53HC0 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC92Q53HC0 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC92Q53HC0 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC92Q53HC0 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC92Q53HC0 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC92Q53HC0 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC92Q53HC0 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC92Q53HC0 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC92Q53HC0 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC92Q53HC0 ZHX1-201ENST00000297857 5200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC92Q53HC0 ELK1-201ENST00000247161 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC92Q53HC0 NEIL2-201ENST00000284503 2671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC92Q53HC0 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC92Q53HC0 RCOR2-201ENST00000301459 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC92Q53HC0 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC92Q53HC0 MYH7-201ENST00000355349 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC92Q53HC0 BCAR1-204ENST00000418647 3387 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC92Q53HC0 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC92Q53HC0 ATP11B-201ENST00000323116 7325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC92Q53HC0 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC92Q53HC0 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC92Q53HC0 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC92Q53HC0 PID1-202ENST00000392054 2745 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC92Q53HC0 PDP1-201ENST00000297598 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC92Q53HC0 NPFFR1-201ENST00000277942 8921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC92Q53HC0 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC92Q53HC0 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC92Q53HC0 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC92Q53HC0 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC92Q53HC0 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC92Q53HC0 GCFC2-201ENST00000321027 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC92Q53HC0 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC92Q53HC0 AC087386.2-201ENST00000623212 4637 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC92Q53HC0 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC92Q53HC0 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC92Q53HC0 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC92Q53HC0 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC92Q53HC0 CNDP2-201ENST00000324262 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC92Q53HC0 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC92Q53HC0 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC92Q53HC0 DTX3-202ENST00000548198 3199 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC92Q53HC0 ARHGEF6-202ENST00000370620 4764 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC92Q53HC0 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC92Q53HC0 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC92Q53HC0 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC92Q53HC0 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC92Q53HC0 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC92Q53HC0 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC92Q53HC0 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC92Q53HC0 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC92Q53HC0 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC92Q53HC0 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC92Q53HC0 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC92Q53HC0 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC92Q53HC0 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC92Q53HC0 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC92Q53HC0 ZDHHC3-201ENST00000296127 3101 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC92Q53HC0 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC92Q53HC0 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC92Q53HC0 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC92Q53HC0 GRK6-211ENST00000528793 2571 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms