Protein–RNA interactions for Protein: E9PWQ3

Col6a3, Collagen, type VI, alpha 3, mousemouse

Predictions only

Length 3,284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col6a3E9PWQ3 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22,61■■□□□ 1,21
Col6a3E9PWQ3 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC22,6■■□□□ 1,21
Col6a3E9PWQ3 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC22,6■■□□□ 1,21
Col6a3E9PWQ3 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22,6■■□□□ 1,21
Col6a3E9PWQ3 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,6■■□□□ 1,21
Col6a3E9PWQ3 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,6■■□□□ 1,21
Col6a3E9PWQ3 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC22,6■■□□□ 1,21
Col6a3E9PWQ3 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC22,6■■□□□ 1,21
Col6a3E9PWQ3 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,6■■□□□ 1,21
Col6a3E9PWQ3 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC22,59■■□□□ 1,21
Col6a3E9PWQ3 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22,59■■□□□ 1,21
Col6a3E9PWQ3 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC22,58■■□□□ 1,21
Col6a3E9PWQ3 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,58■■□□□ 1,21
Col6a3E9PWQ3 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC22,58■■□□□ 1,2
Col6a3E9PWQ3 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22,58■■□□□ 1,2
Col6a3E9PWQ3 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,57■■□□□ 1,2
Col6a3E9PWQ3 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC22,57■■□□□ 1,2
Col6a3E9PWQ3 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC22,57■■□□□ 1,2
Col6a3E9PWQ3 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC22,57■■□□□ 1,2
Col6a3E9PWQ3 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,56■■□□□ 1,2
Col6a3E9PWQ3 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,56■■□□□ 1,2
Col6a3E9PWQ3 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC22,56■■□□□ 1,2
Col6a3E9PWQ3 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC22,55■■□□□ 1,2
Col6a3E9PWQ3 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC22,55■■□□□ 1,2
Col6a3E9PWQ3 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,55■■□□□ 1,2
Col6a3E9PWQ3 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22,55■■□□□ 1,2
Col6a3E9PWQ3 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC22,55■■□□□ 1,2
Col6a3E9PWQ3 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,54■■□□□ 1,2
Col6a3E9PWQ3 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,54■■□□□ 1,2
Col6a3E9PWQ3 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC22,54■■□□□ 1,2
Col6a3E9PWQ3 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC22,54■■□□□ 1,2
Col6a3E9PWQ3 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22,53■■□□□ 1,2
Col6a3E9PWQ3 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC22,53■■□□□ 1,2
Col6a3E9PWQ3 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC22,53■■□□□ 1,2
Col6a3E9PWQ3 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,52■■□□□ 1,2
Col6a3E9PWQ3 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,52■■□□□ 1,2
Col6a3E9PWQ3 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC22,52■■□□□ 1,2
Col6a3E9PWQ3 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC22,52■■□□□ 1,2
Col6a3E9PWQ3 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22,52■■□□□ 1,2
Col6a3E9PWQ3 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,52■■□□□ 1,2
Col6a3E9PWQ3 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC22,52■■□□□ 1,2
Col6a3E9PWQ3 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22,51■■□□□ 1,19
Col6a3E9PWQ3 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22,51■■□□□ 1,19
Col6a3E9PWQ3 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC22,51■■□□□ 1,19
Col6a3E9PWQ3 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC22,51■■□□□ 1,19
Col6a3E9PWQ3 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,51■■□□□ 1,19
Col6a3E9PWQ3 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC22,51■■□□□ 1,19
Col6a3E9PWQ3 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22,51■■□□□ 1,19
Col6a3E9PWQ3 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC22,51■■□□□ 1,19
Col6a3E9PWQ3 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22,51■■□□□ 1,19
Col6a3E9PWQ3 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC22,51■■□□□ 1,19
Col6a3E9PWQ3 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC22,51■■□□□ 1,19
Col6a3E9PWQ3 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC22,51■■□□□ 1,19
Col6a3E9PWQ3 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,51■■□□□ 1,19
Col6a3E9PWQ3 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,5■■□□□ 1,19
Col6a3E9PWQ3 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,5■■□□□ 1,19
Col6a3E9PWQ3 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22,5■■□□□ 1,19
Col6a3E9PWQ3 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,5■■□□□ 1,19
Col6a3E9PWQ3 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22,5■■□□□ 1,19
Col6a3E9PWQ3 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC22,49■■□□□ 1,19
Col6a3E9PWQ3 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,49■■□□□ 1,19
Col6a3E9PWQ3 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,49■■□□□ 1,19
Col6a3E9PWQ3 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22,49■■□□□ 1,19
Col6a3E9PWQ3 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC22,49■■□□□ 1,19
Col6a3E9PWQ3 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC22,49■■□□□ 1,19
Col6a3E9PWQ3 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,48■■□□□ 1,19
Col6a3E9PWQ3 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,48■■□□□ 1,19
Col6a3E9PWQ3 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,48■■□□□ 1,19
Col6a3E9PWQ3 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC22,48■■□□□ 1,19
Col6a3E9PWQ3 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22,47■■□□□ 1,19
Col6a3E9PWQ3 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,47■■□□□ 1,19
Col6a3E9PWQ3 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,47■■□□□ 1,19
Col6a3E9PWQ3 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22,46■■□□□ 1,19
Col6a3E9PWQ3 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,46■■□□□ 1,19
Col6a3E9PWQ3 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,46■■□□□ 1,19
Col6a3E9PWQ3 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,46■■□□□ 1,19
Col6a3E9PWQ3 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,46■■□□□ 1,19
Col6a3E9PWQ3 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22,45■■□□□ 1,19
Col6a3E9PWQ3 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22,45■■□□□ 1,18
Col6a3E9PWQ3 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22,45■■□□□ 1,18
Col6a3E9PWQ3 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,45■■□□□ 1,18
Col6a3E9PWQ3 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22,45■■□□□ 1,18
Col6a3E9PWQ3 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,44■■□□□ 1,18
Col6a3E9PWQ3 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC22,44■■□□□ 1,18
Col6a3E9PWQ3 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,44■■□□□ 1,18
Col6a3E9PWQ3 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22,44■■□□□ 1,18
Col6a3E9PWQ3 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22,44■■□□□ 1,18
Col6a3E9PWQ3 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22,44■■□□□ 1,18
Col6a3E9PWQ3 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC22,44■■□□□ 1,18
Col6a3E9PWQ3 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC22,44■■□□□ 1,18
Col6a3E9PWQ3 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22,43■■□□□ 1,18
Col6a3E9PWQ3 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC22,43■■□□□ 1,18
Col6a3E9PWQ3 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,42■■□□□ 1,18
Col6a3E9PWQ3 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22,42■■□□□ 1,18
Col6a3E9PWQ3 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,42■■□□□ 1,18
Col6a3E9PWQ3 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC22,42■■□□□ 1,18
Col6a3E9PWQ3 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,41■■□□□ 1,18
Col6a3E9PWQ3 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC22,41■■□□□ 1,18
Col6a3E9PWQ3 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,41■■□□□ 1,18
Col6a3E9PWQ3 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC22,41■■□□□ 1,18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48,6 ms