Protein–RNA interactions for Protein: Q9BWF3

RBM4, RNA-binding protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBM4Q9BWF3 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
RBM4Q9BWF3 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RBM4Q9BWF3 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RBM4Q9BWF3 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RBM4Q9BWF3 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RBM4Q9BWF3 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RBM4Q9BWF3 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RBM4Q9BWF3 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RBM4Q9BWF3 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RBM4Q9BWF3 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RBM4Q9BWF3 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RBM4Q9BWF3 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
RBM4Q9BWF3 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RBM4Q9BWF3 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RBM4Q9BWF3 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RBM4Q9BWF3 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RBM4Q9BWF3 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RBM4Q9BWF3 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RBM4Q9BWF3 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RBM4Q9BWF3 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RBM4Q9BWF3 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RBM4Q9BWF3 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RBM4Q9BWF3 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RBM4Q9BWF3 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RBM4Q9BWF3 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RBM4Q9BWF3 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RBM4Q9BWF3 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RBM4Q9BWF3 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RBM4Q9BWF3 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RBM4Q9BWF3 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RBM4Q9BWF3 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RBM4Q9BWF3 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RBM4Q9BWF3 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RBM4Q9BWF3 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RBM4Q9BWF3 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RBM4Q9BWF3 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RBM4Q9BWF3 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RBM4Q9BWF3 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RBM4Q9BWF3 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
RBM4Q9BWF3 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
RBM4Q9BWF3 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RBM4Q9BWF3 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RBM4Q9BWF3 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RBM4Q9BWF3 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RBM4Q9BWF3 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RBM4Q9BWF3 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RBM4Q9BWF3 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RBM4Q9BWF3 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RBM4Q9BWF3 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RBM4Q9BWF3 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RBM4Q9BWF3 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RBM4Q9BWF3 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RBM4Q9BWF3 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RBM4Q9BWF3 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RBM4Q9BWF3 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
RBM4Q9BWF3 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RBM4Q9BWF3 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RBM4Q9BWF3 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RBM4Q9BWF3 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RBM4Q9BWF3 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RBM4Q9BWF3 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RBM4Q9BWF3 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RBM4Q9BWF3 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RBM4Q9BWF3 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RBM4Q9BWF3 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RBM4Q9BWF3 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RBM4Q9BWF3 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RBM4Q9BWF3 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RBM4Q9BWF3 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RBM4Q9BWF3 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RBM4Q9BWF3 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RBM4Q9BWF3 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RBM4Q9BWF3 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RBM4Q9BWF3 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RBM4Q9BWF3 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RBM4Q9BWF3 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RBM4Q9BWF3 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RBM4Q9BWF3 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RBM4Q9BWF3 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RBM4Q9BWF3 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RBM4Q9BWF3 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RBM4Q9BWF3 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RBM4Q9BWF3 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RBM4Q9BWF3 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RBM4Q9BWF3 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RBM4Q9BWF3 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RBM4Q9BWF3 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RBM4Q9BWF3 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RBM4Q9BWF3 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RBM4Q9BWF3 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RBM4Q9BWF3 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RBM4Q9BWF3 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
RBM4Q9BWF3 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RBM4Q9BWF3 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RBM4Q9BWF3 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RBM4Q9BWF3 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RBM4Q9BWF3 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RBM4Q9BWF3 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RBM4Q9BWF3 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RBM4Q9BWF3 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.6 ms