Protein–RNA interactions for Protein: Q6KB66

KRT80, Keratin, type II cytoskeletal 80, humanhuman

Predictions only

Length 452 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT80Q6KB66 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
KRT80Q6KB66 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
KRT80Q6KB66 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
KRT80Q6KB66 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
KRT80Q6KB66 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
KRT80Q6KB66 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
KRT80Q6KB66 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
KRT80Q6KB66 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
KRT80Q6KB66 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
KRT80Q6KB66 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
KRT80Q6KB66 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
KRT80Q6KB66 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
KRT80Q6KB66 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
KRT80Q6KB66 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
KRT80Q6KB66 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
KRT80Q6KB66 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
KRT80Q6KB66 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
KRT80Q6KB66 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
KRT80Q6KB66 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
KRT80Q6KB66 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
KRT80Q6KB66 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
KRT80Q6KB66 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
KRT80Q6KB66 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
KRT80Q6KB66 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
KRT80Q6KB66 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
KRT80Q6KB66 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
KRT80Q6KB66 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
KRT80Q6KB66 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
KRT80Q6KB66 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
KRT80Q6KB66 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
KRT80Q6KB66 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
KRT80Q6KB66 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
KRT80Q6KB66 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
KRT80Q6KB66 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
KRT80Q6KB66 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
KRT80Q6KB66 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
KRT80Q6KB66 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
KRT80Q6KB66 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
KRT80Q6KB66 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
KRT80Q6KB66 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
KRT80Q6KB66 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
KRT80Q6KB66 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
KRT80Q6KB66 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
KRT80Q6KB66 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
KRT80Q6KB66 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
KRT80Q6KB66 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
KRT80Q6KB66 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
KRT80Q6KB66 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
KRT80Q6KB66 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
KRT80Q6KB66 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
KRT80Q6KB66 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
KRT80Q6KB66 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
KRT80Q6KB66 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
KRT80Q6KB66 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
KRT80Q6KB66 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
KRT80Q6KB66 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
KRT80Q6KB66 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
KRT80Q6KB66 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
KRT80Q6KB66 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
KRT80Q6KB66 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
KRT80Q6KB66 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
KRT80Q6KB66 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
KRT80Q6KB66 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
KRT80Q6KB66 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
KRT80Q6KB66 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
KRT80Q6KB66 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
KRT80Q6KB66 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
KRT80Q6KB66 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
KRT80Q6KB66 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
KRT80Q6KB66 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
KRT80Q6KB66 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
KRT80Q6KB66 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
KRT80Q6KB66 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
KRT80Q6KB66 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
KRT80Q6KB66 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
KRT80Q6KB66 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
KRT80Q6KB66 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
KRT80Q6KB66 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
KRT80Q6KB66 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
KRT80Q6KB66 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
KRT80Q6KB66 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
KRT80Q6KB66 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
KRT80Q6KB66 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
KRT80Q6KB66 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
KRT80Q6KB66 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
KRT80Q6KB66 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
KRT80Q6KB66 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
KRT80Q6KB66 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
KRT80Q6KB66 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
KRT80Q6KB66 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
KRT80Q6KB66 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
KRT80Q6KB66 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
KRT80Q6KB66 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
KRT80Q6KB66 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
KRT80Q6KB66 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
KRT80Q6KB66 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
KRT80Q6KB66 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
KRT80Q6KB66 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
KRT80Q6KB66 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
KRT80Q6KB66 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36 ms