Protein–RNA interactions for Protein: P40105

YRF1-2, Y' element ATP-dependent helicase protein 1 copy 2, yeastyeast

Predictions only

Length 1,681 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YRF1-2P40105 RTG2YGL252C 1767 nt7.49□□□□□ -1.21
YRF1-2P40105 SLO1YER180C-A 258 nt7.49□□□□□ -1.21
YRF1-2P40105 COA1YIL157C 594 nt7.49□□□□□ -1.21
YRF1-2P40105 SSK22YCR073C 3996 nt7.49□□□□□ -1.21
YRF1-2P40105 YDL034WYDL034W 345 nt7.48□□□□□ -1.21
YRF1-2P40105 UTR4YEL038W 684 nt7.48□□□□□ -1.21
YRF1-2P40105 DAL82YNL314W 768 nt7.48□□□□□ -1.21
YRF1-2P40105 COT1YOR316C 1320 nt7.48□□□□□ -1.21
YRF1-2P40105 YDR278CYDR278C 318 nt7.47□□□□□ -1.21
YRF1-2P40105 CTF8YHR191C 402 nt7.47□□□□□ -1.21
YRF1-2P40105 ECM15YBL001C 315 nt7.47□□□□□ -1.21
YRF1-2P40105 YMR010WYMR010W 1218 nt7.47□□□□□ -1.21
YRF1-2P40105 GLN1YPR035W 1113 nt7.47□□□□□ -1.21
YRF1-2P40105 QNS1YHR074W 2145 nt7.47□□□□□ -1.21
YRF1-2P40105 PET112YBL080C 1626 nt7.47□□□□□ -1.21
YRF1-2P40105 TEP1YNL128W 1305 nt7.47□□□□□ -1.21
YRF1-2P40105 SAM4YPL273W 978 nt7.47□□□□□ -1.21
YRF1-2P40105 GYP8YFL027C 1494 nt7.46□□□□□ -1.21
YRF1-2P40105 BCY1YIL033C 1251 nt7.46□□□□□ -1.22
YRF1-2P40105 YJR115WYJR115W 510 nt7.46□□□□□ -1.22
YRF1-2P40105 YNL296WYNL296W 315 nt7.46□□□□□ -1.22
YRF1-2P40105 GIR2YDR152W 798 nt7.45□□□□□ -1.22
YRF1-2P40105 PRO3YER023W 861 nt7.45□□□□□ -1.22
YRF1-2P40105 DMA1YHR115C 1251 nt7.45□□□□□ -1.22
YRF1-2P40105 YBR144CYBR144C 315 nt7.45□□□□□ -1.22
YRF1-2P40105 SHM1YBR263W 1473 nt7.45□□□□□ -1.22
YRF1-2P40105 CAD1YDR423C 1230 nt7.44□□□□□ -1.22
YRF1-2P40105 YLL059CYLL059C 507 nt7.44□□□□□ -1.22
YRF1-2P40105 ARG81YML099C 2643 nt7.44□□□□□ -1.22
YRF1-2P40105 ATO3YDR384C 828 nt7.44□□□□□ -1.22
YRF1-2P40105 HSX1tR(CCU)J 72 nt7.44□□□□□ -1.22
YRF1-2P40105 APS3YJL024C 585 nt7.44□□□□□ -1.22
YRF1-2P40105 YKL151CYKL151C 1014 nt7.44□□□□□ -1.22
YRF1-2P40105 MRPL4YLR439W 960 nt7.44□□□□□ -1.22
YRF1-2P40105 PYC2YBR218C 3543 nt7.43□□□□□ -1.22
YRF1-2P40105 TIM54YJL054W 1437 nt7.43□□□□□ -1.22
YRF1-2P40105 YCL065WYCL065W 369 nt7.43□□□□□ -1.22
YRF1-2P40105 YDR154CYDR154C 351 nt7.43□□□□□ -1.22
YRF1-2P40105 YML083CYML083C 1257 nt7.43□□□□□ -1.22
YRF1-2P40105 CSG2YBR036C 1233 nt7.43□□□□□ -1.22
YRF1-2P40105 YIL108WYIL108W 2091 nt7.43□□□□□ -1.22
YRF1-2P40105 YAP1801YHR161C 1914 nt7.43□□□□□ -1.22
YRF1-2P40105 YBR124WYBR124W 360 nt7.42□□□□□ -1.22
YRF1-2P40105 CIS3YJL158C 684 nt7.41□□□□□ -1.22
YRF1-2P40105 EEB1YPL095C 1371 nt7.41□□□□□ -1.22
YRF1-2P40105 PHO3YBR092C 1404 nt7.41□□□□□ -1.22
YRF1-2P40105 FRS2YFL022C 1512 nt7.41□□□□□ -1.22
YRF1-2P40105 RPT3YDR394W 1287 nt7.41□□□□□ -1.22
YRF1-2P40105 MOD5YOR274W 1287 nt7.41□□□□□ -1.22
YRF1-2P40105 AGP2YBR132C 1791 nt7.4□□□□□ -1.22
YRF1-2P40105 YPR204WYPR204W 3099 nt7.4□□□□□ -1.23
YRF1-2P40105 YNL040WYNL040W 1371 nt7.4□□□□□ -1.23
YRF1-2P40105 VRP1YLR337C 2454 nt7.39□□□□□ -1.23
YRF1-2P40105 ARP3YJR065C 1350 nt7.38□□□□□ -1.23
YRF1-2P40105 MIM2YLR099W-A 264 nt7.38□□□□□ -1.23
YRF1-2P40105 BSP1YPR171W 1731 nt7.37□□□□□ -1.23
YRF1-2P40105 AFG2YLR397C 2343 nt7.37□□□□□ -1.23
YRF1-2P40105 FAA4YMR246W 2085 nt7.37□□□□□ -1.23
YRF1-2P40105 YHR127WYHR127W 732 nt7.35□□□□□ -1.23
YRF1-2P40105 DUS4YLR405W 1104 nt7.35□□□□□ -1.23
YRF1-2P40105 SUP19tS(UGA)E 82 nt7.34□□□□□ -1.23
YRF1-2P40105 SUP17tS(UGA)I 82 nt7.34□□□□□ -1.23
YRF1-2P40105 SUP16tS(UGA)P 82 nt7.34□□□□□ -1.23
YRF1-2P40105 IPI1YHR085W 1005 nt7.34□□□□□ -1.23
YRF1-2P40105 LAS21YJL062W 2493 nt7.34□□□□□ -1.23
YRF1-2P40105 PAD1YDR538W 729 nt7.33□□□□□ -1.24
YRF1-2P40105 YPL277CYPL277C 1464 nt7.33□□□□□ -1.24
YRF1-2P40105 PRP46YPL151C 1356 nt7.33□□□□□ -1.24
YRF1-2P40105 YER010CYER010C 705 nt7.32□□□□□ -1.24
YRF1-2P40105 NPA3YJR072C 1158 nt7.32□□□□□ -1.24
YRF1-2P40105 TFS1YLR178C 660 nt7.32□□□□□ -1.24
YRF1-2P40105 GLE1YDL207W 1617 nt7.32□□□□□ -1.24
YRF1-2P40105 HIS7YBR248C 1659 nt7.32□□□□□ -1.24
YRF1-2P40105 YRA1YDR381W 681 nt7.32□□□□□ -1.24
YRF1-2P40105 RCL1YOL010W 1104 nt7.32□□□□□ -1.24
YRF1-2P40105 CIR2YOR356W 1896 nt7.31□□□□□ -1.24
YRF1-2P40105 IPK1YDR315C 846 nt7.31□□□□□ -1.24
YRF1-2P40105 RPT6YGL048C 1218 nt7.31□□□□□ -1.24
YRF1-2P40105 YBR016WYBR016W 387 nt7.31□□□□□ -1.24
YRF1-2P40105 YOR318CYOR318C 306 nt7.31□□□□□ -1.24
YRF1-2P40105 tN(GUU)CtN(GUU)C 74 nt7.3□□□□□ -1.24
YRF1-2P40105 tN(GUU)FtN(GUU)F 74 nt7.3□□□□□ -1.24
YRF1-2P40105 tN(GUU)GtN(GUU)G 74 nt7.3□□□□□ -1.24
YRF1-2P40105 tN(GUU)KtN(GUU)K 74 nt7.3□□□□□ -1.24
YRF1-2P40105 tN(GUU)LtN(GUU)L 74 nt7.3□□□□□ -1.24
YRF1-2P40105 tN(GUU)N1tN(GUU)N1 74 nt7.3□□□□□ -1.24
YRF1-2P40105 tN(GUU)N2tN(GUU)N2 74 nt7.3□□□□□ -1.24
YRF1-2P40105 tN(GUU)O1tN(GUU)O1 74 nt7.3□□□□□ -1.24
YRF1-2P40105 tN(GUU)O2tN(GUU)O2 74 nt7.3□□□□□ -1.24
YRF1-2P40105 tN(GUU)PtN(GUU)P 74 nt7.3□□□□□ -1.24
YRF1-2P40105 CBF1YJR060W 1056 nt7.3□□□□□ -1.24
YRF1-2P40105 EFM3YJR129C 1020 nt7.3□□□□□ -1.24
YRF1-2P40105 YHL017WYHL017W 1599 nt7.3□□□□□ -1.24
YRF1-2P40105 MHR1YDR296W 681 nt7.29□□□□□ -1.24
YRF1-2P40105 YLR118CYLR118C 684 nt7.29□□□□□ -1.24
YRF1-2P40105 YEA6YEL006W 1008 nt7.28□□□□□ -1.24
YRF1-2P40105 YOL163WYOL163W 510 nt7.28□□□□□ -1.24
YRF1-2P40105 YML082WYML082W 1950 nt7.28□□□□□ -1.24
YRF1-2P40105 MNN5YJL186W 1761 nt7.28□□□□□ -1.24
YRF1-2P40105 TAL1YLR354C 1008 nt7.28□□□□□ -1.24
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 11.3 ms