Protein–RNA interactions for Protein: P28288

ABCD3, ATP-binding cassette sub-family D member 3, humanhuman

Predictions only

Length 659 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCD3P28288 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ABCD3P28288 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ABCD3P28288 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
ABCD3P28288 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
ABCD3P28288 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ABCD3P28288 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
ABCD3P28288 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ABCD3P28288 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ABCD3P28288 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ABCD3P28288 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ABCD3P28288 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
ABCD3P28288 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ABCD3P28288 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ABCD3P28288 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
ABCD3P28288 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ABCD3P28288 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ABCD3P28288 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ABCD3P28288 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ABCD3P28288 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ABCD3P28288 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ABCD3P28288 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ABCD3P28288 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ABCD3P28288 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ABCD3P28288 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ABCD3P28288 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ABCD3P28288 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ABCD3P28288 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ABCD3P28288 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
ABCD3P28288 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ABCD3P28288 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ABCD3P28288 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ABCD3P28288 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ABCD3P28288 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
ABCD3P28288 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ABCD3P28288 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ABCD3P28288 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ABCD3P28288 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ABCD3P28288 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ABCD3P28288 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ABCD3P28288 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ABCD3P28288 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ABCD3P28288 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
ABCD3P28288 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ABCD3P28288 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ABCD3P28288 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
ABCD3P28288 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
ABCD3P28288 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
ABCD3P28288 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ABCD3P28288 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ABCD3P28288 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ABCD3P28288 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ABCD3P28288 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ABCD3P28288 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
ABCD3P28288 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ABCD3P28288 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ABCD3P28288 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ABCD3P28288 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
ABCD3P28288 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ABCD3P28288 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ABCD3P28288 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ABCD3P28288 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ABCD3P28288 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ABCD3P28288 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ABCD3P28288 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ABCD3P28288 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ABCD3P28288 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ABCD3P28288 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ABCD3P28288 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ABCD3P28288 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ABCD3P28288 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ABCD3P28288 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ABCD3P28288 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ABCD3P28288 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ABCD3P28288 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ABCD3P28288 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ABCD3P28288 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ABCD3P28288 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ABCD3P28288 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ABCD3P28288 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ABCD3P28288 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ABCD3P28288 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ABCD3P28288 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ABCD3P28288 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ABCD3P28288 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ABCD3P28288 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ABCD3P28288 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ABCD3P28288 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ABCD3P28288 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ABCD3P28288 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ABCD3P28288 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ABCD3P28288 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ABCD3P28288 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ABCD3P28288 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ABCD3P28288 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ABCD3P28288 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ABCD3P28288 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ABCD3P28288 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
ABCD3P28288 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ABCD3P28288 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ABCD3P28288 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms