Protein–RNA interactions for Protein: Q5YKI7

GGNBP1, Putative gametogenetin-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 109 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGNBP1Q5YKI7 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
GGNBP1Q5YKI7 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
GGNBP1Q5YKI7 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
GGNBP1Q5YKI7 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
GGNBP1Q5YKI7 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
GGNBP1Q5YKI7 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
GGNBP1Q5YKI7 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC19.6■□□□□ 0.73
GGNBP1Q5YKI7 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
GGNBP1Q5YKI7 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
GGNBP1Q5YKI7 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
GGNBP1Q5YKI7 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
GGNBP1Q5YKI7 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
GGNBP1Q5YKI7 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
GGNBP1Q5YKI7 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
GGNBP1Q5YKI7 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
GGNBP1Q5YKI7 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
GGNBP1Q5YKI7 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
GGNBP1Q5YKI7 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
GGNBP1Q5YKI7 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
GGNBP1Q5YKI7 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
GGNBP1Q5YKI7 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
GGNBP1Q5YKI7 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
GGNBP1Q5YKI7 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
GGNBP1Q5YKI7 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
GGNBP1Q5YKI7 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
GGNBP1Q5YKI7 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
GGNBP1Q5YKI7 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
GGNBP1Q5YKI7 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
GGNBP1Q5YKI7 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
GGNBP1Q5YKI7 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
GGNBP1Q5YKI7 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
GGNBP1Q5YKI7 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
GGNBP1Q5YKI7 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
GGNBP1Q5YKI7 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
GGNBP1Q5YKI7 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
GGNBP1Q5YKI7 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
GGNBP1Q5YKI7 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
GGNBP1Q5YKI7 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
GGNBP1Q5YKI7 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
GGNBP1Q5YKI7 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
GGNBP1Q5YKI7 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
GGNBP1Q5YKI7 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
GGNBP1Q5YKI7 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
GGNBP1Q5YKI7 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
GGNBP1Q5YKI7 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
GGNBP1Q5YKI7 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
GGNBP1Q5YKI7 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
GGNBP1Q5YKI7 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
GGNBP1Q5YKI7 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
GGNBP1Q5YKI7 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
GGNBP1Q5YKI7 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
GGNBP1Q5YKI7 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
GGNBP1Q5YKI7 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
GGNBP1Q5YKI7 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
GGNBP1Q5YKI7 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
GGNBP1Q5YKI7 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
GGNBP1Q5YKI7 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
GGNBP1Q5YKI7 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
GGNBP1Q5YKI7 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
GGNBP1Q5YKI7 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
GGNBP1Q5YKI7 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
GGNBP1Q5YKI7 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
GGNBP1Q5YKI7 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
GGNBP1Q5YKI7 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
GGNBP1Q5YKI7 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
GGNBP1Q5YKI7 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
GGNBP1Q5YKI7 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
GGNBP1Q5YKI7 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
GGNBP1Q5YKI7 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
GGNBP1Q5YKI7 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
GGNBP1Q5YKI7 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
GGNBP1Q5YKI7 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
GGNBP1Q5YKI7 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
GGNBP1Q5YKI7 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
GGNBP1Q5YKI7 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
GGNBP1Q5YKI7 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
GGNBP1Q5YKI7 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
GGNBP1Q5YKI7 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
GGNBP1Q5YKI7 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
GGNBP1Q5YKI7 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
GGNBP1Q5YKI7 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
GGNBP1Q5YKI7 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
GGNBP1Q5YKI7 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
GGNBP1Q5YKI7 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
GGNBP1Q5YKI7 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
GGNBP1Q5YKI7 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
GGNBP1Q5YKI7 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
GGNBP1Q5YKI7 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
GGNBP1Q5YKI7 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
GGNBP1Q5YKI7 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
GGNBP1Q5YKI7 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
GGNBP1Q5YKI7 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
GGNBP1Q5YKI7 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
GGNBP1Q5YKI7 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
GGNBP1Q5YKI7 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
GGNBP1Q5YKI7 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
GGNBP1Q5YKI7 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
GGNBP1Q5YKI7 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
GGNBP1Q5YKI7 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
GGNBP1Q5YKI7 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 147 ms