Protein–RNA interactions for Protein: Q8CCH2

Nhlrc3, NHL repeat-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nhlrc3Q8CCH2 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nhlrc3Q8CCH2 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nhlrc3Q8CCH2 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Nhlrc3Q8CCH2 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nhlrc3Q8CCH2 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nhlrc3Q8CCH2 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nhlrc3Q8CCH2 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nhlrc3Q8CCH2 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nhlrc3Q8CCH2 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nhlrc3Q8CCH2 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nhlrc3Q8CCH2 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nhlrc3Q8CCH2 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nhlrc3Q8CCH2 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nhlrc3Q8CCH2 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nhlrc3Q8CCH2 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nhlrc3Q8CCH2 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Nhlrc3Q8CCH2 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nhlrc3Q8CCH2 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nhlrc3Q8CCH2 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Nhlrc3Q8CCH2 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nhlrc3Q8CCH2 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nhlrc3Q8CCH2 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nhlrc3Q8CCH2 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nhlrc3Q8CCH2 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nhlrc3Q8CCH2 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nhlrc3Q8CCH2 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nhlrc3Q8CCH2 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nhlrc3Q8CCH2 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nhlrc3Q8CCH2 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nhlrc3Q8CCH2 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nhlrc3Q8CCH2 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nhlrc3Q8CCH2 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nhlrc3Q8CCH2 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nhlrc3Q8CCH2 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nhlrc3Q8CCH2 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nhlrc3Q8CCH2 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nhlrc3Q8CCH2 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Nhlrc3Q8CCH2 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nhlrc3Q8CCH2 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nhlrc3Q8CCH2 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nhlrc3Q8CCH2 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nhlrc3Q8CCH2 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nhlrc3Q8CCH2 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nhlrc3Q8CCH2 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nhlrc3Q8CCH2 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nhlrc3Q8CCH2 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nhlrc3Q8CCH2 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nhlrc3Q8CCH2 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nhlrc3Q8CCH2 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nhlrc3Q8CCH2 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nhlrc3Q8CCH2 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nhlrc3Q8CCH2 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nhlrc3Q8CCH2 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nhlrc3Q8CCH2 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nhlrc3Q8CCH2 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nhlrc3Q8CCH2 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nhlrc3Q8CCH2 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nhlrc3Q8CCH2 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nhlrc3Q8CCH2 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nhlrc3Q8CCH2 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Nhlrc3Q8CCH2 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Nhlrc3Q8CCH2 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Nhlrc3Q8CCH2 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Nhlrc3Q8CCH2 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Nhlrc3Q8CCH2 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Nhlrc3Q8CCH2 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Nhlrc3Q8CCH2 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Nhlrc3Q8CCH2 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nhlrc3Q8CCH2 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nhlrc3Q8CCH2 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nhlrc3Q8CCH2 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nhlrc3Q8CCH2 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nhlrc3Q8CCH2 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nhlrc3Q8CCH2 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nhlrc3Q8CCH2 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nhlrc3Q8CCH2 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nhlrc3Q8CCH2 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nhlrc3Q8CCH2 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nhlrc3Q8CCH2 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nhlrc3Q8CCH2 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nhlrc3Q8CCH2 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nhlrc3Q8CCH2 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nhlrc3Q8CCH2 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nhlrc3Q8CCH2 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nhlrc3Q8CCH2 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nhlrc3Q8CCH2 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nhlrc3Q8CCH2 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nhlrc3Q8CCH2 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nhlrc3Q8CCH2 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nhlrc3Q8CCH2 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nhlrc3Q8CCH2 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nhlrc3Q8CCH2 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nhlrc3Q8CCH2 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nhlrc3Q8CCH2 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Nhlrc3Q8CCH2 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nhlrc3Q8CCH2 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nhlrc3Q8CCH2 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nhlrc3Q8CCH2 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nhlrc3Q8CCH2 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nhlrc3Q8CCH2 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms