Protein–RNA interactions for Protein: Q76N89

HECW1, E3 ubiquitin-protein ligase HECW1, humanhuman

Predictions only

Length 1,606 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HECW1Q76N89 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
HECW1Q76N89 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
HECW1Q76N89 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC25.51■■□□□ 1.67
HECW1Q76N89 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
HECW1Q76N89 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
HECW1Q76N89 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
HECW1Q76N89 SZT2-AS1-201ENST00000396885 699 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
HECW1Q76N89 AC087499.6-201ENST00000411576 835 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
HECW1Q76N89 PTK7-212ENST00000476760 902 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
HECW1Q76N89 ZSCAN2-213ENST00000541040 965 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
HECW1Q76N89 AC017083.2-201ENST00000608069 979 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
HECW1Q76N89 AL391069.4-201ENST00000609583 481 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
HECW1Q76N89 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
HECW1Q76N89 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
HECW1Q76N89 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
HECW1Q76N89 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
HECW1Q76N89 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
HECW1Q76N89 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
HECW1Q76N89 RABEPK-201ENST00000259460 1313 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
HECW1Q76N89 IL25-201ENST00000329715 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
HECW1Q76N89 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
HECW1Q76N89 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
HECW1Q76N89 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
HECW1Q76N89 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
HECW1Q76N89 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
HECW1Q76N89 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
HECW1Q76N89 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
HECW1Q76N89 BANF1-201ENST00000312175 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
HECW1Q76N89 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
HECW1Q76N89 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
HECW1Q76N89 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
HECW1Q76N89 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
HECW1Q76N89 LINC02356-202ENST00000552663 314 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
HECW1Q76N89 LINC01975-201ENST00000571890 549 ntTSL 4 BASIC25.5■■□□□ 1.67
HECW1Q76N89 PDCD6-212ENST00000614778 1050 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
HECW1Q76N89 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
HECW1Q76N89 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
HECW1Q76N89 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
HECW1Q76N89 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
HECW1Q76N89 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.5■■□□□ 1.67
HECW1Q76N89 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC25.5■■□□□ 1.67
HECW1Q76N89 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
HECW1Q76N89 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
HECW1Q76N89 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
HECW1Q76N89 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
HECW1Q76N89 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
HECW1Q76N89 RAD18-204ENST00000418463 563 ntTSL 4 BASIC25.49■■□□□ 1.67
HECW1Q76N89 RAD18-205ENST00000421052 582 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
HECW1Q76N89 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC25.49■■□□□ 1.67
HECW1Q76N89 POMK-203ENST00000614426 1527 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.49■■□□□ 1.67
HECW1Q76N89 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
HECW1Q76N89 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
HECW1Q76N89 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
HECW1Q76N89 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
HECW1Q76N89 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
HECW1Q76N89 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
HECW1Q76N89 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
HECW1Q76N89 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
HECW1Q76N89 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
HECW1Q76N89 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
HECW1Q76N89 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
HECW1Q76N89 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
HECW1Q76N89 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
HECW1Q76N89 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
HECW1Q76N89 IFITM3-201ENST00000399808 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
HECW1Q76N89 AL031283.3-201ENST00000439788 727 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
HECW1Q76N89 Z98749.2-207ENST00000443658 679 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
HECW1Q76N89 AC008770.3-202ENST00000591944 567 ntTSL 4 BASIC25.48■■□□□ 1.67
HECW1Q76N89 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
HECW1Q76N89 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
HECW1Q76N89 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
HECW1Q76N89 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
HECW1Q76N89 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
HECW1Q76N89 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
HECW1Q76N89 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
HECW1Q76N89 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
HECW1Q76N89 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
HECW1Q76N89 KLK15-201ENST00000326856 1389 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
HECW1Q76N89 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
HECW1Q76N89 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
HECW1Q76N89 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
HECW1Q76N89 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
HECW1Q76N89 AC098850.1-201ENST00000419919 790 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
HECW1Q76N89 RPS2P32-201ENST00000439199 892 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
HECW1Q76N89 TTTY23B-201ENST00000442790 549 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
HECW1Q76N89 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
HECW1Q76N89 ELK1P1-201ENST00000485699 580 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
HECW1Q76N89 CLNS1A-210ENST00000528364 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
HECW1Q76N89 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
HECW1Q76N89 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
HECW1Q76N89 VEZF1-202ENST00000581208 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
HECW1Q76N89 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
HECW1Q76N89 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
HECW1Q76N89 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
HECW1Q76N89 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
HECW1Q76N89 PRAP1-201ENST00000433452 971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
HECW1Q76N89 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
HECW1Q76N89 RRP7BP-205ENST00000566851 833 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
HECW1Q76N89 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
HECW1Q76N89 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.8 ms