Protein–RNA interactions for Protein: Q02100

SKO1, CRE-binding bZIP protein SKO1, yeastyeast

Predictions only

Length 647 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SKO1Q02100 PGM1YKL127W 1713 nt5.49□□□□□ -1.53
SKO1Q02100 DMA1YHR115C 1251 nt5.49□□□□□ -1.53
SKO1Q02100 COX17YLL009C 210 nt5.49□□□□□ -1.53
SKO1Q02100 YMR135W-AYMR135W-A 534 nt5.49□□□□□ -1.53
SKO1Q02100 RFA2YNL312W 822 nt5.49□□□□□ -1.53
SKO1Q02100 YPL257WYPL257W 582 nt5.49□□□□□ -1.53
SKO1Q02100 CLB4YLR210W 1383 nt5.49□□□□□ -1.53
SKO1Q02100 YDR514CYDR514C 1452 nt5.49□□□□□ -1.53
SKO1Q02100 YEF1YEL041W 1488 nt5.49□□□□□ -1.53
SKO1Q02100 YOL036WYOL036W 2286 nt5.49□□□□□ -1.53
SKO1Q02100 GEX2YKR106W 1848 nt5.48□□□□□ -1.53
SKO1Q02100 snR82snR82 268 nt5.48□□□□□ -1.53
SKO1Q02100 LYS1YIR034C 1122 nt5.48□□□□□ -1.53
SKO1Q02100 SEC17YBL050W 879 nt5.48□□□□□ -1.53
SKO1Q02100 COQ3YOL096C 939 nt5.48□□□□□ -1.53
SKO1Q02100 MED4YOR174W 855 nt5.48□□□□□ -1.53
SKO1Q02100 FSF1YOR271C 984 nt5.48□□□□□ -1.53
SKO1Q02100 PEX32YBR168W 1242 nt5.48□□□□□ -1.53
SKO1Q02100 GEX1YCL073C 1848 nt5.48□□□□□ -1.53
SKO1Q02100 FAT3YKL187C 2253 nt5.48□□□□□ -1.53
SKO1Q02100 SIR2YDL042C 1689 nt5.47□□□□□ -1.53
SKO1Q02100 ESC8YOL017W 2145 nt5.47□□□□□ -1.53
SKO1Q02100 YDR278CYDR278C 318 nt5.47□□□□□ -1.53
SKO1Q02100 YJR146WYJR146W 354 nt5.47□□□□□ -1.53
SKO1Q02100 YMR295CYMR295C 594 nt5.47□□□□□ -1.53
SKO1Q02100 RNH201YNL072W 924 nt5.47□□□□□ -1.53
SKO1Q02100 MRPL10YNL284C 969 nt5.47□□□□□ -1.53
SKO1Q02100 RKI1YOR095C 777 nt5.47□□□□□ -1.53
SKO1Q02100 NPT1YOR209C 1290 nt5.47□□□□□ -1.53
SKO1Q02100 SCP1YOR367W 603 nt5.47□□□□□ -1.53
SKO1Q02100 YMR279CYMR279C 1623 nt5.47□□□□□ -1.53
SKO1Q02100 AFG1YEL052W 1530 nt5.47□□□□□ -1.53
SKO1Q02100 PDR18YNR070W 4002 nt5.47□□□□□ -1.53
SKO1Q02100 QRI1YDL103C 1434 nt5.47□□□□□ -1.53
SKO1Q02100 ARE2YNR019W 1929 nt5.46□□□□□ -1.53
SKO1Q02100 GUP2YPL189W 1830 nt5.46□□□□□ -1.53
SKO1Q02100 URA7YBL039C 1740 nt5.46□□□□□ -1.54
SKO1Q02100 HMLALPHA1YCL066W 528 nt5.46□□□□□ -1.54
SKO1Q02100 MATALPHA1YCR040W 528 nt5.46□□□□□ -1.54
SKO1Q02100 YEA6YEL006W 1008 nt5.46□□□□□ -1.54
SKO1Q02100 MPC2YHR162W 390 nt5.46□□□□□ -1.54
SKO1Q02100 SRL2YLR082C 1179 nt5.46□□□□□ -1.54
SKO1Q02100 RUF23RUF23 254 nt5.46□□□□□ -1.54
SKO1Q02100 YNR048WYNR048W 1182 nt5.46□□□□□ -1.54
SKO1Q02100 PRP24YMR268C 1335 nt5.46□□□□□ -1.54
SKO1Q02100 VPS61YDR136C 573 nt5.45□□□□□ -1.54
SKO1Q02100 GPI11YDR302W 660 nt5.45□□□□□ -1.54
SKO1Q02100 COA1YIL157C 594 nt5.45□□□□□ -1.54
SKO1Q02100 AIM24YJR080C 1185 nt5.45□□□□□ -1.54
SKO1Q02100 APN1YKL114C 1104 nt5.45□□□□□ -1.54
SKO1Q02100 YPL250W-AYPL250W-A 288 nt5.45□□□□□ -1.54
SKO1Q02100 PYC2YBR218C 3543 nt5.45□□□□□ -1.54
SKO1Q02100 TIM22YDL217C 624 nt5.44□□□□□ -1.54
SKO1Q02100 OAC1YKL120W 975 nt5.44□□□□□ -1.54
SKO1Q02100 PTC3YBL056W 1407 nt5.44□□□□□ -1.54
SKO1Q02100 KTR5YNL029C 1569 nt5.44□□□□□ -1.54
SKO1Q02100 SCO2YBR024W 906 nt5.44□□□□□ -1.54
SKO1Q02100 YPR196WYPR196W 1413 nt5.44□□□□□ -1.54
SKO1Q02100 YGR054WYGR054W 1929 nt5.44□□□□□ -1.54
SKO1Q02100 UPS3YDR185C 540 nt5.43□□□□□ -1.54
SKO1Q02100 ARP1YHR129C 1155 nt5.43□□□□□ -1.54
SKO1Q02100 QRI5YLR204W 336 nt5.43□□□□□ -1.54
SKO1Q02100 RSA3YLR221C 663 nt5.43□□□□□ -1.54
SKO1Q02100 HEM15YOR176W 1182 nt5.43□□□□□ -1.54
SKO1Q02100 PTC4YBR125C 1182 nt5.43□□□□□ -1.54
SKO1Q02100 RPN5YDL147W 1338 nt5.43□□□□□ -1.54
SKO1Q02100 YLH47YPR125W 1365 nt5.42□□□□□ -1.54
SKO1Q02100 SKN1YGR143W 2316 nt5.42□□□□□ -1.54
SKO1Q02100 COX9YDL067C 180 nt5.42□□□□□ -1.54
SKO1Q02100 MRPL1YDR116C 858 nt5.42□□□□□ -1.54
SKO1Q02100 RTT103YDR289C 1230 nt5.42□□□□□ -1.54
SKO1Q02100 MDE1YJR024C 735 nt5.42□□□□□ -1.54
SKO1Q02100 VPS24YKL041W 675 nt5.42□□□□□ -1.54
SKO1Q02100 ICT1YLR099C 1185 nt5.42□□□□□ -1.54
SKO1Q02100 YLR157W-EYLR157W-E 165 nt5.42□□□□□ -1.54
SKO1Q02100 YML083CYML083C 1257 nt5.42□□□□□ -1.54
SKO1Q02100 GTO3YMR251W 1101 nt5.42□□□□□ -1.54
SKO1Q02100 KSH1YNL024C-A 219 nt5.42□□□□□ -1.54
SKO1Q02100 YNL097W-AYNL097W-A 156 nt5.42□□□□□ -1.54
SKO1Q02100 YBR124WYBR124W 360 nt5.42□□□□□ -1.54
SKO1Q02100 SSK1YLR006C 2139 nt5.42□□□□□ -1.54
SKO1Q02100 YHR095WYHR095W 495 nt5.41□□□□□ -1.54
SKO1Q02100 OGG1YML060W 1131 nt5.41□□□□□ -1.54
SKO1Q02100 VHT1YGR065C 1782 nt5.41□□□□□ -1.54
SKO1Q02100 SAC6YDR129C 1929 nt5.4□□□□□ -1.54
SKO1Q02100 YFL042CYFL042C 2025 nt5.4□□□□□ -1.54
SKO1Q02100 RSA4YCR072C 1548 nt5.4□□□□□ -1.54
SKO1Q02100 DSF1YEL070W 1509 nt5.4□□□□□ -1.54
SKO1Q02100 YNR073CYNR073C 1509 nt5.4□□□□□ -1.54
SKO1Q02100 PYK2YOR347C 1521 nt5.4□□□□□ -1.54
SKO1Q02100 YGR291CYGR291C 222 nt5.4□□□□□ -1.54
SKO1Q02100 QCR8YJL166W 285 nt5.4□□□□□ -1.54
SKO1Q02100 FPR3YML074C 1236 nt5.4□□□□□ -1.54
SKO1Q02100 MTF1YMR228W 1026 nt5.4□□□□□ -1.54
SKO1Q02100 BSC4YNL269W 396 nt5.4□□□□□ -1.54
SKO1Q02100 YBR298C-AYBR298C-A 222 nt5.4□□□□□ -1.54
SKO1Q02100 SRV2YNL138W 1581 nt5.4□□□□□ -1.55
SKO1Q02100 RBA50YDR527W 1320 nt5.4□□□□□ -1.55
SKO1Q02100 AAP1YHR047C 2571 nt5.4□□□□□ -1.55
SKO1Q02100 CCC2YDR270W 3015 nt5.4□□□□□ -1.55
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 12.9 ms