Protein–RNA interactions for Protein: Q12483

SNF8, Vacuolar-sorting protein SNF8, yeastyeast

Predictions only

Length 233 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SNF8Q12483 RPL7AYGL076C 735 nt5.71□□□□□ -1.5
SNF8Q12483 SRY1YKL218C 981 nt5.71□□□□□ -1.5
SNF8Q12483 RPL7BYPL198W 735 nt5.71□□□□□ -1.5
SNF8Q12483 NHA1YLR138W 2958 nt5.71□□□□□ -1.5
SNF8Q12483 RAD24YER173W 1980 nt5.71□□□□□ -1.5
SNF8Q12483 PYC1YGL062W 3537 nt5.7□□□□□ -1.5
SNF8Q12483 GUF1YLR289W 1938 nt5.7□□□□□ -1.5
SNF8Q12483 PHB1YGR132C 864 nt5.7□□□□□ -1.5
SNF8Q12483 YPL136WYPL136W 369 nt5.7□□□□□ -1.5
SNF8Q12483 MCM3YEL032W 2916 nt5.7□□□□□ -1.5
SNF8Q12483 LDB19YOR322C 2457 nt5.69□□□□□ -1.5
SNF8Q12483 YFL042CYFL042C 2025 nt5.69□□□□□ -1.5
SNF8Q12483 QRI5YLR204W 336 nt5.69□□□□□ -1.5
SNF8Q12483 RPS28AYOR167C 204 nt5.69□□□□□ -1.5
SNF8Q12483 XBP1YIL101C 1944 nt5.68□□□□□ -1.5
SNF8Q12483 RPS5YJR123W 678 nt5.68□□□□□ -1.5
SNF8Q12483 TAL1YLR354C 1008 nt5.68□□□□□ -1.5
SNF8Q12483 HAP3YBL021C 435 nt5.68□□□□□ -1.5
SNF8Q12483 YNL042W-BYNL042W-B 258 nt5.68□□□□□ -1.5
SNF8Q12483 FSF1YOR271C 984 nt5.68□□□□□ -1.5
SNF8Q12483 IRS4YKR019C 1848 nt5.68□□□□□ -1.5
SNF8Q12483 GAT1YFL021W 1533 nt5.68□□□□□ -1.5
SNF8Q12483 MSN2YMR037C 2115 nt5.68□□□□□ -1.5
SNF8Q12483 EFT2YDR385W 2529 nt5.68□□□□□ -1.5
SNF8Q12483 EFT1YOR133W 2529 nt5.68□□□□□ -1.5
SNF8Q12483 IMA2YOL157C 1770 nt5.67□□□□□ -1.5
SNF8Q12483 LAG2YOL025W 1983 nt5.67□□□□□ -1.5
SNF8Q12483 YPL277CYPL277C 1464 nt5.67□□□□□ -1.5
SNF8Q12483 RME1YGR044C 903 nt5.67□□□□□ -1.5
SNF8Q12483 YJU3YKL094W 942 nt5.67□□□□□ -1.5
SNF8Q12483 RSC2YLR357W 2670 nt5.67□□□□□ -1.5
SNF8Q12483 HAP2YGL237C 798 nt5.66□□□□□ -1.5
SNF8Q12483 DOT5YIL010W 648 nt5.66□□□□□ -1.5
SNF8Q12483 YNL097W-AYNL097W-A 156 nt5.66□□□□□ -1.5
SNF8Q12483 CWC27YPL064C 906 nt5.66□□□□□ -1.5
SNF8Q12483 TFC6YDR362C 2019 nt5.65□□□□□ -1.5
SNF8Q12483 PAP2YOL115W 1755 nt5.65□□□□□ -1.5
SNF8Q12483 PAT1YCR077C 2391 nt5.65□□□□□ -1.5
SNF8Q12483 ACS1YAL054C 2142 nt5.65□□□□□ -1.5
SNF8Q12483 ESC8YOL017W 2145 nt5.65□□□□□ -1.5
SNF8Q12483 GIT1YCR098C 1557 nt5.65□□□□□ -1.5
SNF8Q12483 YDL129WYDL129W 876 nt5.65□□□□□ -1.5
SNF8Q12483 LEU5YHR002W 1074 nt5.65□□□□□ -1.5
SNF8Q12483 RPL10YLR075W 666 nt5.65□□□□□ -1.5
SNF8Q12483 RNH201YNL072W 924 nt5.65□□□□□ -1.5
SNF8Q12483 UTP4YDR324C 2331 nt5.65□□□□□ -1.51
SNF8Q12483 OPT1YJL212C 2400 nt5.65□□□□□ -1.51
SNF8Q12483 MRC1YCL061C 3291 nt5.64□□□□□ -1.51
SNF8Q12483 VHT1YGR065C 1782 nt5.64□□□□□ -1.51
SNF8Q12483 CLB1YGR108W 1416 nt5.64□□□□□ -1.51
SNF8Q12483 CLB2YPR119W 1476 nt5.64□□□□□ -1.51
SNF8Q12483 YPK2YMR104C 2034 nt5.64□□□□□ -1.51
SNF8Q12483 AFG1YEL052W 1530 nt5.64□□□□□ -1.51
SNF8Q12483 ERC1YHR032W 1746 nt5.63□□□□□ -1.51
SNF8Q12483 SUP19tS(UGA)E 82 nt5.63□□□□□ -1.51
SNF8Q12483 SUP17tS(UGA)I 82 nt5.63□□□□□ -1.51
SNF8Q12483 SUP16tS(UGA)P 82 nt5.63□□□□□ -1.51
SNF8Q12483 IME2YJL106W 1938 nt5.63□□□□□ -1.51
SNF8Q12483 SAC6YDR129C 1929 nt5.62□□□□□ -1.51
SNF8Q12483 RMD9YGL107C 1941 nt5.62□□□□□ -1.51
SNF8Q12483 YDR109CYDR109C 2148 nt5.62□□□□□ -1.51
SNF8Q12483 TRP5YGL026C 2124 nt5.62□□□□□ -1.51
SNF8Q12483 COX20YDR231C 618 nt5.62□□□□□ -1.51
SNF8Q12483 IMD1YAR073W 1212 nt5.62□□□□□ -1.51
SNF8Q12483 SCO2YBR024W 906 nt5.62□□□□□ -1.51
SNF8Q12483 HSP78YDR258C 2436 nt5.62□□□□□ -1.51
SNF8Q12483 KEX2YNL238W 2445 nt5.62□□□□□ -1.51
SNF8Q12483 FYV1YDR024W 486 nt5.61□□□□□ -1.51
SNF8Q12483 YER148W-AYER148W-A 579 nt5.61□□□□□ -1.51
SNF8Q12483 RPS2YGL123W 765 nt5.61□□□□□ -1.51
SNF8Q12483 GCV3YAL044C 513 nt5.61□□□□□ -1.51
SNF8Q12483 YLR184WYLR184W 348 nt5.61□□□□□ -1.51
SNF8Q12483 EMW1YNL313C 2715 nt5.61□□□□□ -1.51
SNF8Q12483 PKC1YBL105C 3456 nt5.61□□□□□ -1.51
SNF8Q12483 RPN7YPR108W 1290 nt5.61□□□□□ -1.51
SNF8Q12483 GPB2YAL056W 2643 nt5.61□□□□□ -1.51
SNF8Q12483 APE3YBR286W 1614 nt5.6□□□□□ -1.51
SNF8Q12483 GUA1YMR217W 1578 nt5.6□□□□□ -1.51
SNF8Q12483 DIA3YDL024C 1407 nt5.6□□□□□ -1.51
SNF8Q12483 TIM22YDL217C 624 nt5.6□□□□□ -1.51
SNF8Q12483 GAL83YER027C 1254 nt5.6□□□□□ -1.51
SNF8Q12483 STM1YLR150W 822 nt5.6□□□□□ -1.51
SNF8Q12483 NHP6BYBR089C-A 300 nt5.6□□□□□ -1.51
SNF8Q12483 TKL1YPR074C 2043 nt5.6□□□□□ -1.51
SNF8Q12483 BUD32YGR262C 786 nt5.59□□□□□ -1.51
SNF8Q12483 DJP1YIR004W 1299 nt5.59□□□□□ -1.51
SNF8Q12483 YLR157W-EYLR157W-E 165 nt5.59□□□□□ -1.51
SNF8Q12483 CIN4YMR138W 576 nt5.59□□□□□ -1.51
SNF8Q12483 YPR160C-AYPR160C-A 285 nt5.59□□□□□ -1.51
SNF8Q12483 YBR124WYBR124W 360 nt5.59□□□□□ -1.51
SNF8Q12483 ELP3YPL086C 1674 nt5.59□□□□□ -1.52
SNF8Q12483 ADE12YNL220W 1302 nt5.58□□□□□ -1.52
SNF8Q12483 YEH1YLL012W 1722 nt5.58□□□□□ -1.52
SNF8Q12483 UBC11YOR339C 471 nt5.58□□□□□ -1.52
SNF8Q12483 HST2YPL015C 1074 nt5.58□□□□□ -1.52
SNF8Q12483 RSA4YCR072C 1548 nt5.58□□□□□ -1.52
SNF8Q12483 SKS1YPL026C 1509 nt5.58□□□□□ -1.52
SNF8Q12483 IVY1YDR229W 1362 nt5.57□□□□□ -1.52
SNF8Q12483 YML082WYML082W 1950 nt5.57□□□□□ -1.52
SNF8Q12483 ATP1YBL099W 1638 nt5.57□□□□□ -1.52
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