Protein–RNA interactions for Protein: Q96A19

CCDC102A, Coiled-coil domain-containing protein 102A, humanhuman

Predictions only

Length 550 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC102AQ96A19 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
CCDC102AQ96A19 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
CCDC102AQ96A19 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
CCDC102AQ96A19 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
CCDC102AQ96A19 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC28.44■■■□□ 2.14
CCDC102AQ96A19 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
CCDC102AQ96A19 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
CCDC102AQ96A19 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
CCDC102AQ96A19 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
CCDC102AQ96A19 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
CCDC102AQ96A19 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
CCDC102AQ96A19 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC28.42■■■□□ 2.14
CCDC102AQ96A19 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
CCDC102AQ96A19 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC28.41■■■□□ 2.14
CCDC102AQ96A19 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC28.41■■■□□ 2.14
CCDC102AQ96A19 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
CCDC102AQ96A19 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
CCDC102AQ96A19 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
CCDC102AQ96A19 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
CCDC102AQ96A19 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC28.4■■■□□ 2.14
CCDC102AQ96A19 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
CCDC102AQ96A19 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
CCDC102AQ96A19 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
CCDC102AQ96A19 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
CCDC102AQ96A19 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.13
CCDC102AQ96A19 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
CCDC102AQ96A19 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
CCDC102AQ96A19 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
CCDC102AQ96A19 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
CCDC102AQ96A19 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
CCDC102AQ96A19 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
CCDC102AQ96A19 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
CCDC102AQ96A19 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC28.36■■■□□ 2.13
CCDC102AQ96A19 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
CCDC102AQ96A19 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
CCDC102AQ96A19 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
CCDC102AQ96A19 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
CCDC102AQ96A19 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC28.36■■■□□ 2.13
CCDC102AQ96A19 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
CCDC102AQ96A19 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
CCDC102AQ96A19 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
CCDC102AQ96A19 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
CCDC102AQ96A19 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
CCDC102AQ96A19 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
CCDC102AQ96A19 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
CCDC102AQ96A19 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
CCDC102AQ96A19 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
CCDC102AQ96A19 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
CCDC102AQ96A19 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
CCDC102AQ96A19 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
CCDC102AQ96A19 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
CCDC102AQ96A19 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CCDC102AQ96A19 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CCDC102AQ96A19 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
CCDC102AQ96A19 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CCDC102AQ96A19 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CCDC102AQ96A19 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CCDC102AQ96A19 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CCDC102AQ96A19 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CCDC102AQ96A19 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
CCDC102AQ96A19 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
CCDC102AQ96A19 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
CCDC102AQ96A19 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
CCDC102AQ96A19 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
CCDC102AQ96A19 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
CCDC102AQ96A19 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
CCDC102AQ96A19 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
CCDC102AQ96A19 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
CCDC102AQ96A19 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
CCDC102AQ96A19 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
CCDC102AQ96A19 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
CCDC102AQ96A19 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
CCDC102AQ96A19 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
CCDC102AQ96A19 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
CCDC102AQ96A19 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
CCDC102AQ96A19 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
CCDC102AQ96A19 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
CCDC102AQ96A19 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
CCDC102AQ96A19 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
CCDC102AQ96A19 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
CCDC102AQ96A19 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CCDC102AQ96A19 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CCDC102AQ96A19 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CCDC102AQ96A19 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
CCDC102AQ96A19 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CCDC102AQ96A19 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
CCDC102AQ96A19 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
CCDC102AQ96A19 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
CCDC102AQ96A19 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
CCDC102AQ96A19 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
CCDC102AQ96A19 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
CCDC102AQ96A19 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
CCDC102AQ96A19 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
CCDC102AQ96A19 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.12
CCDC102AQ96A19 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
CCDC102AQ96A19 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
CCDC102AQ96A19 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
CCDC102AQ96A19 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
CCDC102AQ96A19 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
CCDC102AQ96A19 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.2 ms