Protein–RNA interactions for Protein: Q5JTW2

CEP78, Centrosomal protein of 78 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 689 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP78Q5JTW2 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CEP78Q5JTW2 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CEP78Q5JTW2 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC21.29■■□□□ 1
CEP78Q5JTW2 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CEP78Q5JTW2 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
CEP78Q5JTW2 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CEP78Q5JTW2 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CEP78Q5JTW2 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CEP78Q5JTW2 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CEP78Q5JTW2 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CEP78Q5JTW2 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CEP78Q5JTW2 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CEP78Q5JTW2 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CEP78Q5JTW2 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CEP78Q5JTW2 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CEP78Q5JTW2 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CEP78Q5JTW2 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CEP78Q5JTW2 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CEP78Q5JTW2 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CEP78Q5JTW2 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CEP78Q5JTW2 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
CEP78Q5JTW2 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CEP78Q5JTW2 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CEP78Q5JTW2 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CEP78Q5JTW2 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CEP78Q5JTW2 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CEP78Q5JTW2 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CEP78Q5JTW2 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CEP78Q5JTW2 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CEP78Q5JTW2 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CEP78Q5JTW2 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CEP78Q5JTW2 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CEP78Q5JTW2 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CEP78Q5JTW2 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CEP78Q5JTW2 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CEP78Q5JTW2 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CEP78Q5JTW2 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CEP78Q5JTW2 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CEP78Q5JTW2 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CEP78Q5JTW2 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CEP78Q5JTW2 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CEP78Q5JTW2 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CEP78Q5JTW2 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CEP78Q5JTW2 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CEP78Q5JTW2 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CEP78Q5JTW2 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CEP78Q5JTW2 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CEP78Q5JTW2 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CEP78Q5JTW2 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CEP78Q5JTW2 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
CEP78Q5JTW2 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CEP78Q5JTW2 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
CEP78Q5JTW2 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CEP78Q5JTW2 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CEP78Q5JTW2 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
CEP78Q5JTW2 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CEP78Q5JTW2 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CEP78Q5JTW2 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CEP78Q5JTW2 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CEP78Q5JTW2 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CEP78Q5JTW2 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CEP78Q5JTW2 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
CEP78Q5JTW2 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CEP78Q5JTW2 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CEP78Q5JTW2 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
CEP78Q5JTW2 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CEP78Q5JTW2 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CEP78Q5JTW2 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CEP78Q5JTW2 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CEP78Q5JTW2 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CEP78Q5JTW2 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CEP78Q5JTW2 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
CEP78Q5JTW2 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CEP78Q5JTW2 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CEP78Q5JTW2 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CEP78Q5JTW2 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CEP78Q5JTW2 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CEP78Q5JTW2 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CEP78Q5JTW2 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CEP78Q5JTW2 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CEP78Q5JTW2 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CEP78Q5JTW2 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CEP78Q5JTW2 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CEP78Q5JTW2 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CEP78Q5JTW2 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CEP78Q5JTW2 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
CEP78Q5JTW2 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CEP78Q5JTW2 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CEP78Q5JTW2 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CEP78Q5JTW2 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CEP78Q5JTW2 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
CEP78Q5JTW2 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CEP78Q5JTW2 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CEP78Q5JTW2 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CEP78Q5JTW2 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CEP78Q5JTW2 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CEP78Q5JTW2 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CEP78Q5JTW2 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CEP78Q5JTW2 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CEP78Q5JTW2 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.6 ms