Protein–RNA interactions for Protein: O43365

HOXA3, Homeobox protein Hox-A3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 443 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA3O43365 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
HOXA3O43365 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
HOXA3O43365 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
HOXA3O43365 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
HOXA3O43365 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
HOXA3O43365 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
HOXA3O43365 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
HOXA3O43365 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
HOXA3O43365 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
HOXA3O43365 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
HOXA3O43365 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
HOXA3O43365 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
HOXA3O43365 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
HOXA3O43365 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
HOXA3O43365 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
HOXA3O43365 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
HOXA3O43365 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
HOXA3O43365 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
HOXA3O43365 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
HOXA3O43365 ME2-201ENST00000321341 9415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
HOXA3O43365 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
HOXA3O43365 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
HOXA3O43365 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
HOXA3O43365 DAB2IP-201ENST00000259371 5469 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
HOXA3O43365 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
HOXA3O43365 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
HOXA3O43365 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
HOXA3O43365 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
HOXA3O43365 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
HOXA3O43365 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
HOXA3O43365 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC13.41□□□□□ -0.26
HOXA3O43365 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
HOXA3O43365 COX20P2-201ENST00000452636 358 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
HOXA3O43365 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
HOXA3O43365 AL110118.2-203ENST00000557574 554 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.41□□□□□ -0.26
HOXA3O43365 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
HOXA3O43365 AC141424.1-203ENST00000599026 887 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
HOXA3O43365 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
HOXA3O43365 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
HOXA3O43365 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
HOXA3O43365 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
HOXA3O43365 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
HOXA3O43365 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
HOXA3O43365 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
HOXA3O43365 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
HOXA3O43365 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
HOXA3O43365 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
HOXA3O43365 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
HOXA3O43365 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
HOXA3O43365 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
HOXA3O43365 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
HOXA3O43365 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
HOXA3O43365 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
HOXA3O43365 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
HOXA3O43365 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
HOXA3O43365 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
HOXA3O43365 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
HOXA3O43365 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
HOXA3O43365 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
HOXA3O43365 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
HOXA3O43365 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC13.4□□□□□ -0.26
HOXA3O43365 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
HOXA3O43365 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
HOXA3O43365 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
HOXA3O43365 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
HOXA3O43365 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
HOXA3O43365 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
HOXA3O43365 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
HOXA3O43365 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
HOXA3O43365 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
HOXA3O43365 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
HOXA3O43365 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
HOXA3O43365 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
HOXA3O43365 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
HOXA3O43365 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
HOXA3O43365 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
HOXA3O43365 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
HOXA3O43365 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
HOXA3O43365 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
HOXA3O43365 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
HOXA3O43365 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
HOXA3O43365 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
HOXA3O43365 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
HOXA3O43365 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
HOXA3O43365 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC13.4□□□□□ -0.26
HOXA3O43365 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
HOXA3O43365 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
HOXA3O43365 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
HOXA3O43365 AC004846.2-201ENST00000556578 777 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
HOXA3O43365 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
HOXA3O43365 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
HOXA3O43365 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
HOXA3O43365 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
HOXA3O43365 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
HOXA3O43365 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC13.4□□□□□ -0.26
HOXA3O43365 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
HOXA3O43365 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
HOXA3O43365 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
HOXA3O43365 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
HOXA3O43365 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
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