Protein–RNA interactions for Protein: Q13813

SPTAN1, Spectrin alpha chain, non-erythrocytic 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,472 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTAN1Q13813 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
SPTAN1Q13813 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SPTAN1Q13813 AC010491.1-203ENST00000564167 638 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SPTAN1Q13813 TSR1-204ENST00000576112 1290 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SPTAN1Q13813 AC010641.1-201ENST00000591757 529 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SPTAN1Q13813 AC099795.1-202ENST00000640492 759 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SPTAN1Q13813 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SPTAN1Q13813 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SPTAN1Q13813 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SPTAN1Q13813 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SPTAN1Q13813 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SPTAN1Q13813 VEZF1-202ENST00000581208 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SPTAN1Q13813 SEPT8-206ENST00000378706 4168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SPTAN1Q13813 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SPTAN1Q13813 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SPTAN1Q13813 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SPTAN1Q13813 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SPTAN1Q13813 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SPTAN1Q13813 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SPTAN1Q13813 CTSW-201ENST00000307886 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SPTAN1Q13813 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
SPTAN1Q13813 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SPTAN1Q13813 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SPTAN1Q13813 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SPTAN1Q13813 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SPTAN1Q13813 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SPTAN1Q13813 AP000317.2-201ENST00000362077 641 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SPTAN1Q13813 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SPTAN1Q13813 NUS1P3-201ENST00000423502 862 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
SPTAN1Q13813 FADS2-212ENST00000522639 360 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SPTAN1Q13813 CNGA4-202ENST00000533426 936 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SPTAN1Q13813 AC020763.1-201ENST00000567186 551 ntTSL 4 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SPTAN1Q13813 FADS2-215ENST00000574708 385 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SPTAN1Q13813 AC003070.2-201ENST00000589730 386 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SPTAN1Q13813 UBA6-AS1-201ENST00000498917 1445 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SPTAN1Q13813 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SPTAN1Q13813 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SPTAN1Q13813 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SPTAN1Q13813 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SPTAN1Q13813 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SPTAN1Q13813 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SPTAN1Q13813 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SPTAN1Q13813 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SPTAN1Q13813 EIF3K-203ENST00000545173 1327 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SPTAN1Q13813 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SPTAN1Q13813 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SPTAN1Q13813 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SPTAN1Q13813 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SPTAN1Q13813 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SPTAN1Q13813 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SPTAN1Q13813 CFLAR-203ENST00000341222 1283 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SPTAN1Q13813 TREML1-202ENST00000426005 981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SPTAN1Q13813 AL132639.3-201ENST00000556537 530 ntTSL 4 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SPTAN1Q13813 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SPTAN1Q13813 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SPTAN1Q13813 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SPTAN1Q13813 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SPTAN1Q13813 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SPTAN1Q13813 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SPTAN1Q13813 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SPTAN1Q13813 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SPTAN1Q13813 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SPTAN1Q13813 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SPTAN1Q13813 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SPTAN1Q13813 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SPTAN1Q13813 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SPTAN1Q13813 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SPTAN1Q13813 LINC01185-202ENST00000452343 1705 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SPTAN1Q13813 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SPTAN1Q13813 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SPTAN1Q13813 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SPTAN1Q13813 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SPTAN1Q13813 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SPTAN1Q13813 PHACTR1-202ENST00000379329 707 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SPTAN1Q13813 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SPTAN1Q13813 DOC2GP-202ENST00000514950 1163 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
SPTAN1Q13813 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SPTAN1Q13813 FAU-205ENST00000527548 538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SPTAN1Q13813 AC027601.2-201ENST00000571085 805 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SPTAN1Q13813 AP001033.1-201ENST00000584509 466 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SPTAN1Q13813 WFDC1-204ENST00000613603 549 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
SPTAN1Q13813 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SPTAN1Q13813 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SPTAN1Q13813 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SPTAN1Q13813 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SPTAN1Q13813 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SPTAN1Q13813 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SPTAN1Q13813 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SPTAN1Q13813 BRINP1-202ENST00000373964 1641 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SPTAN1Q13813 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SPTAN1Q13813 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SPTAN1Q13813 DMRT2-202ENST00000302441 1495 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SPTAN1Q13813 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SPTAN1Q13813 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SPTAN1Q13813 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SPTAN1Q13813 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SPTAN1Q13813 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SPTAN1Q13813 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SPTAN1Q13813 SLC25A26-201ENST00000336733 1023 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SPTAN1Q13813 SHBG-202ENST00000380450 1271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
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