Protein–RNA interactions for Protein: Q96F63

CCDC97, Coiled-coil domain-containing protein 97, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC97Q96F63 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC97Q96F63 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC97Q96F63 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC97Q96F63 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC97Q96F63 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC97Q96F63 MEF2D-201ENST00000348159 5965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC97Q96F63 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC97Q96F63 EYA4-205ENST00000430974 2364 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC97Q96F63 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC97Q96F63 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC97Q96F63 UBE3A-207ENST00000614096 8741 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC97Q96F63 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC97Q96F63 NOS1AP-201ENST00000361897 4931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC97Q96F63 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC97Q96F63 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC97Q96F63 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC97Q96F63 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC97Q96F63 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC97Q96F63 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC97Q96F63 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC97Q96F63 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC97Q96F63 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC97Q96F63 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC97Q96F63 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC97Q96F63 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC97Q96F63 EXT1-201ENST00000378204 8270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC97Q96F63 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC97Q96F63 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC97Q96F63 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC97Q96F63 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC97Q96F63 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC97Q96F63 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC97Q96F63 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC97Q96F63 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC97Q96F63 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC97Q96F63 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC97Q96F63 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC97Q96F63 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC97Q96F63 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC97Q96F63 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC97Q96F63 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC97Q96F63 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC97Q96F63 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC97Q96F63 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC97Q96F63 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC97Q96F63 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC97Q96F63 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC97Q96F63 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC97Q96F63 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC97Q96F63 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC97Q96F63 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC97Q96F63 TP53INP1-201ENST00000342697 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC97Q96F63 PRKD2-206ENST00000595515 3012 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC97Q96F63 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC97Q96F63 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC97Q96F63 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC97Q96F63 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC97Q96F63 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC97Q96F63 AC022400.6-201ENST00000603027 5818 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC97Q96F63 SLCO4C1-201ENST00000310954 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC97Q96F63 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC97Q96F63 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC97Q96F63 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC97Q96F63 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC97Q96F63 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC97Q96F63 ABCC1-201ENST00000399408 6594 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC97Q96F63 ABCC1-202ENST00000399410 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC97Q96F63 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC97Q96F63 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC97Q96F63 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC97Q96F63 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC97Q96F63 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC97Q96F63 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC97Q96F63 HCG24-202ENST00000414398 717 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC97Q96F63 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC97Q96F63 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC97Q96F63 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC97Q96F63 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC97Q96F63 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC97Q96F63 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC97Q96F63 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC97Q96F63 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC97Q96F63 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC97Q96F63 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC97Q96F63 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC97Q96F63 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC97Q96F63 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC97Q96F63 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC97Q96F63 FGD5-206ENST00000543601 5768 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC97Q96F63 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC97Q96F63 CACNA1I-203ENST00000404898 9892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC97Q96F63 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC97Q96F63 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC97Q96F63 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC97Q96F63 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC97Q96F63 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC97Q96F63 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CCDC97Q96F63 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CCDC97Q96F63 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CCDC97Q96F63 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.5 ms