Protein–RNA interactions for Protein: Q5YKI7

GGNBP1, Putative gametogenetin-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 109 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGNBP1Q5YKI7 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
GGNBP1Q5YKI7 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
GGNBP1Q5YKI7 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
GGNBP1Q5YKI7 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
GGNBP1Q5YKI7 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
GGNBP1Q5YKI7 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
GGNBP1Q5YKI7 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC19.6■□□□□ 0.73
GGNBP1Q5YKI7 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
GGNBP1Q5YKI7 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
GGNBP1Q5YKI7 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
GGNBP1Q5YKI7 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
GGNBP1Q5YKI7 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
GGNBP1Q5YKI7 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
GGNBP1Q5YKI7 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
GGNBP1Q5YKI7 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
GGNBP1Q5YKI7 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
GGNBP1Q5YKI7 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
GGNBP1Q5YKI7 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
GGNBP1Q5YKI7 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
GGNBP1Q5YKI7 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
GGNBP1Q5YKI7 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
GGNBP1Q5YKI7 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
GGNBP1Q5YKI7 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
GGNBP1Q5YKI7 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
GGNBP1Q5YKI7 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
GGNBP1Q5YKI7 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
GGNBP1Q5YKI7 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
GGNBP1Q5YKI7 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
GGNBP1Q5YKI7 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
GGNBP1Q5YKI7 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
GGNBP1Q5YKI7 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
GGNBP1Q5YKI7 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
GGNBP1Q5YKI7 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
GGNBP1Q5YKI7 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
GGNBP1Q5YKI7 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
GGNBP1Q5YKI7 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
GGNBP1Q5YKI7 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
GGNBP1Q5YKI7 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
GGNBP1Q5YKI7 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
GGNBP1Q5YKI7 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
GGNBP1Q5YKI7 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
GGNBP1Q5YKI7 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
GGNBP1Q5YKI7 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
GGNBP1Q5YKI7 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
GGNBP1Q5YKI7 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
GGNBP1Q5YKI7 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
GGNBP1Q5YKI7 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
GGNBP1Q5YKI7 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
GGNBP1Q5YKI7 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
GGNBP1Q5YKI7 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
GGNBP1Q5YKI7 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
GGNBP1Q5YKI7 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
GGNBP1Q5YKI7 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
GGNBP1Q5YKI7 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
GGNBP1Q5YKI7 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
GGNBP1Q5YKI7 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
GGNBP1Q5YKI7 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
GGNBP1Q5YKI7 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
GGNBP1Q5YKI7 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
GGNBP1Q5YKI7 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
GGNBP1Q5YKI7 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
GGNBP1Q5YKI7 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
GGNBP1Q5YKI7 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
GGNBP1Q5YKI7 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
GGNBP1Q5YKI7 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
GGNBP1Q5YKI7 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
GGNBP1Q5YKI7 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
GGNBP1Q5YKI7 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
GGNBP1Q5YKI7 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
GGNBP1Q5YKI7 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
GGNBP1Q5YKI7 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
GGNBP1Q5YKI7 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
GGNBP1Q5YKI7 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
GGNBP1Q5YKI7 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
GGNBP1Q5YKI7 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
GGNBP1Q5YKI7 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
GGNBP1Q5YKI7 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
GGNBP1Q5YKI7 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
GGNBP1Q5YKI7 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
GGNBP1Q5YKI7 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
GGNBP1Q5YKI7 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
GGNBP1Q5YKI7 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
GGNBP1Q5YKI7 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
GGNBP1Q5YKI7 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
GGNBP1Q5YKI7 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
GGNBP1Q5YKI7 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
GGNBP1Q5YKI7 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
GGNBP1Q5YKI7 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
GGNBP1Q5YKI7 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
GGNBP1Q5YKI7 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
GGNBP1Q5YKI7 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
GGNBP1Q5YKI7 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
GGNBP1Q5YKI7 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
GGNBP1Q5YKI7 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
GGNBP1Q5YKI7 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
GGNBP1Q5YKI7 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
GGNBP1Q5YKI7 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
GGNBP1Q5YKI7 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
GGNBP1Q5YKI7 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
GGNBP1Q5YKI7 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms