Protein–RNA interactions for Protein: Q2MJR0

SPRED3, Sprouty-related, EVH1 domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 410 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPRED3Q2MJR0 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SPRED3Q2MJR0 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SPRED3Q2MJR0 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SPRED3Q2MJR0 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SPRED3Q2MJR0 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SPRED3Q2MJR0 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SPRED3Q2MJR0 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SPRED3Q2MJR0 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SPRED3Q2MJR0 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SPRED3Q2MJR0 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SPRED3Q2MJR0 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SPRED3Q2MJR0 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SPRED3Q2MJR0 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SPRED3Q2MJR0 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SPRED3Q2MJR0 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SPRED3Q2MJR0 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SPRED3Q2MJR0 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SPRED3Q2MJR0 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SPRED3Q2MJR0 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SPRED3Q2MJR0 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SPRED3Q2MJR0 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SPRED3Q2MJR0 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SPRED3Q2MJR0 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SPRED3Q2MJR0 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SPRED3Q2MJR0 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SPRED3Q2MJR0 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SPRED3Q2MJR0 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SPRED3Q2MJR0 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SPRED3Q2MJR0 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SPRED3Q2MJR0 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SPRED3Q2MJR0 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SPRED3Q2MJR0 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SPRED3Q2MJR0 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SPRED3Q2MJR0 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SPRED3Q2MJR0 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SPRED3Q2MJR0 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SPRED3Q2MJR0 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SPRED3Q2MJR0 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SPRED3Q2MJR0 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SPRED3Q2MJR0 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SPRED3Q2MJR0 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SPRED3Q2MJR0 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SPRED3Q2MJR0 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SPRED3Q2MJR0 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SPRED3Q2MJR0 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SPRED3Q2MJR0 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SPRED3Q2MJR0 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
SPRED3Q2MJR0 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SPRED3Q2MJR0 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
SPRED3Q2MJR0 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SPRED3Q2MJR0 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SPRED3Q2MJR0 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SPRED3Q2MJR0 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
SPRED3Q2MJR0 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SPRED3Q2MJR0 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SPRED3Q2MJR0 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SPRED3Q2MJR0 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SPRED3Q2MJR0 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SPRED3Q2MJR0 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SPRED3Q2MJR0 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SPRED3Q2MJR0 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SPRED3Q2MJR0 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
SPRED3Q2MJR0 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
SPRED3Q2MJR0 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SPRED3Q2MJR0 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SPRED3Q2MJR0 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
SPRED3Q2MJR0 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
SPRED3Q2MJR0 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SPRED3Q2MJR0 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SPRED3Q2MJR0 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SPRED3Q2MJR0 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
SPRED3Q2MJR0 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SPRED3Q2MJR0 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SPRED3Q2MJR0 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SPRED3Q2MJR0 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SPRED3Q2MJR0 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SPRED3Q2MJR0 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SPRED3Q2MJR0 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SPRED3Q2MJR0 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SPRED3Q2MJR0 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SPRED3Q2MJR0 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SPRED3Q2MJR0 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SPRED3Q2MJR0 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SPRED3Q2MJR0 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
SPRED3Q2MJR0 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SPRED3Q2MJR0 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SPRED3Q2MJR0 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SPRED3Q2MJR0 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SPRED3Q2MJR0 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SPRED3Q2MJR0 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SPRED3Q2MJR0 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SPRED3Q2MJR0 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SPRED3Q2MJR0 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SPRED3Q2MJR0 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SPRED3Q2MJR0 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SPRED3Q2MJR0 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SPRED3Q2MJR0 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SPRED3Q2MJR0 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SPRED3Q2MJR0 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SPRED3Q2MJR0 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.3 ms