Protein–RNA interactions for Protein: P04839

CYBB, Cytochrome b-245 heavy chain, humanhuman

Predictions only

Length 570 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYBBP04839 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CYBBP04839 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CYBBP04839 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
CYBBP04839 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
CYBBP04839 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CYBBP04839 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CYBBP04839 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CYBBP04839 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CYBBP04839 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CYBBP04839 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CYBBP04839 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CYBBP04839 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CYBBP04839 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CYBBP04839 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CYBBP04839 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CYBBP04839 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
CYBBP04839 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CYBBP04839 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CYBBP04839 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CYBBP04839 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CYBBP04839 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CYBBP04839 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CYBBP04839 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CYBBP04839 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CYBBP04839 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CYBBP04839 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CYBBP04839 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CYBBP04839 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CYBBP04839 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CYBBP04839 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CYBBP04839 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CYBBP04839 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CYBBP04839 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CYBBP04839 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CYBBP04839 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CYBBP04839 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CYBBP04839 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
CYBBP04839 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CYBBP04839 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CYBBP04839 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CYBBP04839 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CYBBP04839 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
CYBBP04839 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CYBBP04839 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CYBBP04839 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CYBBP04839 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CYBBP04839 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CYBBP04839 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CYBBP04839 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CYBBP04839 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
CYBBP04839 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CYBBP04839 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CYBBP04839 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CYBBP04839 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CYBBP04839 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CYBBP04839 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CYBBP04839 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CYBBP04839 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CYBBP04839 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CYBBP04839 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CYBBP04839 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CYBBP04839 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CYBBP04839 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CYBBP04839 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CYBBP04839 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CYBBP04839 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CYBBP04839 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CYBBP04839 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CYBBP04839 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
CYBBP04839 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
CYBBP04839 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CYBBP04839 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CYBBP04839 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CYBBP04839 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CYBBP04839 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CYBBP04839 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CYBBP04839 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CYBBP04839 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CYBBP04839 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CYBBP04839 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CYBBP04839 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CYBBP04839 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CYBBP04839 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CYBBP04839 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CYBBP04839 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CYBBP04839 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CYBBP04839 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CYBBP04839 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CYBBP04839 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CYBBP04839 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CYBBP04839 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CYBBP04839 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CYBBP04839 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CYBBP04839 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CYBBP04839 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CYBBP04839 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CYBBP04839 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CYBBP04839 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
CYBBP04839 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CYBBP04839 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.2 ms