Protein–RNA interactions for Protein: P23229

ITGA6, Integrin alpha-6, humanhuman

Predictions only

Length 1,130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA6P23229 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ITGA6P23229 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ITGA6P23229 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ITGA6P23229 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ITGA6P23229 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ITGA6P23229 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ITGA6P23229 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ITGA6P23229 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ITGA6P23229 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ITGA6P23229 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ITGA6P23229 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ITGA6P23229 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ITGA6P23229 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ITGA6P23229 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
ITGA6P23229 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ITGA6P23229 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
ITGA6P23229 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ITGA6P23229 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ITGA6P23229 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ITGA6P23229 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ITGA6P23229 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ITGA6P23229 CD8B-201ENST00000331469 832 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ITGA6P23229 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ITGA6P23229 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ITGA6P23229 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ITGA6P23229 AC002472.2-201ENST00000442739 958 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
ITGA6P23229 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ITGA6P23229 COX20P2-201ENST00000452636 358 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
ITGA6P23229 AC002310.2-201ENST00000486926 950 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ITGA6P23229 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ITGA6P23229 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ITGA6P23229 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ITGA6P23229 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ITGA6P23229 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ITGA6P23229 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
ITGA6P23229 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ITGA6P23229 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ITGA6P23229 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
ITGA6P23229 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ITGA6P23229 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ITGA6P23229 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ITGA6P23229 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ITGA6P23229 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ITGA6P23229 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ITGA6P23229 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ITGA6P23229 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ITGA6P23229 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ITGA6P23229 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
ITGA6P23229 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ITGA6P23229 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
ITGA6P23229 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ITGA6P23229 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ITGA6P23229 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
ITGA6P23229 AL512638.1-201ENST00000457493 794 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
ITGA6P23229 AC004890.2-204ENST00000481968 304 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
ITGA6P23229 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ITGA6P23229 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ITGA6P23229 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ITGA6P23229 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ITGA6P23229 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ITGA6P23229 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ITGA6P23229 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
ITGA6P23229 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ITGA6P23229 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
ITGA6P23229 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ITGA6P23229 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ITGA6P23229 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ITGA6P23229 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ITGA6P23229 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ITGA6P23229 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ITGA6P23229 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ITGA6P23229 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ITGA6P23229 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ITGA6P23229 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ITGA6P23229 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ITGA6P23229 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ITGA6P23229 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ITGA6P23229 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ITGA6P23229 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ITGA6P23229 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ITGA6P23229 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ITGA6P23229 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ITGA6P23229 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ITGA6P23229 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ITGA6P23229 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ITGA6P23229 ZDHHC20-IT1-201ENST00000417513 440 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
ITGA6P23229 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
ITGA6P23229 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
ITGA6P23229 AC016735.2-201ENST00000438736 569 ntTSL 4 BASIC20.4■□□□□ 0.86
ITGA6P23229 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC20.4■□□□□ 0.86
ITGA6P23229 AC019103.1-201ENST00000503095 272 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
ITGA6P23229 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
ITGA6P23229 AC055854.1-201ENST00000523627 570 ntTSL 4 BASIC20.4■□□□□ 0.86
ITGA6P23229 MIR210HG-203ENST00000533920 816 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
ITGA6P23229 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ITGA6P23229 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ITGA6P23229 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ITGA6P23229 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ITGA6P23229 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
ITGA6P23229 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.1 ms