Protein–RNA interactions for Protein: Q13485

SMAD4, Mothers against decapentaplegic homolog 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 552 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD4Q13485 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SMAD4Q13485 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SMAD4Q13485 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SMAD4Q13485 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
SMAD4Q13485 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
SMAD4Q13485 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
SMAD4Q13485 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
SMAD4Q13485 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
SMAD4Q13485 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SMAD4Q13485 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SMAD4Q13485 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SMAD4Q13485 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SMAD4Q13485 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SMAD4Q13485 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SMAD4Q13485 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SMAD4Q13485 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SMAD4Q13485 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
SMAD4Q13485 POLR2I-201ENST00000221859 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SMAD4Q13485 NTMT1-202ENST00000372481 741 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SMAD4Q13485 GEMIN4-202ENST00000437269 1182 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SMAD4Q13485 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SMAD4Q13485 AL162726.2-201ENST00000438986 1017 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
SMAD4Q13485 CSF2RBP1-201ENST00000447905 391 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
SMAD4Q13485 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
SMAD4Q13485 AC108725.1-201ENST00000495472 409 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
SMAD4Q13485 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SMAD4Q13485 AC138028.3-201ENST00000561699 213 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SMAD4Q13485 COMMD4-217ENST00000567195 677 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SMAD4Q13485 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SMAD4Q13485 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SMAD4Q13485 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SMAD4Q13485 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SMAD4Q13485 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SMAD4Q13485 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SMAD4Q13485 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SMAD4Q13485 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SMAD4Q13485 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
SMAD4Q13485 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
SMAD4Q13485 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SMAD4Q13485 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
SMAD4Q13485 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SMAD4Q13485 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SMAD4Q13485 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SMAD4Q13485 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SMAD4Q13485 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SMAD4Q13485 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
SMAD4Q13485 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SMAD4Q13485 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SMAD4Q13485 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SMAD4Q13485 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SMAD4Q13485 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SMAD4Q13485 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SMAD4Q13485 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SMAD4Q13485 FANK1-204ENST00000368695 1296 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SMAD4Q13485 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SMAD4Q13485 RAB34-210ENST00000436730 863 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SMAD4Q13485 AC093904.1-201ENST00000474561 455 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SMAD4Q13485 AC008750.2-202ENST00000532688 729 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SMAD4Q13485 BX927359.1-201ENST00000556073 543 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SMAD4Q13485 AC025048.3-201ENST00000590609 569 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
SMAD4Q13485 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SMAD4Q13485 AC005702.4-201ENST00000618393 416 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
SMAD4Q13485 ABBA01031660.1-201ENST00000635219 756 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
SMAD4Q13485 OR2T27-203ENST00000641652 1285 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SMAD4Q13485 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SMAD4Q13485 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SMAD4Q13485 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SMAD4Q13485 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SMAD4Q13485 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SMAD4Q13485 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SMAD4Q13485 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SMAD4Q13485 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SMAD4Q13485 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SMAD4Q13485 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
SMAD4Q13485 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SMAD4Q13485 IGHA1-202ENST00000641837 1310 ntAPPRIS P5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SMAD4Q13485 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SMAD4Q13485 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SMAD4Q13485 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SMAD4Q13485 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SMAD4Q13485 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SMAD4Q13485 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SMAD4Q13485 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SMAD4Q13485 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SMAD4Q13485 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SMAD4Q13485 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SMAD4Q13485 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SMAD4Q13485 CARTPT-201ENST00000296777 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SMAD4Q13485 MRPL55-215ENST00000366742 630 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SMAD4Q13485 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SMAD4Q13485 GOLGA2P4-201ENST00000441462 777 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
SMAD4Q13485 AC113608.2-201ENST00000448379 487 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SMAD4Q13485 PFN1P12-201ENST00000455938 534 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
SMAD4Q13485 AC018685.1-201ENST00000457813 368 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SMAD4Q13485 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SMAD4Q13485 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SMAD4Q13485 ACYP1-206ENST00000555694 565 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SMAD4Q13485 GCHFR-206ENST00000561160 572 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SMAD4Q13485 MIR5189-201ENST00000577370 114 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
SMAD4Q13485 TUBB6-203ENST00000586653 788 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms