Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0I4

Stx17, Syntaxin-17, mousemouse

Predictions only

Length 301 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stx17Q9D0I4 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Stx17Q9D0I4 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Stx17Q9D0I4 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Stx17Q9D0I4 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Stx17Q9D0I4 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Stx17Q9D0I4 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Stx17Q9D0I4 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Stx17Q9D0I4 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Stx17Q9D0I4 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Stx17Q9D0I4 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Stx17Q9D0I4 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Stx17Q9D0I4 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Stx17Q9D0I4 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Stx17Q9D0I4 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Stx17Q9D0I4 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Stx17Q9D0I4 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Stx17Q9D0I4 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Stx17Q9D0I4 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Stx17Q9D0I4 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Stx17Q9D0I4 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Stx17Q9D0I4 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Stx17Q9D0I4 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Stx17Q9D0I4 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Stx17Q9D0I4 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Stx17Q9D0I4 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Stx17Q9D0I4 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Stx17Q9D0I4 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Stx17Q9D0I4 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Stx17Q9D0I4 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Stx17Q9D0I4 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Stx17Q9D0I4 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Stx17Q9D0I4 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Stx17Q9D0I4 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Stx17Q9D0I4 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Stx17Q9D0I4 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Stx17Q9D0I4 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Stx17Q9D0I4 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Stx17Q9D0I4 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Stx17Q9D0I4 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Stx17Q9D0I4 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Stx17Q9D0I4 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Stx17Q9D0I4 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Stx17Q9D0I4 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Stx17Q9D0I4 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Stx17Q9D0I4 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Stx17Q9D0I4 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Stx17Q9D0I4 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Stx17Q9D0I4 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Stx17Q9D0I4 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Stx17Q9D0I4 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Stx17Q9D0I4 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Stx17Q9D0I4 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Stx17Q9D0I4 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Stx17Q9D0I4 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Stx17Q9D0I4 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Stx17Q9D0I4 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Stx17Q9D0I4 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Stx17Q9D0I4 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Stx17Q9D0I4 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Stx17Q9D0I4 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Stx17Q9D0I4 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Stx17Q9D0I4 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Stx17Q9D0I4 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Stx17Q9D0I4 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Stx17Q9D0I4 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Stx17Q9D0I4 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Stx17Q9D0I4 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Stx17Q9D0I4 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Stx17Q9D0I4 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Stx17Q9D0I4 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Stx17Q9D0I4 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Stx17Q9D0I4 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Stx17Q9D0I4 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Stx17Q9D0I4 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Stx17Q9D0I4 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Stx17Q9D0I4 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Stx17Q9D0I4 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Stx17Q9D0I4 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Stx17Q9D0I4 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Stx17Q9D0I4 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Stx17Q9D0I4 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Stx17Q9D0I4 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Stx17Q9D0I4 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Stx17Q9D0I4 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Stx17Q9D0I4 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Stx17Q9D0I4 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Stx17Q9D0I4 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Stx17Q9D0I4 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Stx17Q9D0I4 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Stx17Q9D0I4 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Stx17Q9D0I4 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Stx17Q9D0I4 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Stx17Q9D0I4 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Stx17Q9D0I4 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Stx17Q9D0I4 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Stx17Q9D0I4 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Stx17Q9D0I4 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Stx17Q9D0I4 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Stx17Q9D0I4 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Stx17Q9D0I4 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.1 ms