Protein–RNA interactions for Protein: Q12378

RTR2, RNA polymerase II subunit B1 CTD phosphatase RTR2, yeastyeast

Predictions only

Length 196 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
RTR2Q12378 TAE1YBR261C 699 nt5.47□□□□□ -1.53
RTR2Q12378 UIP5YKR044W 1332 nt5.47□□□□□ -1.53
RTR2Q12378 GPD2YOL059W 1323 nt5.47□□□□□ -1.53
RTR2Q12378 YFR052C-AYFR052C-A 306 nt5.46□□□□□ -1.54
RTR2Q12378 MEH1YKR007W 555 nt5.46□□□□□ -1.54
RTR2Q12378 ERI1YPL096C-A 207 nt5.46□□□□□ -1.54
RTR2Q12378 YMC1YPR058W 924 nt5.46□□□□□ -1.54
RTR2Q12378 MSP1YGR028W 1089 nt5.45□□□□□ -1.54
RTR2Q12378 YHR213W-BYHR213W-B 300 nt5.45□□□□□ -1.54
RTR2Q12378 PHO86YJL117W 936 nt5.45□□□□□ -1.54
RTR2Q12378 YAR064WYAR064W 300 nt5.45□□□□□ -1.54
RTR2Q12378 SCS7YMR272C 1155 nt5.45□□□□□ -1.54
RTR2Q12378 FSF1YOR271C 984 nt5.45□□□□□ -1.54
RTR2Q12378 ATP1YBL099W 1638 nt5.45□□□□□ -1.54
RTR2Q12378 NSE5YML023C 1671 nt5.44□□□□□ -1.54
RTR2Q12378 SUP2tY(GUA)D 75 nt5.44□□□□□ -1.54
RTR2Q12378 SUP11tY(GUA)F1 75 nt5.44□□□□□ -1.54
RTR2Q12378 SUP6tY(GUA)F2 75 nt5.44□□□□□ -1.54
RTR2Q12378 SUP7tY(GUA)J1 75 nt5.44□□□□□ -1.54
RTR2Q12378 SUP4tY(GUA)J2 75 nt5.44□□□□□ -1.54
RTR2Q12378 SUP5tY(GUA)M1 75 nt5.44□□□□□ -1.54
RTR2Q12378 SUP8tY(GUA)M2 75 nt5.44□□□□□ -1.54
RTR2Q12378 SUP3tY(GUA)O 75 nt5.44□□□□□ -1.54
RTR2Q12378 TAL1YLR354C 1008 nt5.44□□□□□ -1.54
RTR2Q12378 RNH201YNL072W 924 nt5.44□□□□□ -1.54
RTR2Q12378 RGT1YKL038W 3513 nt5.43□□□□□ -1.54
RTR2Q12378 UBA1YKL210W 3075 nt5.43□□□□□ -1.54
RTR2Q12378 ASH1YKL185W 1767 nt5.43□□□□□ -1.54
RTR2Q12378 RPN11YFR004W 921 nt5.43□□□□□ -1.54
RTR2Q12378 ECM31YBR176W 939 nt5.43□□□□□ -1.54
RTR2Q12378 EXG1YLR300W 1347 nt5.43□□□□□ -1.54
RTR2Q12378 SNU71YGR013W 1863 nt5.43□□□□□ -1.54
RTR2Q12378 ZWF1YNL241C 1518 nt5.43□□□□□ -1.54
RTR2Q12378 CBK1YNL161W 2271 nt5.43□□□□□ -1.54
RTR2Q12378 CTF19YPL018W 1110 nt5.42□□□□□ -1.54
RTR2Q12378 ATP4YPL078C 735 nt5.42□□□□□ -1.54
RTR2Q12378 snR32snR32 188 nt5.42□□□□□ -1.54
RTR2Q12378 CCT8YJL008C 1707 nt5.42□□□□□ -1.54
RTR2Q12378 YTP1YNL237W 1380 nt5.42□□□□□ -1.54
RTR2Q12378 RFA1YAR007C 1866 nt5.41□□□□□ -1.54
RTR2Q12378 RET1YOR207C 3450 nt5.41□□□□□ -1.54
RTR2Q12378 TRP1YDR007W 675 nt5.41□□□□□ -1.54
RTR2Q12378 SIP2YGL208W 1248 nt5.41□□□□□ -1.54
RTR2Q12378 YMR119W-AYMR119W-A 375 nt5.41□□□□□ -1.54
RTR2Q12378 MRPL10YNL284C 969 nt5.41□□□□□ -1.54
RTR2Q12378 EIS1YMR031C 2532 nt5.41□□□□□ -1.54
RTR2Q12378 VTH1YIL173W 4650 nt5.4□□□□□ -1.54
RTR2Q12378 VTH2YJL222W 4650 nt5.4□□□□□ -1.54
RTR2Q12378 ENT2YLR206W 1842 nt5.4□□□□□ -1.54
RTR2Q12378 BUD32YGR262C 786 nt5.4□□□□□ -1.54
RTR2Q12378 YMR295CYMR295C 594 nt5.4□□□□□ -1.54
RTR2Q12378 RRN3YKL125W 1884 nt5.4□□□□□ -1.55
RTR2Q12378 TAH18YPR048W 1872 nt5.4□□□□□ -1.55
RTR2Q12378 ERC1YHR032W 1746 nt5.4□□□□□ -1.55
RTR2Q12378 BUD14YAR014C 2130 nt5.39□□□□□ -1.55
RTR2Q12378 ASF2YDL197C 1578 nt5.39□□□□□ -1.55
RTR2Q12378 IDP1YDL066W 1287 nt5.39□□□□□ -1.55
RTR2Q12378 YHC3YJL059W 1227 nt5.39□□□□□ -1.55
RTR2Q12378 YLR157W-EYLR157W-E 165 nt5.39□□□□□ -1.55
RTR2Q12378 YNR040WYNR040W 771 nt5.39□□□□□ -1.55
RTR2Q12378 CAM1YPL048W 1248 nt5.39□□□□□ -1.55
RTR2Q12378 SGF29YCL010C 780 nt5.39□□□□□ -1.55
RTR2Q12378 SMF2YHR050W 1650 nt5.39□□□□□ -1.55
RTR2Q12378 YEH1YLL012W 1722 nt5.39□□□□□ -1.55
RTR2Q12378 PWP1YLR196W 1731 nt5.39□□□□□ -1.55
RTR2Q12378 UBX2YML013W 1755 nt5.39□□□□□ -1.55
RTR2Q12378 PYC1YGL062W 3537 nt5.39□□□□□ -1.55
RTR2Q12378 UTP4YDR324C 2331 nt5.39□□□□□ -1.55
RTR2Q12378 ACS2YLR153C 2052 nt5.38□□□□□ -1.55
RTR2Q12378 MPC2YHR162W 390 nt5.38□□□□□ -1.55
RTR2Q12378 MSO1YNR049C 633 nt5.38□□□□□ -1.55
RTR2Q12378 TSR3YOR006C 942 nt5.38□□□□□ -1.55
RTR2Q12378 YOR300WYOR300W 309 nt5.38□□□□□ -1.55
RTR2Q12378 RPN7YPR108W 1290 nt5.38□□□□□ -1.55
RTR2Q12378 HSP78YDR258C 2436 nt5.38□□□□□ -1.55
RTR2Q12378 GUD1YDL238C 1470 nt5.38□□□□□ -1.55
RTR2Q12378 YDR053WYDR053W 396 nt5.37□□□□□ -1.55
RTR2Q12378 MED6YHR058C 888 nt5.37□□□□□ -1.55
RTR2Q12378 YNL097W-AYNL097W-A 156 nt5.37□□□□□ -1.55
RTR2Q12378 RRT2YBR246W 1164 nt5.37□□□□□ -1.55
RTR2Q12378 ABZ1YNR033W 2364 nt5.36□□□□□ -1.55
RTR2Q12378 SNZ3YFL059W 897 nt5.36□□□□□ -1.55
RTR2Q12378 YGR176WYGR176W 348 nt5.36□□□□□ -1.55
RTR2Q12378 RHO3YIL118W 696 nt5.36□□□□□ -1.55
RTR2Q12378 PRS1YKL181W 1284 nt5.36□□□□□ -1.55
RTR2Q12378 SNZ2YNL333W 897 nt5.36□□□□□ -1.55
RTR2Q12378 RDL2YOR286W 450 nt5.36□□□□□ -1.55
RTR2Q12378 FRS2YFL022C 1512 nt5.36□□□□□ -1.55
RTR2Q12378 YNL095CYNL095C 1929 nt5.36□□□□□ -1.55
RTR2Q12378 ARE2YNR019W 1929 nt5.36□□□□□ -1.55
RTR2Q12378 RAD3YER171W 2337 nt5.35□□□□□ -1.55
RTR2Q12378 SIA1YOR137C 1869 nt5.35□□□□□ -1.55
RTR2Q12378 PDC1YLR044C 1692 nt5.35□□□□□ -1.55
RTR2Q12378 GFA1YKL104C 2154 nt5.35□□□□□ -1.55
RTR2Q12378 KKQ8YKL168C 2175 nt5.35□□□□□ -1.55
RTR2Q12378 YCK1YHR135C 1617 nt5.34□□□□□ -1.55
RTR2Q12378 MID1YNL291C 1647 nt5.34□□□□□ -1.55
RTR2Q12378 MCX1YBR227C 1563 nt5.34□□□□□ -1.55
RTR2Q12378 YPR196WYPR196W 1413 nt5.34□□□□□ -1.55
RTR2Q12378 YDL057WYDL057W 987 nt5.34□□□□□ -1.55
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 21.9 ms