Protein–RNA interactions for Protein: Q13352

ITGB3BP, Centromere protein R, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 177 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB3BPQ13352 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ITGB3BPQ13352 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ITGB3BPQ13352 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ITGB3BPQ13352 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ITGB3BPQ13352 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ITGB3BPQ13352 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ITGB3BPQ13352 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ITGB3BPQ13352 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ITGB3BPQ13352 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ITGB3BPQ13352 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ITGB3BPQ13352 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ITGB3BPQ13352 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ITGB3BPQ13352 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ITGB3BPQ13352 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ITGB3BPQ13352 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ITGB3BPQ13352 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ITGB3BPQ13352 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ITGB3BPQ13352 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ITGB3BPQ13352 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ITGB3BPQ13352 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ITGB3BPQ13352 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ITGB3BPQ13352 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ITGB3BPQ13352 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ITGB3BPQ13352 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ITGB3BPQ13352 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ITGB3BPQ13352 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ITGB3BPQ13352 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ITGB3BPQ13352 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ITGB3BPQ13352 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ITGB3BPQ13352 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ITGB3BPQ13352 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ITGB3BPQ13352 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ITGB3BPQ13352 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ITGB3BPQ13352 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
ITGB3BPQ13352 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ITGB3BPQ13352 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ITGB3BPQ13352 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ITGB3BPQ13352 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ITGB3BPQ13352 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ITGB3BPQ13352 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ITGB3BPQ13352 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ITGB3BPQ13352 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ITGB3BPQ13352 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ITGB3BPQ13352 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ITGB3BPQ13352 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
ITGB3BPQ13352 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ITGB3BPQ13352 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
ITGB3BPQ13352 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
ITGB3BPQ13352 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ITGB3BPQ13352 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
ITGB3BPQ13352 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
ITGB3BPQ13352 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
ITGB3BPQ13352 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
ITGB3BPQ13352 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC18.68■□□□□ 0.58
ITGB3BPQ13352 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ITGB3BPQ13352 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ITGB3BPQ13352 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ITGB3BPQ13352 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
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ITGB3BPQ13352 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
ITGB3BPQ13352 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC18.68■□□□□ 0.58
ITGB3BPQ13352 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ITGB3BPQ13352 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
ITGB3BPQ13352 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
ITGB3BPQ13352 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ITGB3BPQ13352 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ITGB3BPQ13352 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
ITGB3BPQ13352 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ITGB3BPQ13352 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
ITGB3BPQ13352 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ITGB3BPQ13352 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ITGB3BPQ13352 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ITGB3BPQ13352 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ITGB3BPQ13352 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
ITGB3BPQ13352 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ITGB3BPQ13352 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ITGB3BPQ13352 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ITGB3BPQ13352 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ITGB3BPQ13352 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ITGB3BPQ13352 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
ITGB3BPQ13352 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
ITGB3BPQ13352 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
ITGB3BPQ13352 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
ITGB3BPQ13352 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
ITGB3BPQ13352 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ITGB3BPQ13352 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ITGB3BPQ13352 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ITGB3BPQ13352 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ITGB3BPQ13352 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
ITGB3BPQ13352 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
ITGB3BPQ13352 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
ITGB3BPQ13352 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
ITGB3BPQ13352 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
ITGB3BPQ13352 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
ITGB3BPQ13352 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
ITGB3BPQ13352 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ITGB3BPQ13352 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ITGB3BPQ13352 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
ITGB3BPQ13352 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
ITGB3BPQ13352 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
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