Protein–RNA interactions for Protein: Q9C000

NLRP1, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRP1Q9C000 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NLRP1Q9C000 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
NLRP1Q9C000 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NLRP1Q9C000 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NLRP1Q9C000 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
NLRP1Q9C000 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NLRP1Q9C000 RETN-201ENST00000221515 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NLRP1Q9C000 NPY-201ENST00000242152 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NLRP1Q9C000 KCNK7-201ENST00000340313 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NLRP1Q9C000 FANK1-204ENST00000368695 1296 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NLRP1Q9C000 AP001007.1-201ENST00000526796 645 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
NLRP1Q9C000 LINC01595-201ENST00000555406 639 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
NLRP1Q9C000 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
NLRP1Q9C000 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NLRP1Q9C000 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
NLRP1Q9C000 ETV7-201ENST00000339796 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NLRP1Q9C000 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
NLRP1Q9C000 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NLRP1Q9C000 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
NLRP1Q9C000 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
NLRP1Q9C000 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NLRP1Q9C000 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NLRP1Q9C000 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
NLRP1Q9C000 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NLRP1Q9C000 CATSPERZ-201ENST00000328404 743 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NLRP1Q9C000 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
NLRP1Q9C000 AL442647.2-201ENST00000429864 857 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
NLRP1Q9C000 AL121845.2-201ENST00000467211 252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
NLRP1Q9C000 AC108725.1-201ENST00000495472 409 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
NLRP1Q9C000 AP001005.4-201ENST00000572530 387 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
NLRP1Q9C000 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
NLRP1Q9C000 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NLRP1Q9C000 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
NLRP1Q9C000 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NLRP1Q9C000 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
NLRP1Q9C000 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NLRP1Q9C000 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
NLRP1Q9C000 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NLRP1Q9C000 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
NLRP1Q9C000 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NLRP1Q9C000 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NLRP1Q9C000 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
NLRP1Q9C000 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NLRP1Q9C000 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
NLRP1Q9C000 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
NLRP1Q9C000 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
NLRP1Q9C000 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
NLRP1Q9C000 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
NLRP1Q9C000 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
NLRP1Q9C000 SLC25A19-202ENST00000375261 1486 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
NLRP1Q9C000 IGHA1-202ENST00000641837 1310 ntAPPRIS P5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
NLRP1Q9C000 FLT3LG-201ENST00000204637 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
NLRP1Q9C000 LCE1E-202ENST00000368771 575 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
NLRP1Q9C000 AC007405.2-202ENST00000418106 540 ntTSL 4 BASIC23.58■■□□□ 1.37
NLRP1Q9C000 LLPH-AS1-201ENST00000510317 623 ntTSL 4 BASIC23.58■■□□□ 1.37
NLRP1Q9C000 GCHFR-203ENST00000558670 412 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
NLRP1Q9C000 AC103810.3-201ENST00000583567 96 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
NLRP1Q9C000 AL139099.5-201ENST00000635274 300 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
NLRP1Q9C000 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
NLRP1Q9C000 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
NLRP1Q9C000 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
NLRP1Q9C000 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
NLRP1Q9C000 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
NLRP1Q9C000 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
NLRP1Q9C000 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
NLRP1Q9C000 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NLRP1Q9C000 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NLRP1Q9C000 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NLRP1Q9C000 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NLRP1Q9C000 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NLRP1Q9C000 USB1-202ENST00000423271 1217 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NLRP1Q9C000 HLA-DPB2-205ENST00000435074 1188 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
NLRP1Q9C000 AC018685.1-201ENST00000457813 368 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NLRP1Q9C000 AC147067.1-201ENST00000466692 579 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NLRP1Q9C000 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NLRP1Q9C000 AC104596.2-201ENST00000512793 793 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
NLRP1Q9C000 AC138028.3-201ENST00000561699 213 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NLRP1Q9C000 AC124287.1-201ENST00000582249 838 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NLRP1Q9C000 AC005746.1-201ENST00000589244 672 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NLRP1Q9C000 AC010336.6-201ENST00000595107 528 ntTSL 4 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NLRP1Q9C000 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NLRP1Q9C000 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NLRP1Q9C000 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NLRP1Q9C000 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NLRP1Q9C000 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NLRP1Q9C000 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NLRP1Q9C000 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NLRP1Q9C000 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NLRP1Q9C000 PPP1R1B-205ENST00000579000 1466 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NLRP1Q9C000 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NLRP1Q9C000 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NLRP1Q9C000 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
NLRP1Q9C000 NCR1-201ENST00000291890 1155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
NLRP1Q9C000 NCR1-202ENST00000338835 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NLRP1Q9C000 NCR1-203ENST00000350790 739 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NLRP1Q9C000 NTMT1-202ENST00000372481 741 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
NLRP1Q9C000 AL161638.1-201ENST00000420354 481 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
NLRP1Q9C000 AGER-214ENST00000538695 487 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
NLRP1Q9C000 AC011489.1-202ENST00000586556 618 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
NLRP1Q9C000 AGER-215ENST00000620802 737 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.2 ms