Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHV7

MED13, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 13, humanhuman

Predictions only

Length 2,174 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MED13Q9UHV7 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MED13Q9UHV7 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MED13Q9UHV7 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MED13Q9UHV7 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
MED13Q9UHV7 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MED13Q9UHV7 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MED13Q9UHV7 SS18L2-201ENST00000011691 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MED13Q9UHV7 FIBP-201ENST00000338369 1261 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MED13Q9UHV7 ACTA1-201ENST00000366683 1122 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
MED13Q9UHV7 AC079776.1-201ENST00000401540 1152 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
MED13Q9UHV7 PTPA-220ENST00000436883 532 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
MED13Q9UHV7 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
MED13Q9UHV7 RN7SL837P-201ENST00000463010 287 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
MED13Q9UHV7 ATF7-204ENST00000548118 774 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MED13Q9UHV7 TRAPPC6A-204ENST00000588062 695 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
MED13Q9UHV7 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MED13Q9UHV7 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MED13Q9UHV7 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
MED13Q9UHV7 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
MED13Q9UHV7 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
MED13Q9UHV7 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MED13Q9UHV7 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MED13Q9UHV7 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MED13Q9UHV7 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
MED13Q9UHV7 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
MED13Q9UHV7 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MED13Q9UHV7 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MED13Q9UHV7 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MED13Q9UHV7 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
MED13Q9UHV7 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MED13Q9UHV7 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MED13Q9UHV7 IFT20-203ENST00000395418 825 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MED13Q9UHV7 CLNS1A-210ENST00000528364 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
MED13Q9UHV7 HILS1-202ENST00000545329 423 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
MED13Q9UHV7 IFT20-216ENST00000588477 774 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
MED13Q9UHV7 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MED13Q9UHV7 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MED13Q9UHV7 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
MED13Q9UHV7 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
MED13Q9UHV7 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MED13Q9UHV7 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MED13Q9UHV7 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
MED13Q9UHV7 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
MED13Q9UHV7 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MED13Q9UHV7 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MED13Q9UHV7 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
MED13Q9UHV7 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
MED13Q9UHV7 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
MED13Q9UHV7 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
MED13Q9UHV7 AL391825.1-201ENST00000457671 1364 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
MED13Q9UHV7 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
MED13Q9UHV7 LCN15-201ENST00000316144 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MED13Q9UHV7 YBEY-202ENST00000339195 890 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MED13Q9UHV7 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
MED13Q9UHV7 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MED13Q9UHV7 YBEY-203ENST00000397691 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
MED13Q9UHV7 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
MED13Q9UHV7 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
MED13Q9UHV7 CCDC25-209ENST00000522915 785 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
MED13Q9UHV7 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
MED13Q9UHV7 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
MED13Q9UHV7 IFITM2-204ENST00000533141 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
MED13Q9UHV7 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
MED13Q9UHV7 AC126696.2-201ENST00000563687 522 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
MED13Q9UHV7 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
MED13Q9UHV7 FOLR3-204ENST00000611028 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MED13Q9UHV7 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
MED13Q9UHV7 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MED13Q9UHV7 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
MED13Q9UHV7 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MED13Q9UHV7 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MED13Q9UHV7 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
MED13Q9UHV7 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
MED13Q9UHV7 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
MED13Q9UHV7 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MED13Q9UHV7 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
MED13Q9UHV7 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
MED13Q9UHV7 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
MED13Q9UHV7 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MED13Q9UHV7 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MED13Q9UHV7 PGF-202ENST00000405431 666 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
MED13Q9UHV7 ATP5G2P4-201ENST00000442175 420 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
MED13Q9UHV7 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
MED13Q9UHV7 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
MED13Q9UHV7 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MED13Q9UHV7 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
MED13Q9UHV7 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
MED13Q9UHV7 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
MED13Q9UHV7 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
MED13Q9UHV7 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
MED13Q9UHV7 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
MED13Q9UHV7 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MED13Q9UHV7 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MED13Q9UHV7 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MED13Q9UHV7 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MED13Q9UHV7 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
MED13Q9UHV7 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
MED13Q9UHV7 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
MED13Q9UHV7 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
MED13Q9UHV7 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.2 ms