Protein–RNA interactions for Protein: P57772

EEFSEC, Selenocysteine-specific elongation factor, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 596 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EEFSECP57772 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
EEFSECP57772 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
EEFSECP57772 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
EEFSECP57772 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
EEFSECP57772 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
EEFSECP57772 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
EEFSECP57772 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
EEFSECP57772 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
EEFSECP57772 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
EEFSECP57772 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
EEFSECP57772 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
EEFSECP57772 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
EEFSECP57772 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
EEFSECP57772 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
EEFSECP57772 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
EEFSECP57772 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
EEFSECP57772 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
EEFSECP57772 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
EEFSECP57772 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
EEFSECP57772 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
EEFSECP57772 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
EEFSECP57772 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
EEFSECP57772 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
EEFSECP57772 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
EEFSECP57772 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
EEFSECP57772 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
EEFSECP57772 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
EEFSECP57772 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
EEFSECP57772 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
EEFSECP57772 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
EEFSECP57772 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
EEFSECP57772 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
EEFSECP57772 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
EEFSECP57772 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
EEFSECP57772 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
EEFSECP57772 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
EEFSECP57772 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
EEFSECP57772 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
EEFSECP57772 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
EEFSECP57772 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
EEFSECP57772 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
EEFSECP57772 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
EEFSECP57772 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
EEFSECP57772 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
EEFSECP57772 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
EEFSECP57772 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
EEFSECP57772 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
EEFSECP57772 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
EEFSECP57772 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
EEFSECP57772 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
EEFSECP57772 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
EEFSECP57772 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
EEFSECP57772 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
EEFSECP57772 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
EEFSECP57772 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
EEFSECP57772 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
EEFSECP57772 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
EEFSECP57772 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
EEFSECP57772 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
EEFSECP57772 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
EEFSECP57772 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
EEFSECP57772 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
EEFSECP57772 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
EEFSECP57772 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
EEFSECP57772 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
EEFSECP57772 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
EEFSECP57772 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
EEFSECP57772 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
EEFSECP57772 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
EEFSECP57772 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
EEFSECP57772 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
EEFSECP57772 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
EEFSECP57772 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
EEFSECP57772 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
EEFSECP57772 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
EEFSECP57772 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
EEFSECP57772 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
EEFSECP57772 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
EEFSECP57772 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
EEFSECP57772 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
EEFSECP57772 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
EEFSECP57772 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
EEFSECP57772 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
EEFSECP57772 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
EEFSECP57772 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
EEFSECP57772 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
EEFSECP57772 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
EEFSECP57772 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
EEFSECP57772 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
EEFSECP57772 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
EEFSECP57772 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
EEFSECP57772 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
EEFSECP57772 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
EEFSECP57772 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
EEFSECP57772 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
EEFSECP57772 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
EEFSECP57772 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
EEFSECP57772 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
EEFSECP57772 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
EEFSECP57772 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.5 ms