Protein–RNA interactions for Protein: Q86TJ5

ZNF554, Zinc finger protein 554, humanhuman

Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF554Q86TJ5 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF554Q86TJ5 ZNF557-201ENST00000252840 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF554Q86TJ5 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF554Q86TJ5 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF554Q86TJ5 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF554Q86TJ5 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF554Q86TJ5 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF554Q86TJ5 SLC35A3-221ENST00000640600 3341 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF554Q86TJ5 USP43-202ENST00000570475 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF554Q86TJ5 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF554Q86TJ5 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF554Q86TJ5 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF554Q86TJ5 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF554Q86TJ5 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF554Q86TJ5 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF554Q86TJ5 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF554Q86TJ5 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF554Q86TJ5 ZMYM3-204ENST00000373982 1867 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF554Q86TJ5 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF554Q86TJ5 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF554Q86TJ5 SMARCA4-214ENST00000589677 5181 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF554Q86TJ5 KCTD3-201ENST00000259154 3931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF554Q86TJ5 LINC00987-201ENST00000427111 2472 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF554Q86TJ5 WDR20-205ENST00000424963 2695 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF554Q86TJ5 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF554Q86TJ5 TMPRSS6-204ENST00000406856 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF554Q86TJ5 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF554Q86TJ5 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF554Q86TJ5 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF554Q86TJ5 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF554Q86TJ5 SEMA4D-204ENST00000420101 1837 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF554Q86TJ5 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF554Q86TJ5 RCOR3-203ENST00000419091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF554Q86TJ5 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF554Q86TJ5 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF554Q86TJ5 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF554Q86TJ5 SCARF1-201ENST00000263071 3443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF554Q86TJ5 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF554Q86TJ5 PTPN5-204ENST00000396170 3871 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF554Q86TJ5 MSI1-201ENST00000257552 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF554Q86TJ5 ANKHD1-EIF4EBP3-203ENST00000532219 8246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF554Q86TJ5 MARS-233ENST00000628866 2583 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF554Q86TJ5 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF554Q86TJ5 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF554Q86TJ5 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF554Q86TJ5 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF554Q86TJ5 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF554Q86TJ5 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF554Q86TJ5 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF554Q86TJ5 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF554Q86TJ5 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF554Q86TJ5 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF554Q86TJ5 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF554Q86TJ5 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF554Q86TJ5 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF554Q86TJ5 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF554Q86TJ5 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF554Q86TJ5 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF554Q86TJ5 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF554Q86TJ5 SUGP2-202ENST00000337018 3640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF554Q86TJ5 UCKL1-AS1-201ENST00000623569 3602 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF554Q86TJ5 HS2ST1-201ENST00000370550 6736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF554Q86TJ5 GPR137C-201ENST00000321662 3888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF554Q86TJ5 CYP26A1-202ENST00000371531 2245 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF554Q86TJ5 LETMD1-201ENST00000262055 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF554Q86TJ5 SLC2A11-223ENST00000611880 3264 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF554Q86TJ5 FADS1-201ENST00000350997 4525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF554Q86TJ5 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF554Q86TJ5 NOS1AP-205ENST00000493151 5559 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF554Q86TJ5 SLC4A7-212ENST00000446700 4000 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF554Q86TJ5 MCL1-202ENST00000369026 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF554Q86TJ5 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF554Q86TJ5 GSG1L-203ENST00000447459 4916 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF554Q86TJ5 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF554Q86TJ5 NKIRAS2-201ENST00000307641 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNF554Q86TJ5 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNF554Q86TJ5 CFAP53-201ENST00000398545 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNF554Q86TJ5 ZFP64-201ENST00000216923 3264 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNF554Q86TJ5 GIPC2-201ENST00000370759 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNF554Q86TJ5 AC010327.5-201ENST00000586923 3061 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNF554Q86TJ5 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNF554Q86TJ5 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNF554Q86TJ5 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNF554Q86TJ5 SPATA7-203ENST00000393545 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNF554Q86TJ5 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNF554Q86TJ5 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNF554Q86TJ5 MINK1-201ENST00000347992 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNF554Q86TJ5 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNF554Q86TJ5 RASSF5-201ENST00000577571 3496 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNF554Q86TJ5 FSIP1-201ENST00000350221 2805 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNF554Q86TJ5 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNF554Q86TJ5 MORC4-202ENST00000355610 3834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNF554Q86TJ5 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNF554Q86TJ5 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNF554Q86TJ5 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNF554Q86TJ5 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNF554Q86TJ5 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNF554Q86TJ5 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNF554Q86TJ5 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNF554Q86TJ5 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.4 ms