Protein–RNA interactions for Protein: Q5VSD8

Putative uncharacterized protein LOC401522, humanhuman

Predictions only

Length 79 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q5VSD8 PHLDA2-201ENST00000314222 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Q5VSD8 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Q5VSD8 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Q5VSD8 Z82214.2-201ENST00000420269 531 ntTSL 4 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Q5VSD8 FAM21FP-201ENST00000426241 1131 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Q5VSD8 KIF9-205ENST00000432493 633 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Q5VSD8 AL589987.1-201ENST00000453380 819 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Q5VSD8 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Q5VSD8 TAF8-204ENST00000456846 1293 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Q5VSD8 FADS2-205ENST00000517839 469 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Q5VSD8 TMEM218-210ENST00000529609 734 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Q5VSD8 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Q5VSD8 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Q5VSD8 IGHV3OR16-16-201ENST00000563644 343 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Q5VSD8 APRT-204ENST00000563655 709 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Q5VSD8 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Q5VSD8 LINC01887-202ENST00000584734 860 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Q5VSD8 BTNL10-201ENST00000595971 695 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Q5VSD8 AC243960.2-201ENST00000600996 747 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Q5VSD8 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Q5VSD8 MIR8072-201ENST00000614241 80 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Q5VSD8 HIST1H2BO-201ENST00000616182 381 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Q5VSD8 AC244517.4-201ENST00000624549 580 ntTSL 4 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Q5VSD8 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Q5VSD8 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Q5VSD8 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Q5VSD8 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Q5VSD8 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Q5VSD8 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Q5VSD8 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Q5VSD8 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Q5VSD8 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Q5VSD8 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Q5VSD8 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Q5VSD8 TCEA2-203ENST00000361317 1427 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Q5VSD8 BRINP1-202ENST00000373964 1641 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Q5VSD8 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Q5VSD8 MUC1-228ENST00000620103 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Q5VSD8 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Q5VSD8 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Q5VSD8 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Q5VSD8 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Q5VSD8 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Q5VSD8 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Q5VSD8 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Q5VSD8 TRIM50-202ENST00000453152 1599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Q5VSD8 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Q5VSD8 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Q5VSD8 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Q5VSD8 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Q5VSD8 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Q5VSD8 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Q5VSD8 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Q5VSD8 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Q5VSD8 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Q5VSD8 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Q5VSD8 OSTF1-201ENST00000346234 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Q5VSD8 RHD-204ENST00000417538 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Q5VSD8 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Q5VSD8 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Q5VSD8 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Q5VSD8 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Q5VSD8 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Q5VSD8 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Q5VSD8 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Q5VSD8 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Q5VSD8 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Q5VSD8 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Q5VSD8 FAH-201ENST00000261755 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Q5VSD8 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Q5VSD8 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Q5VSD8 IFNL2-201ENST00000331982 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Q5VSD8 CYB561D1-202ENST00000369868 1085 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Q5VSD8 EDN2-201ENST00000372587 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Q5VSD8 TSPAN32-204ENST00000381121 999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Q5VSD8 MDP1-202ENST00000396833 582 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Q5VSD8 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Q5VSD8 MORN2-204ENST00000409665 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Q5VSD8 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Q5VSD8 HOXB-AS1-201ENST00000435312 806 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Q5VSD8 SYNPR-202ENST00000450542 1004 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Q5VSD8 LINC01336-201ENST00000503568 534 ntTSL 4 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Q5VSD8 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Q5VSD8 AC136475.5-202ENST00000524824 587 ntTSL 4 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Q5VSD8 AC009163.1-201ENST00000530512 573 ntTSL 4 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Q5VSD8 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Q5VSD8 RRP7BP-205ENST00000566851 833 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Q5VSD8 AC233724.13-201ENST00000598383 410 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Q5VSD8 LINC01703-202ENST00000602806 595 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Q5VSD8 WNT11-204ENST00000621122 789 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Q5VSD8 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Q5VSD8 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Q5VSD8 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Q5VSD8 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Q5VSD8 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Q5VSD8 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Q5VSD8 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Q5VSD8 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Q5VSD8 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Q5VSD8 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms