Protein–RNA interactions for Protein: Q13608

PEX6, Peroxisome assembly factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 980 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PEX6Q13608 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PEX6Q13608 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PEX6Q13608 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PEX6Q13608 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PEX6Q13608 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PEX6Q13608 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PEX6Q13608 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
PEX6Q13608 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PEX6Q13608 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PEX6Q13608 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
PEX6Q13608 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PEX6Q13608 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PEX6Q13608 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PEX6Q13608 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PEX6Q13608 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PEX6Q13608 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PEX6Q13608 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PEX6Q13608 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PEX6Q13608 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PEX6Q13608 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PEX6Q13608 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PEX6Q13608 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PEX6Q13608 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PEX6Q13608 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
PEX6Q13608 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PEX6Q13608 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PEX6Q13608 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PEX6Q13608 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PEX6Q13608 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PEX6Q13608 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PEX6Q13608 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PEX6Q13608 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PEX6Q13608 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PEX6Q13608 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PEX6Q13608 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PEX6Q13608 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PEX6Q13608 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PEX6Q13608 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
PEX6Q13608 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PEX6Q13608 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PEX6Q13608 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PEX6Q13608 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PEX6Q13608 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PEX6Q13608 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PEX6Q13608 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PEX6Q13608 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
PEX6Q13608 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
PEX6Q13608 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PEX6Q13608 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PEX6Q13608 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
PEX6Q13608 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
PEX6Q13608 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PEX6Q13608 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
PEX6Q13608 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
PEX6Q13608 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PEX6Q13608 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PEX6Q13608 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PEX6Q13608 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PEX6Q13608 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PEX6Q13608 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PEX6Q13608 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PEX6Q13608 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PEX6Q13608 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PEX6Q13608 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PEX6Q13608 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PEX6Q13608 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PEX6Q13608 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PEX6Q13608 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PEX6Q13608 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PEX6Q13608 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PEX6Q13608 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PEX6Q13608 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PEX6Q13608 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
PEX6Q13608 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PEX6Q13608 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PEX6Q13608 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PEX6Q13608 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PEX6Q13608 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PEX6Q13608 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PEX6Q13608 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PEX6Q13608 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PEX6Q13608 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PEX6Q13608 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PEX6Q13608 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PEX6Q13608 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PEX6Q13608 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PEX6Q13608 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PEX6Q13608 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PEX6Q13608 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PEX6Q13608 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
PEX6Q13608 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PEX6Q13608 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PEX6Q13608 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PEX6Q13608 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PEX6Q13608 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PEX6Q13608 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PEX6Q13608 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PEX6Q13608 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PEX6Q13608 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PEX6Q13608 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.9 ms