Protein–RNA interactions for Protein: P55098

Pex2, Peroxisome biogenesis factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pex2P55098 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Pex2P55098 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Pex2P55098 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Pex2P55098 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
Pex2P55098 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Pex2P55098 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Pex2P55098 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Pex2P55098 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Pex2P55098 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Pex2P55098 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Pex2P55098 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Pex2P55098 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Pex2P55098 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Pex2P55098 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Pex2P55098 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Pex2P55098 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Pex2P55098 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Pex2P55098 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Pex2P55098 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Pex2P55098 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Pex2P55098 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Pex2P55098 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Pex2P55098 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Pex2P55098 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Pex2P55098 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Pex2P55098 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Pex2P55098 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Pex2P55098 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Pex2P55098 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
Pex2P55098 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Pex2P55098 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Pex2P55098 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Pex2P55098 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
Pex2P55098 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Pex2P55098 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Pex2P55098 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Pex2P55098 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.9
Pex2P55098 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.9
Pex2P55098 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Pex2P55098 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Pex2P55098 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Pex2P55098 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Pex2P55098 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Pex2P55098 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Pex2P55098 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Pex2P55098 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Pex2P55098 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Pex2P55098 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Pex2P55098 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Pex2P55098 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Pex2P55098 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Pex2P55098 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Pex2P55098 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Pex2P55098 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Pex2P55098 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Pex2P55098 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Pex2P55098 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Pex2P55098 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Pex2P55098 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Pex2P55098 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Pex2P55098 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Pex2P55098 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Pex2P55098 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Pex2P55098 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Pex2P55098 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
Pex2P55098 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Pex2P55098 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Pex2P55098 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Pex2P55098 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Pex2P55098 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Pex2P55098 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Pex2P55098 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Pex2P55098 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Pex2P55098 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Pex2P55098 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Pex2P55098 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Pex2P55098 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Pex2P55098 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Pex2P55098 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Pex2P55098 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Pex2P55098 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Pex2P55098 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Pex2P55098 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Pex2P55098 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Pex2P55098 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Pex2P55098 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Pex2P55098 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Pex2P55098 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Pex2P55098 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Pex2P55098 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Pex2P55098 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Pex2P55098 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Pex2P55098 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Pex2P55098 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Pex2P55098 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Pex2P55098 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Pex2P55098 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Pex2P55098 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Pex2P55098 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Pex2P55098 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms