Protein–RNA interactions for Protein: Q6AI14

SLC9A4, Sodium/hydrogen exchanger 4, humanhuman

Predictions only

Length 798 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC9A4Q6AI14 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC9A4Q6AI14 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC9A4Q6AI14 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC9A4Q6AI14 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC9A4Q6AI14 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC9A4Q6AI14 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC9A4Q6AI14 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC9A4Q6AI14 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC9A4Q6AI14 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLC9A4Q6AI14 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLC9A4Q6AI14 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLC9A4Q6AI14 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLC9A4Q6AI14 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLC9A4Q6AI14 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLC9A4Q6AI14 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLC9A4Q6AI14 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLC9A4Q6AI14 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLC9A4Q6AI14 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLC9A4Q6AI14 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
SLC9A4Q6AI14 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLC9A4Q6AI14 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLC9A4Q6AI14 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLC9A4Q6AI14 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLC9A4Q6AI14 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLC9A4Q6AI14 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLC9A4Q6AI14 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLC9A4Q6AI14 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLC9A4Q6AI14 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLC9A4Q6AI14 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLC9A4Q6AI14 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLC9A4Q6AI14 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLC9A4Q6AI14 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLC9A4Q6AI14 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLC9A4Q6AI14 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLC9A4Q6AI14 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLC9A4Q6AI14 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLC9A4Q6AI14 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLC9A4Q6AI14 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLC9A4Q6AI14 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLC9A4Q6AI14 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLC9A4Q6AI14 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLC9A4Q6AI14 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLC9A4Q6AI14 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLC9A4Q6AI14 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLC9A4Q6AI14 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLC9A4Q6AI14 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLC9A4Q6AI14 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLC9A4Q6AI14 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLC9A4Q6AI14 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
SLC9A4Q6AI14 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLC9A4Q6AI14 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLC9A4Q6AI14 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLC9A4Q6AI14 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLC9A4Q6AI14 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLC9A4Q6AI14 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLC9A4Q6AI14 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLC9A4Q6AI14 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLC9A4Q6AI14 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLC9A4Q6AI14 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLC9A4Q6AI14 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLC9A4Q6AI14 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLC9A4Q6AI14 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLC9A4Q6AI14 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLC9A4Q6AI14 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLC9A4Q6AI14 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLC9A4Q6AI14 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLC9A4Q6AI14 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLC9A4Q6AI14 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLC9A4Q6AI14 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLC9A4Q6AI14 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLC9A4Q6AI14 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLC9A4Q6AI14 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
SLC9A4Q6AI14 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLC9A4Q6AI14 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLC9A4Q6AI14 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLC9A4Q6AI14 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
SLC9A4Q6AI14 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLC9A4Q6AI14 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
SLC9A4Q6AI14 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLC9A4Q6AI14 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLC9A4Q6AI14 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLC9A4Q6AI14 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
SLC9A4Q6AI14 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
SLC9A4Q6AI14 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLC9A4Q6AI14 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
SLC9A4Q6AI14 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLC9A4Q6AI14 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLC9A4Q6AI14 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLC9A4Q6AI14 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLC9A4Q6AI14 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLC9A4Q6AI14 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLC9A4Q6AI14 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLC9A4Q6AI14 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLC9A4Q6AI14 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLC9A4Q6AI14 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLC9A4Q6AI14 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLC9A4Q6AI14 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLC9A4Q6AI14 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLC9A4Q6AI14 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLC9A4Q6AI14 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.8 ms