Protein–RNA interactions for Protein: P40550

PDR11, ATP-dependent permease PDR11, yeastyeast

Predictions only

Length 1,411 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
PDR11P40550 YGL036WYGL036W 2730 nt7.95□□□□□ -1.14
PDR11P40550 YDL034WYDL034W 345 nt7.95□□□□□ -1.14
PDR11P40550 CTF8YHR191C 402 nt7.95□□□□□ -1.14
PDR11P40550 YML082WYML082W 1950 nt7.94□□□□□ -1.14
PDR11P40550 YJU3YKL094W 942 nt7.94□□□□□ -1.14
PDR11P40550 YNL019CYNL019C 855 nt7.94□□□□□ -1.14
PDR11P40550 YNL033WYNL033W 855 nt7.94□□□□□ -1.14
PDR11P40550 YBR124WYBR124W 360 nt7.94□□□□□ -1.14
PDR11P40550 HIS7YBR248C 1659 nt7.93□□□□□ -1.14
PDR11P40550 YAP1801YHR161C 1914 nt7.93□□□□□ -1.14
PDR11P40550 HSX1tR(CCU)J 72 nt7.93□□□□□ -1.14
PDR11P40550 NUD1YOR373W 2556 nt7.93□□□□□ -1.14
PDR11P40550 YEA6YEL006W 1008 nt7.92□□□□□ -1.14
PDR11P40550 tN(GUU)CtN(GUU)C 74 nt7.91□□□□□ -1.14
PDR11P40550 tN(GUU)FtN(GUU)F 74 nt7.91□□□□□ -1.14
PDR11P40550 tN(GUU)GtN(GUU)G 74 nt7.91□□□□□ -1.14
PDR11P40550 tN(GUU)KtN(GUU)K 74 nt7.91□□□□□ -1.14
PDR11P40550 tN(GUU)LtN(GUU)L 74 nt7.91□□□□□ -1.14
PDR11P40550 tN(GUU)N1tN(GUU)N1 74 nt7.91□□□□□ -1.14
PDR11P40550 tN(GUU)N2tN(GUU)N2 74 nt7.91□□□□□ -1.14
PDR11P40550 tN(GUU)O1tN(GUU)O1 74 nt7.91□□□□□ -1.14
PDR11P40550 tN(GUU)O2tN(GUU)O2 74 nt7.91□□□□□ -1.14
PDR11P40550 tN(GUU)PtN(GUU)P 74 nt7.91□□□□□ -1.14
PDR11P40550 IPI1YHR085W 1005 nt7.91□□□□□ -1.14
PDR11P40550 YHC3YJL059W 1227 nt7.91□□□□□ -1.14
PDR11P40550 YAL056C-AYAL056C-A 351 nt7.91□□□□□ -1.14
PDR11P40550 YMR010WYMR010W 1218 nt7.91□□□□□ -1.14
PDR11P40550 YCL041CYCL041C 495 nt7.91□□□□□ -1.14
PDR11P40550 ARP3YJR065C 1350 nt7.91□□□□□ -1.14
PDR11P40550 ILV2YMR108W 2064 nt7.91□□□□□ -1.14
PDR11P40550 NPA3YJR072C 1158 nt7.9□□□□□ -1.14
PDR11P40550 YHL017WYHL017W 1599 nt7.89□□□□□ -1.15
PDR11P40550 PRO3YER023W 861 nt7.89□□□□□ -1.15
PDR11P40550 ICS3YJL077C 396 nt7.89□□□□□ -1.15
PDR11P40550 YGL194C-AYGL194C-A 243 nt7.88□□□□□ -1.15
PDR11P40550 GAA1YLR088W 1845 nt7.88□□□□□ -1.15
PDR11P40550 YJR015WYJR015W 1533 nt7.88□□□□□ -1.15
PDR11P40550 YCR097W-AYCR097W-A 267 nt7.86□□□□□ -1.15
PDR11P40550 CAD1YDR423C 1230 nt7.86□□□□□ -1.15
PDR11P40550 RPT6YGL048C 1218 nt7.86□□□□□ -1.15
PDR11P40550 PRM10YJL108C 1152 nt7.86□□□□□ -1.15
PDR11P40550 YUR1YJL139C 1287 nt7.86□□□□□ -1.15
PDR11P40550 COS9YKL219W 1224 nt7.86□□□□□ -1.15
PDR11P40550 ICT1YLR099C 1185 nt7.86□□□□□ -1.15
PDR11P40550 HCR1YLR192C 798 nt7.86□□□□□ -1.15
PDR11P40550 RAD3YER171W 2337 nt7.86□□□□□ -1.15
PDR11P40550 DIA3YDL024C 1407 nt7.85□□□□□ -1.15
PDR11P40550 YCR075W-AYCR075W-A 228 nt7.85□□□□□ -1.15
PDR11P40550 GIR2YDR152W 798 nt7.85□□□□□ -1.15
PDR11P40550 YER010CYER010C 705 nt7.85□□□□□ -1.15
PDR11P40550 YGR176WYGR176W 348 nt7.85□□□□□ -1.15
PDR11P40550 LYS12YIL094C 1116 nt7.85□□□□□ -1.15
PDR11P40550 YIL108WYIL108W 2091 nt7.84□□□□□ -1.15
PDR11P40550 GPI11YDR302W 660 nt7.84□□□□□ -1.15
PDR11P40550 AGP2YBR132C 1791 nt7.83□□□□□ -1.16
PDR11P40550 SSK22YCR073C 3996 nt7.83□□□□□ -1.16
PDR11P40550 DAL82YNL314W 768 nt7.83□□□□□ -1.16
PDR11P40550 XBP1YIL101C 1944 nt7.83□□□□□ -1.16
PDR11P40550 ALR1YOL130W 2580 nt7.83□□□□□ -1.16
PDR11P40550 AFG2YLR397C 2343 nt7.83□□□□□ -1.16
PDR11P40550 ERC1YHR032W 1746 nt7.82□□□□□ -1.16
PDR11P40550 TIM54YJL054W 1437 nt7.82□□□□□ -1.16
PDR11P40550 PHO3YBR092C 1404 nt7.82□□□□□ -1.16
PDR11P40550 PGK1YCR012W 1251 nt7.82□□□□□ -1.16
PDR11P40550 MEU1YLR017W 1014 nt7.82□□□□□ -1.16
PDR11P40550 YOL163WYOL163W 510 nt7.82□□□□□ -1.16
PDR11P40550 MNN5YJL186W 1761 nt7.81□□□□□ -1.16
PDR11P40550 YJR115WYJR115W 510 nt7.8□□□□□ -1.16
PDR11P40550 YKL151CYKL151C 1014 nt7.8□□□□□ -1.16
PDR11P40550 YPL062WYPL062W 405 nt7.8□□□□□ -1.16
PDR11P40550 YML133CYML133C 4125 nt7.8□□□□□ -1.16
PDR11P40550 TOM71YHR117W 1920 nt7.8□□□□□ -1.16
PDR11P40550 RTT106YNL206C 1368 nt7.8□□□□□ -1.16
PDR11P40550 RME1YGR044C 903 nt7.79□□□□□ -1.16
PDR11P40550 PFK2YMR205C 2880 nt7.79□□□□□ -1.16
PDR11P40550 SOG2YOR353C 2376 nt7.79□□□□□ -1.16
PDR11P40550 SHE10YGL228W 1734 nt7.79□□□□□ -1.16
PDR11P40550 SUP2tY(GUA)D 75 nt7.78□□□□□ -1.16
PDR11P40550 SUP11tY(GUA)F1 75 nt7.78□□□□□ -1.16
PDR11P40550 SUP6tY(GUA)F2 75 nt7.78□□□□□ -1.16
PDR11P40550 SUP7tY(GUA)J1 75 nt7.78□□□□□ -1.16
PDR11P40550 SUP4tY(GUA)J2 75 nt7.78□□□□□ -1.16
PDR11P40550 SUP5tY(GUA)M1 75 nt7.78□□□□□ -1.16
PDR11P40550 SUP8tY(GUA)M2 75 nt7.78□□□□□ -1.16
PDR11P40550 SUP3tY(GUA)O 75 nt7.78□□□□□ -1.16
PDR11P40550 SLO1YER180C-A 258 nt7.78□□□□□ -1.16
PDR11P40550 HAP2YGL237C 798 nt7.78□□□□□ -1.16
PDR11P40550 PGU1YJR153W 1086 nt7.78□□□□□ -1.16
PDR11P40550 YME1YPR024W 2244 nt7.77□□□□□ -1.17
PDR11P40550 YLL059CYLL059C 507 nt7.77□□□□□ -1.17
PDR11P40550 STM1YLR150W 822 nt7.77□□□□□ -1.17
PDR11P40550 YNR040WYNR040W 771 nt7.77□□□□□ -1.17
PDR11P40550 YOL097W-AYOL097W-A 186 nt7.77□□□□□ -1.17
PDR11P40550 YOR318CYOR318C 306 nt7.77□□□□□ -1.17
PDR11P40550 MRPL1YDR116C 858 nt7.76□□□□□ -1.17
PDR11P40550 COX26YDR119W-A 201 nt7.76□□□□□ -1.17
PDR11P40550 GAT1YFL021W 1533 nt7.76□□□□□ -1.17
PDR11P40550 RPS2YGL123W 765 nt7.76□□□□□ -1.17
PDR11P40550 YLR118CYLR118C 684 nt7.76□□□□□ -1.17
PDR11P40550 FET4YMR319C 1659 nt7.76□□□□□ -1.17
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