Protein–RNA interactions for Protein: Q5SUE8

Ankrd40, Ankyrin repeat domain-containing protein 40, mousemouse

Predictions only

Length 363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ankrd40Q5SUE8 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ankrd40Q5SUE8 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ankrd40Q5SUE8 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ankrd40Q5SUE8 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ankrd40Q5SUE8 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ankrd40Q5SUE8 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ankrd40Q5SUE8 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ankrd40Q5SUE8 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ankrd40Q5SUE8 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ankrd40Q5SUE8 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ankrd40Q5SUE8 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.39
Ankrd40Q5SUE8 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ankrd40Q5SUE8 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
Ankrd40Q5SUE8 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ankrd40Q5SUE8 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
Ankrd40Q5SUE8 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ankrd40Q5SUE8 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ankrd40Q5SUE8 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ankrd40Q5SUE8 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ankrd40Q5SUE8 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ankrd40Q5SUE8 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ankrd40Q5SUE8 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ankrd40Q5SUE8 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ankrd40Q5SUE8 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ankrd40Q5SUE8 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ankrd40Q5SUE8 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Ankrd40Q5SUE8 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ankrd40Q5SUE8 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ankrd40Q5SUE8 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ankrd40Q5SUE8 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ankrd40Q5SUE8 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ankrd40Q5SUE8 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ankrd40Q5SUE8 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ankrd40Q5SUE8 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ankrd40Q5SUE8 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ankrd40Q5SUE8 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ankrd40Q5SUE8 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ankrd40Q5SUE8 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ankrd40Q5SUE8 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ankrd40Q5SUE8 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ankrd40Q5SUE8 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ankrd40Q5SUE8 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ankrd40Q5SUE8 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ankrd40Q5SUE8 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ankrd40Q5SUE8 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ankrd40Q5SUE8 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ankrd40Q5SUE8 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ankrd40Q5SUE8 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ankrd40Q5SUE8 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ankrd40Q5SUE8 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ankrd40Q5SUE8 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ankrd40Q5SUE8 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ankrd40Q5SUE8 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ankrd40Q5SUE8 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ankrd40Q5SUE8 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ankrd40Q5SUE8 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ankrd40Q5SUE8 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ankrd40Q5SUE8 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Ankrd40Q5SUE8 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ankrd40Q5SUE8 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ankrd40Q5SUE8 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ankrd40Q5SUE8 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ankrd40Q5SUE8 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ankrd40Q5SUE8 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ankrd40Q5SUE8 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ankrd40Q5SUE8 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ankrd40Q5SUE8 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ankrd40Q5SUE8 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ankrd40Q5SUE8 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ankrd40Q5SUE8 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ankrd40Q5SUE8 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ankrd40Q5SUE8 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ankrd40Q5SUE8 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Ankrd40Q5SUE8 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Ankrd40Q5SUE8 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Ankrd40Q5SUE8 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Ankrd40Q5SUE8 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Ankrd40Q5SUE8 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ankrd40Q5SUE8 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ankrd40Q5SUE8 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
Ankrd40Q5SUE8 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ankrd40Q5SUE8 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ankrd40Q5SUE8 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ankrd40Q5SUE8 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ankrd40Q5SUE8 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ankrd40Q5SUE8 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ankrd40Q5SUE8 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ankrd40Q5SUE8 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ankrd40Q5SUE8 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ankrd40Q5SUE8 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ankrd40Q5SUE8 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ankrd40Q5SUE8 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ankrd40Q5SUE8 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ankrd40Q5SUE8 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ankrd40Q5SUE8 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ankrd40Q5SUE8 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ankrd40Q5SUE8 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ankrd40Q5SUE8 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ankrd40Q5SUE8 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ankrd40Q5SUE8 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms