Protein–RNA interactions for Protein: Q95604

HLA-C, HLA class I histocompatibility antigen, Cw-17 alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-CQ95604 APOPT1-207ENST00000477116 906 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
HLA-CQ95604 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
HLA-CQ95604 CEP57L1-208ENST00000519095 908 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
HLA-CQ95604 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
HLA-CQ95604 IFI27L1-210ENST00000556381 804 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
HLA-CQ95604 DBNDD1-206ENST00000568838 993 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
HLA-CQ95604 BX547991.1-201ENST00000582543 1206 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HLA-CQ95604 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
HLA-CQ95604 AC091271.1-201ENST00000611877 1162 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
HLA-CQ95604 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HLA-CQ95604 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HLA-CQ95604 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HLA-CQ95604 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HLA-CQ95604 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HLA-CQ95604 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
HLA-CQ95604 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
HLA-CQ95604 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HLA-CQ95604 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
HLA-CQ95604 RMND1-205ENST00000622845 1484 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
HLA-CQ95604 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
HLA-CQ95604 DHPS-201ENST00000210060 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
HLA-CQ95604 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
HLA-CQ95604 KCNAB2-212ENST00000458166 1336 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
HLA-CQ95604 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
HLA-CQ95604 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
HLA-CQ95604 NPY-201ENST00000242152 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
HLA-CQ95604 C1orf123-201ENST00000294360 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
HLA-CQ95604 MGST3-203ENST00000367885 680 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
HLA-CQ95604 LINC01806-201ENST00000436506 765 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
HLA-CQ95604 AC006033.1-201ENST00000440505 426 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
HLA-CQ95604 IGHJ2P-201ENST00000454480 60 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
HLA-CQ95604 AKIP1-210ENST00000534147 1022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
HLA-CQ95604 AP000812.2-201ENST00000538934 718 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
HLA-CQ95604 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
HLA-CQ95604 SCGB1C2-201ENST00000595228 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
HLA-CQ95604 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
HLA-CQ95604 FP565260.6-205ENST00000624120 898 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
HLA-CQ95604 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
HLA-CQ95604 RGS6-218ENST00000556437 1689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
HLA-CQ95604 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
HLA-CQ95604 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
HLA-CQ95604 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
HLA-CQ95604 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
HLA-CQ95604 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
HLA-CQ95604 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
HLA-CQ95604 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
HLA-CQ95604 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
HLA-CQ95604 AP003392.4-202ENST00000526453 1359 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
HLA-CQ95604 TBP-206ENST00000540980 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
HLA-CQ95604 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
HLA-CQ95604 TEX264-205ENST00000416589 1313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
HLA-CQ95604 UBE2V2-205ENST00000521346 1322 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
HLA-CQ95604 IGHA1-202ENST00000641837 1310 ntAPPRIS P5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
HLA-CQ95604 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
HLA-CQ95604 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
HLA-CQ95604 MUTYH-234ENST00000528013 1662 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
HLA-CQ95604 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
HLA-CQ95604 TEX13B-201ENST00000302917 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
HLA-CQ95604 EIF4EBP3-201ENST00000310331 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
HLA-CQ95604 ZG16B-201ENST00000382280 831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
HLA-CQ95604 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
HLA-CQ95604 AL161638.1-201ENST00000420354 481 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
HLA-CQ95604 DGUOK-AS1-202ENST00000439192 563 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
HLA-CQ95604 RN7SL399P-201ENST00000471648 279 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
HLA-CQ95604 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
HLA-CQ95604 SELENOW-201ENST00000509570 881 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
HLA-CQ95604 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
HLA-CQ95604 TUBB8-202ENST00000562809 820 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
HLA-CQ95604 TSR1-204ENST00000576112 1290 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
HLA-CQ95604 RIC8A-217ENST00000626818 159 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
HLA-CQ95604 OR2T27-203ENST00000641652 1285 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
HLA-CQ95604 MPPE1-201ENST00000309976 1636 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
HLA-CQ95604 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
HLA-CQ95604 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
HLA-CQ95604 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
HLA-CQ95604 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
HLA-CQ95604 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
HLA-CQ95604 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
HLA-CQ95604 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
HLA-CQ95604 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
HLA-CQ95604 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
HLA-CQ95604 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
HLA-CQ95604 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
HLA-CQ95604 AATBC-203ENST00000448247 1889 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
HLA-CQ95604 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
HLA-CQ95604 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
HLA-CQ95604 COX6A2-201ENST00000287490 440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
HLA-CQ95604 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
HLA-CQ95604 GPR17-202ENST00000393018 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
HLA-CQ95604 CALR4P-201ENST00000431943 946 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
HLA-CQ95604 AL157373.2-201ENST00000437559 784 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
HLA-CQ95604 AL157834.2-201ENST00000451737 663 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
HLA-CQ95604 RPL13AP20-201ENST00000459725 609 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
HLA-CQ95604 AL161781.2-201ENST00000509911 739 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
HLA-CQ95604 HNRNPA1P13-201ENST00000510646 963 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
HLA-CQ95604 CDKN2AIP-205ENST00000510928 860 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
HLA-CQ95604 AC090099.4-201ENST00000527671 1027 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
HLA-CQ95604 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
HLA-CQ95604 RIT1-205ENST00000539040 919 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
HLA-CQ95604 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms