Protein–RNA interactions for Protein: Q9H6J7

C11orf49, UPF0705 protein C11orf49, humanhuman

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C11orf49Q9H6J7 HIST2H2BA-202ENST00000430394 752 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
C11orf49Q9H6J7 PFN1P12-201ENST00000455938 534 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
C11orf49Q9H6J7 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
C11orf49Q9H6J7 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
C11orf49Q9H6J7 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
C11orf49Q9H6J7 KXD1-204ENST00000595073 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
C11orf49Q9H6J7 AC074044.1-201ENST00000609673 707 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
C11orf49Q9H6J7 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
C11orf49Q9H6J7 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
C11orf49Q9H6J7 FAH-201ENST00000261755 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
C11orf49Q9H6J7 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
C11orf49Q9H6J7 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
C11orf49Q9H6J7 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
C11orf49Q9H6J7 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
C11orf49Q9H6J7 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
C11orf49Q9H6J7 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
C11orf49Q9H6J7 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
C11orf49Q9H6J7 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
C11orf49Q9H6J7 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
C11orf49Q9H6J7 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
C11orf49Q9H6J7 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
C11orf49Q9H6J7 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
C11orf49Q9H6J7 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
C11orf49Q9H6J7 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
C11orf49Q9H6J7 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
C11orf49Q9H6J7 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
C11orf49Q9H6J7 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
C11orf49Q9H6J7 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
C11orf49Q9H6J7 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
C11orf49Q9H6J7 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
C11orf49Q9H6J7 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
C11orf49Q9H6J7 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
C11orf49Q9H6J7 RHD-204ENST00000417538 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
C11orf49Q9H6J7 KCNK7-201ENST00000340313 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
C11orf49Q9H6J7 LLPH-AS1-201ENST00000510317 623 ntTSL 4 BASIC18.1■□□□□ 0.49
C11orf49Q9H6J7 PLEKHB1-206ENST00000535129 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
C11orf49Q9H6J7 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
C11orf49Q9H6J7 AC124287.1-201ENST00000582249 838 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
C11orf49Q9H6J7 AL022328.1-201ENST00000610050 478 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
C11orf49Q9H6J7 AC006453.2-202ENST00000635968 827 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
C11orf49Q9H6J7 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
C11orf49Q9H6J7 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
C11orf49Q9H6J7 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
C11orf49Q9H6J7 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
C11orf49Q9H6J7 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
C11orf49Q9H6J7 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
C11orf49Q9H6J7 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
C11orf49Q9H6J7 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
C11orf49Q9H6J7 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
C11orf49Q9H6J7 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
C11orf49Q9H6J7 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
C11orf49Q9H6J7 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
C11orf49Q9H6J7 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
C11orf49Q9H6J7 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
C11orf49Q9H6J7 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
C11orf49Q9H6J7 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
C11orf49Q9H6J7 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
C11orf49Q9H6J7 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
C11orf49Q9H6J7 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
C11orf49Q9H6J7 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
C11orf49Q9H6J7 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
C11orf49Q9H6J7 AC007731.4-201ENST00000420225 652 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
C11orf49Q9H6J7 FO681548.1-201ENST00000455617 1132 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
C11orf49Q9H6J7 CCKBR-202ENST00000525014 792 ntTSL 4 BASIC18.09■□□□□ 0.49
C11orf49Q9H6J7 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
C11orf49Q9H6J7 AC087612.1-201ENST00000560238 658 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
C11orf49Q9H6J7 GCHFR-206ENST00000561160 572 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
C11orf49Q9H6J7 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
C11orf49Q9H6J7 ARL16-210ENST00000574938 751 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
C11orf49Q9H6J7 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
C11orf49Q9H6J7 MIR3615-201ENST00000581999 87 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
C11orf49Q9H6J7 YIF1B-214ENST00000591784 940 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
C11orf49Q9H6J7 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
C11orf49Q9H6J7 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.09■□□□□ 0.49
C11orf49Q9H6J7 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
C11orf49Q9H6J7 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
C11orf49Q9H6J7 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
C11orf49Q9H6J7 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
C11orf49Q9H6J7 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
C11orf49Q9H6J7 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
C11orf49Q9H6J7 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
C11orf49Q9H6J7 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
C11orf49Q9H6J7 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
C11orf49Q9H6J7 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
C11orf49Q9H6J7 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC18.09■□□□□ 0.49
C11orf49Q9H6J7 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
C11orf49Q9H6J7 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
C11orf49Q9H6J7 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.49
C11orf49Q9H6J7 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
C11orf49Q9H6J7 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
C11orf49Q9H6J7 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
C11orf49Q9H6J7 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
C11orf49Q9H6J7 AC020915.1-201ENST00000413518 1469 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
C11orf49Q9H6J7 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
C11orf49Q9H6J7 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
C11orf49Q9H6J7 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
C11orf49Q9H6J7 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
C11orf49Q9H6J7 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
C11orf49Q9H6J7 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
C11orf49Q9H6J7 CARTPT-201ENST00000296777 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.5 ms