Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2R6

RERE, Arginine-glutamic acid dipeptide repeats protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,566 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
REREQ9P2R6 ATP5D-202ENST00000395633 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
REREQ9P2R6 RAB34-210ENST00000436730 863 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
REREQ9P2R6 YBX1P6-201ENST00000442962 1002 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
REREQ9P2R6 PARP8-206ENST00000503665 572 ntTSL 4 BASIC24.05■■□□□ 1.44
REREQ9P2R6 AC116456.1-201ENST00000526646 815 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
REREQ9P2R6 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
REREQ9P2R6 AC133539.2-201ENST00000604757 467 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
REREQ9P2R6 FAM172A-204ENST00000505869 1387 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
REREQ9P2R6 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
REREQ9P2R6 KCNJ2-202ENST00000535240 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
REREQ9P2R6 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
REREQ9P2R6 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
REREQ9P2R6 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
REREQ9P2R6 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
REREQ9P2R6 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
REREQ9P2R6 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
REREQ9P2R6 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
REREQ9P2R6 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
REREQ9P2R6 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
REREQ9P2R6 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
REREQ9P2R6 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
REREQ9P2R6 FDFT1-202ENST00000443614 1393 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
REREQ9P2R6 AC016683.1-202ENST00000438409 583 ntTSL 4 BASIC24.04■■□□□ 1.44
REREQ9P2R6 HOXC-AS3-201ENST00000509870 544 ntTSL 4 BASIC24.04■■□□□ 1.44
REREQ9P2R6 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
REREQ9P2R6 PTP4A1P2-201ENST00000546033 454 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
REREQ9P2R6 AC079316.1-201ENST00000548397 411 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
REREQ9P2R6 ACYP1-206ENST00000555694 565 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
REREQ9P2R6 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
REREQ9P2R6 DBNDD1-206ENST00000568838 993 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
REREQ9P2R6 AC106872.11-201ENST00000605838 421 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
REREQ9P2R6 AL121944.1-201ENST00000605945 686 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
REREQ9P2R6 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
REREQ9P2R6 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
REREQ9P2R6 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
REREQ9P2R6 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
REREQ9P2R6 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
REREQ9P2R6 BCS1L-203ENST00000392110 1525 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
REREQ9P2R6 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
REREQ9P2R6 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
REREQ9P2R6 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
REREQ9P2R6 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
REREQ9P2R6 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
REREQ9P2R6 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
REREQ9P2R6 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
REREQ9P2R6 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
REREQ9P2R6 FAM169B-201ENST00000332908 579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
REREQ9P2R6 DYNC1I1-203ENST00000413338 958 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
REREQ9P2R6 HYAL1-208ENST00000457214 1084 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
REREQ9P2R6 GLYCTK-203ENST00000461183 889 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
REREQ9P2R6 SELENOW-201ENST00000509570 881 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
REREQ9P2R6 COG4-212ENST00000564653 590 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
REREQ9P2R6 AC010491.1-202ENST00000567048 528 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
REREQ9P2R6 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
REREQ9P2R6 RPS5-209ENST00000601521 1203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
REREQ9P2R6 LINC01663-201ENST00000614596 535 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
REREQ9P2R6 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
REREQ9P2R6 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
REREQ9P2R6 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
REREQ9P2R6 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
REREQ9P2R6 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
REREQ9P2R6 FBP1-203ENST00000415431 1487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
REREQ9P2R6 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
REREQ9P2R6 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
REREQ9P2R6 AGRP-201ENST00000290953 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
REREQ9P2R6 AC078852.2-201ENST00000504748 527 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
REREQ9P2R6 GTF2H2C-215ENST00000514162 610 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
REREQ9P2R6 CNGA4-202ENST00000533426 936 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
REREQ9P2R6 AC006449.3-201ENST00000620144 563 ntTSL 4 BASIC24.03■■□□□ 1.44
REREQ9P2R6 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
REREQ9P2R6 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
REREQ9P2R6 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
REREQ9P2R6 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
REREQ9P2R6 CHST10-203ENST00000409701 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
REREQ9P2R6 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
REREQ9P2R6 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
REREQ9P2R6 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
REREQ9P2R6 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
REREQ9P2R6 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
REREQ9P2R6 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
REREQ9P2R6 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
REREQ9P2R6 AC053503.1-201ENST00000429882 519 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
REREQ9P2R6 CALR4P-201ENST00000431943 946 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
REREQ9P2R6 AC012441.1-201ENST00000446669 685 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
REREQ9P2R6 AL355864.2-201ENST00000447420 863 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
REREQ9P2R6 AC106760.1-201ENST00000508690 800 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
REREQ9P2R6 PXN-AS1-204ENST00000542265 854 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
REREQ9P2R6 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
REREQ9P2R6 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
REREQ9P2R6 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
REREQ9P2R6 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
REREQ9P2R6 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
REREQ9P2R6 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
REREQ9P2R6 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
REREQ9P2R6 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
REREQ9P2R6 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
REREQ9P2R6 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
REREQ9P2R6 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
REREQ9P2R6 UBXN1-202ENST00000301935 1153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
REREQ9P2R6 DMKN-204ENST00000408915 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
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