Protein–RNA interactions for Protein: D3YYZ2

Gm5239, MCG1031578, mousemouse

Predictions only

Length 122 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5239D3YYZ2 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm5239D3YYZ2 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm5239D3YYZ2 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm5239D3YYZ2 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm5239D3YYZ2 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm5239D3YYZ2 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm5239D3YYZ2 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm5239D3YYZ2 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
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Gm5239D3YYZ2 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm5239D3YYZ2 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm5239D3YYZ2 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm5239D3YYZ2 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm5239D3YYZ2 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm5239D3YYZ2 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm5239D3YYZ2 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm5239D3YYZ2 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm5239D3YYZ2 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm5239D3YYZ2 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm5239D3YYZ2 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm5239D3YYZ2 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm5239D3YYZ2 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm5239D3YYZ2 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm5239D3YYZ2 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm5239D3YYZ2 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
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Gm5239D3YYZ2 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm5239D3YYZ2 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm5239D3YYZ2 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm5239D3YYZ2 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gm5239D3YYZ2 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gm5239D3YYZ2 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gm5239D3YYZ2 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gm5239D3YYZ2 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gm5239D3YYZ2 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gm5239D3YYZ2 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gm5239D3YYZ2 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gm5239D3YYZ2 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gm5239D3YYZ2 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
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Gm5239D3YYZ2 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gm5239D3YYZ2 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
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Gm5239D3YYZ2 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gm5239D3YYZ2 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gm5239D3YYZ2 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gm5239D3YYZ2 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gm5239D3YYZ2 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gm5239D3YYZ2 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gm5239D3YYZ2 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gm5239D3YYZ2 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gm5239D3YYZ2 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gm5239D3YYZ2 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gm5239D3YYZ2 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gm5239D3YYZ2 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gm5239D3YYZ2 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Gm5239D3YYZ2 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gm5239D3YYZ2 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gm5239D3YYZ2 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gm5239D3YYZ2 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gm5239D3YYZ2 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gm5239D3YYZ2 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gm5239D3YYZ2 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
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Gm5239D3YYZ2 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
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Gm5239D3YYZ2 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gm5239D3YYZ2 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Gm5239D3YYZ2 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gm5239D3YYZ2 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gm5239D3YYZ2 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gm5239D3YYZ2 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gm5239D3YYZ2 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gm5239D3YYZ2 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gm5239D3YYZ2 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gm5239D3YYZ2 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gm5239D3YYZ2 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gm5239D3YYZ2 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gm5239D3YYZ2 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gm5239D3YYZ2 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gm5239D3YYZ2 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gm5239D3YYZ2 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gm5239D3YYZ2 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gm5239D3YYZ2 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gm5239D3YYZ2 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gm5239D3YYZ2 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Gm5239D3YYZ2 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Gm5239D3YYZ2 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gm5239D3YYZ2 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gm5239D3YYZ2 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gm5239D3YYZ2 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gm5239D3YYZ2 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gm5239D3YYZ2 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gm5239D3YYZ2 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gm5239D3YYZ2 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Gm5239D3YYZ2 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gm5239D3YYZ2 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.4 ms