Protein–RNA interactions for Protein: Q99674

CGREF1, Cell growth regulator with EF hand domain protein 1, humanhuman

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Length 301 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CGREF1Q99674 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CGREF1Q99674 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CGREF1Q99674 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CGREF1Q99674 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CGREF1Q99674 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CGREF1Q99674 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CGREF1Q99674 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CGREF1Q99674 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CGREF1Q99674 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CGREF1Q99674 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CGREF1Q99674 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CGREF1Q99674 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CGREF1Q99674 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CGREF1Q99674 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CGREF1Q99674 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CGREF1Q99674 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CGREF1Q99674 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CGREF1Q99674 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CGREF1Q99674 CSAD-202ENST00000379843 2086 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CGREF1Q99674 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CGREF1Q99674 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CGREF1Q99674 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CGREF1Q99674 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CGREF1Q99674 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CGREF1Q99674 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CGREF1Q99674 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CGREF1Q99674 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CGREF1Q99674 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CGREF1Q99674 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CGREF1Q99674 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CGREF1Q99674 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CGREF1Q99674 CYP4X1-201ENST00000371901 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CGREF1Q99674 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CGREF1Q99674 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CGREF1Q99674 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CGREF1Q99674 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CGREF1Q99674 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CGREF1Q99674 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CGREF1Q99674 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CGREF1Q99674 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CGREF1Q99674 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CGREF1Q99674 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CGREF1Q99674 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CGREF1Q99674 DMTN-206ENST00000443491 2415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CGREF1Q99674 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CGREF1Q99674 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CGREF1Q99674 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CGREF1Q99674 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CGREF1Q99674 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CGREF1Q99674 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CGREF1Q99674 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CGREF1Q99674 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CGREF1Q99674 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CGREF1Q99674 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CGREF1Q99674 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CGREF1Q99674 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CGREF1Q99674 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CGREF1Q99674 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CGREF1Q99674 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CGREF1Q99674 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CGREF1Q99674 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CGREF1Q99674 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CGREF1Q99674 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CGREF1Q99674 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CGREF1Q99674 C5orf30-202ENST00000510890 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CGREF1Q99674 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CGREF1Q99674 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CGREF1Q99674 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CGREF1Q99674 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CGREF1Q99674 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CGREF1Q99674 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CGREF1Q99674 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CGREF1Q99674 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CGREF1Q99674 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CGREF1Q99674 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CGREF1Q99674 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CGREF1Q99674 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CGREF1Q99674 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CGREF1Q99674 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CGREF1Q99674 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CGREF1Q99674 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CGREF1Q99674 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CGREF1Q99674 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CGREF1Q99674 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CGREF1Q99674 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CGREF1Q99674 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CGREF1Q99674 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CGREF1Q99674 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CGREF1Q99674 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CGREF1Q99674 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CGREF1Q99674 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CGREF1Q99674 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CGREF1Q99674 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CGREF1Q99674 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CGREF1Q99674 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CGREF1Q99674 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CGREF1Q99674 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CGREF1Q99674 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CGREF1Q99674 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CGREF1Q99674 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
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