Protein–RNA interactions for Protein: P78385

KRT83, Keratin, type II cuticular Hb3, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT83P78385 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
KRT83P78385 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
KRT83P78385 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
KRT83P78385 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
KRT83P78385 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
KRT83P78385 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
KRT83P78385 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
KRT83P78385 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
KRT83P78385 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
KRT83P78385 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
KRT83P78385 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
KRT83P78385 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
KRT83P78385 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
KRT83P78385 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
KRT83P78385 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
KRT83P78385 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
KRT83P78385 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
KRT83P78385 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
KRT83P78385 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
KRT83P78385 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
KRT83P78385 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
KRT83P78385 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
KRT83P78385 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
KRT83P78385 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
KRT83P78385 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
KRT83P78385 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
KRT83P78385 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
KRT83P78385 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
KRT83P78385 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC25.74■■□□□ 1.71
KRT83P78385 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
KRT83P78385 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
KRT83P78385 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
KRT83P78385 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
KRT83P78385 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
KRT83P78385 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
KRT83P78385 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
KRT83P78385 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
KRT83P78385 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
KRT83P78385 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
KRT83P78385 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
KRT83P78385 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
KRT83P78385 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
KRT83P78385 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
KRT83P78385 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
KRT83P78385 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
KRT83P78385 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
KRT83P78385 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
KRT83P78385 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
KRT83P78385 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
KRT83P78385 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
KRT83P78385 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
KRT83P78385 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
KRT83P78385 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
KRT83P78385 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.71
KRT83P78385 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
KRT83P78385 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
KRT83P78385 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
KRT83P78385 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
KRT83P78385 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
KRT83P78385 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
KRT83P78385 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
KRT83P78385 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
KRT83P78385 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
KRT83P78385 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
KRT83P78385 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
KRT83P78385 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
KRT83P78385 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
KRT83P78385 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
KRT83P78385 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
KRT83P78385 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
KRT83P78385 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
KRT83P78385 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
KRT83P78385 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
KRT83P78385 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
KRT83P78385 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
KRT83P78385 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
KRT83P78385 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
KRT83P78385 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
KRT83P78385 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
KRT83P78385 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
KRT83P78385 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
KRT83P78385 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
KRT83P78385 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
KRT83P78385 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
KRT83P78385 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC25.66■■□□□ 1.7
KRT83P78385 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
KRT83P78385 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
KRT83P78385 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
KRT83P78385 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
KRT83P78385 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
KRT83P78385 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
KRT83P78385 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
KRT83P78385 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
KRT83P78385 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
KRT83P78385 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
KRT83P78385 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
KRT83P78385 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC25.65■■□□□ 1.7
KRT83P78385 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
KRT83P78385 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
KRT83P78385 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37 ms