Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTS3

PTF1A, Pancreas transcription factor 1 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTF1AQ7RTS3 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PTF1AQ7RTS3 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PTF1AQ7RTS3 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PTF1AQ7RTS3 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PTF1AQ7RTS3 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PTF1AQ7RTS3 FDFT1-202ENST00000443614 1393 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PTF1AQ7RTS3 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PTF1AQ7RTS3 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PTF1AQ7RTS3 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PTF1AQ7RTS3 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PTF1AQ7RTS3 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PTF1AQ7RTS3 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PTF1AQ7RTS3 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
PTF1AQ7RTS3 AC092506.1-202ENST00000401022 528 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
PTF1AQ7RTS3 AL121845.2-201ENST00000467211 252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PTF1AQ7RTS3 CDKN2AIP-205ENST00000510928 860 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PTF1AQ7RTS3 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PTF1AQ7RTS3 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PTF1AQ7RTS3 AC007333.1-201ENST00000568286 630 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PTF1AQ7RTS3 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PTF1AQ7RTS3 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PTF1AQ7RTS3 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PTF1AQ7RTS3 SLC25A19-202ENST00000375261 1486 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PTF1AQ7RTS3 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PTF1AQ7RTS3 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PTF1AQ7RTS3 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PTF1AQ7RTS3 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PTF1AQ7RTS3 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PTF1AQ7RTS3 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PTF1AQ7RTS3 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PTF1AQ7RTS3 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PTF1AQ7RTS3 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PTF1AQ7RTS3 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PTF1AQ7RTS3 KCNK7-201ENST00000340313 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PTF1AQ7RTS3 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PTF1AQ7RTS3 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PTF1AQ7RTS3 AC078852.2-201ENST00000504748 527 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PTF1AQ7RTS3 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PTF1AQ7RTS3 TSR1-204ENST00000576112 1290 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PTF1AQ7RTS3 AC129510.1-201ENST00000579979 555 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PTF1AQ7RTS3 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PTF1AQ7RTS3 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PTF1AQ7RTS3 AC243960.2-201ENST00000600996 747 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
PTF1AQ7RTS3 AC074044.1-201ENST00000609673 707 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
PTF1AQ7RTS3 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PTF1AQ7RTS3 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PTF1AQ7RTS3 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PTF1AQ7RTS3 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PTF1AQ7RTS3 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
PTF1AQ7RTS3 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PTF1AQ7RTS3 MUTYH-234ENST00000528013 1662 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PTF1AQ7RTS3 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PTF1AQ7RTS3 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PTF1AQ7RTS3 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PTF1AQ7RTS3 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PTF1AQ7RTS3 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PTF1AQ7RTS3 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PTF1AQ7RTS3 NINJ2-201ENST00000305108 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PTF1AQ7RTS3 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PTF1AQ7RTS3 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PTF1AQ7RTS3 PPDPF-201ENST00000370177 627 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PTF1AQ7RTS3 RN7SL399P-201ENST00000471648 279 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
PTF1AQ7RTS3 LGALS9C-215ENST00000584941 1104 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PTF1AQ7RTS3 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PTF1AQ7RTS3 AL121944.1-201ENST00000605945 686 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PTF1AQ7RTS3 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PTF1AQ7RTS3 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PTF1AQ7RTS3 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PTF1AQ7RTS3 PSMC5-209ENST00000580864 1552 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PTF1AQ7RTS3 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PTF1AQ7RTS3 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PTF1AQ7RTS3 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PTF1AQ7RTS3 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PTF1AQ7RTS3 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
PTF1AQ7RTS3 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PTF1AQ7RTS3 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PTF1AQ7RTS3 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PTF1AQ7RTS3 RMND1-205ENST00000622845 1484 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
PTF1AQ7RTS3 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PTF1AQ7RTS3 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
PTF1AQ7RTS3 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
PTF1AQ7RTS3 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PTF1AQ7RTS3 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PTF1AQ7RTS3 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PTF1AQ7RTS3 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PTF1AQ7RTS3 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PTF1AQ7RTS3 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PTF1AQ7RTS3 RETN-201ENST00000221515 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PTF1AQ7RTS3 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PTF1AQ7RTS3 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PTF1AQ7RTS3 UROS-203ENST00000368786 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PTF1AQ7RTS3 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PTF1AQ7RTS3 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
PTF1AQ7RTS3 AC073133.1-201ENST00000426187 432 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
PTF1AQ7RTS3 ACTG1P3-201ENST00000431775 1114 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
PTF1AQ7RTS3 RPL7P3-201ENST00000441388 714 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
PTF1AQ7RTS3 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
PTF1AQ7RTS3 FO681548.1-201ENST00000455617 1132 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
PTF1AQ7RTS3 AC018685.1-201ENST00000457813 368 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
PTF1AQ7RTS3 GLYCTK-203ENST00000461183 889 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms