Protein–RNA interactions for Protein: Q12789

GTF3C1, General transcription factor 3C polypeptide 1, humanhuman

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Length 2,109 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C1Q12789 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
GTF3C1Q12789 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
GTF3C1Q12789 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
GTF3C1Q12789 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
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GTF3C1Q12789 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
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GTF3C1Q12789 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
GTF3C1Q12789 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
GTF3C1Q12789 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
GTF3C1Q12789 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
GTF3C1Q12789 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
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GTF3C1Q12789 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
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GTF3C1Q12789 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
GTF3C1Q12789 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
GTF3C1Q12789 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
GTF3C1Q12789 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
GTF3C1Q12789 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
GTF3C1Q12789 VCX2-201ENST00000317103 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
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GTF3C1Q12789 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
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GTF3C1Q12789 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
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GTF3C1Q12789 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
GTF3C1Q12789 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
GTF3C1Q12789 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
GTF3C1Q12789 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
GTF3C1Q12789 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
GTF3C1Q12789 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
GTF3C1Q12789 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
GTF3C1Q12789 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
GTF3C1Q12789 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
GTF3C1Q12789 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
GTF3C1Q12789 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
GTF3C1Q12789 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
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