Protein–RNA interactions for Protein: Q06124

PTPN11, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 11, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 597 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN11Q06124 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PTPN11Q06124 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PTPN11Q06124 CD4-210ENST00000541982 1187 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PTPN11Q06124 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PTPN11Q06124 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PTPN11Q06124 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PTPN11Q06124 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PTPN11Q06124 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PTPN11Q06124 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PTPN11Q06124 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PTPN11Q06124 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PTPN11Q06124 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PTPN11Q06124 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
PTPN11Q06124 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
PTPN11Q06124 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
PTPN11Q06124 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PTPN11Q06124 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PTPN11Q06124 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PTPN11Q06124 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PTPN11Q06124 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PTPN11Q06124 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PTPN11Q06124 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PTPN11Q06124 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PTPN11Q06124 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PTPN11Q06124 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PTPN11Q06124 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PTPN11Q06124 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PTPN11Q06124 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PTPN11Q06124 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PTPN11Q06124 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PTPN11Q06124 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PTPN11Q06124 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PTPN11Q06124 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PTPN11Q06124 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PTPN11Q06124 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PTPN11Q06124 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PTPN11Q06124 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PTPN11Q06124 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PTPN11Q06124 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PTPN11Q06124 AL807752.4-201ENST00000439076 580 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PTPN11Q06124 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
PTPN11Q06124 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PTPN11Q06124 MAPKAPK5-203ENST00000547305 494 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PTPN11Q06124 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PTPN11Q06124 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PTPN11Q06124 AC005544.2-201ENST00000579138 229 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PTPN11Q06124 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PTPN11Q06124 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PTPN11Q06124 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PTPN11Q06124 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PTPN11Q06124 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
PTPN11Q06124 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PTPN11Q06124 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PTPN11Q06124 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PTPN11Q06124 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PTPN11Q06124 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PTPN11Q06124 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PTPN11Q06124 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PTPN11Q06124 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
PTPN11Q06124 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PTPN11Q06124 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PTPN11Q06124 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PTPN11Q06124 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PTPN11Q06124 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PTPN11Q06124 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PTPN11Q06124 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PTPN11Q06124 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PTPN11Q06124 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PTPN11Q06124 DZANK1-202ENST00000329494 1389 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PTPN11Q06124 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PTPN11Q06124 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PTPN11Q06124 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PTPN11Q06124 KRTAP6-3-201ENST00000391624 636 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PTPN11Q06124 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PTPN11Q06124 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PTPN11Q06124 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PTPN11Q06124 RN7SL692P-201ENST00000464677 288 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
PTPN11Q06124 AC095060.1-201ENST00000502455 549 ntTSL 4 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PTPN11Q06124 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PTPN11Q06124 FOLR3-204ENST00000611028 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PTPN11Q06124 IER3IP1-202ENST00000639845 832 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PTPN11Q06124 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PTPN11Q06124 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PTPN11Q06124 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PTPN11Q06124 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
PTPN11Q06124 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PTPN11Q06124 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PTPN11Q06124 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
PTPN11Q06124 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PTPN11Q06124 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PTPN11Q06124 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PTPN11Q06124 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PTPN11Q06124 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PTPN11Q06124 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PTPN11Q06124 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PTPN11Q06124 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PTPN11Q06124 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PTPN11Q06124 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PTPN11Q06124 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PTPN11Q06124 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms