Protein–RNA interactions for Protein: Q5JU00

TCTE1, T-complex-associated testis-expressed protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCTE1Q5JU00 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TCTE1Q5JU00 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TCTE1Q5JU00 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TCTE1Q5JU00 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TCTE1Q5JU00 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
TCTE1Q5JU00 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TCTE1Q5JU00 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TCTE1Q5JU00 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TCTE1Q5JU00 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
TCTE1Q5JU00 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TCTE1Q5JU00 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TCTE1Q5JU00 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TCTE1Q5JU00 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TCTE1Q5JU00 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TCTE1Q5JU00 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TCTE1Q5JU00 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TCTE1Q5JU00 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TCTE1Q5JU00 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TCTE1Q5JU00 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TCTE1Q5JU00 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TCTE1Q5JU00 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TCTE1Q5JU00 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TCTE1Q5JU00 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TCTE1Q5JU00 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TCTE1Q5JU00 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TCTE1Q5JU00 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TCTE1Q5JU00 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TCTE1Q5JU00 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TCTE1Q5JU00 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TCTE1Q5JU00 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TCTE1Q5JU00 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TCTE1Q5JU00 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TCTE1Q5JU00 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TCTE1Q5JU00 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TCTE1Q5JU00 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
TCTE1Q5JU00 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TCTE1Q5JU00 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
TCTE1Q5JU00 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TCTE1Q5JU00 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TCTE1Q5JU00 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TCTE1Q5JU00 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TCTE1Q5JU00 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TCTE1Q5JU00 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TCTE1Q5JU00 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TCTE1Q5JU00 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TCTE1Q5JU00 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TCTE1Q5JU00 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TCTE1Q5JU00 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TCTE1Q5JU00 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TCTE1Q5JU00 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TCTE1Q5JU00 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TCTE1Q5JU00 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TCTE1Q5JU00 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TCTE1Q5JU00 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TCTE1Q5JU00 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TCTE1Q5JU00 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
TCTE1Q5JU00 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TCTE1Q5JU00 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TCTE1Q5JU00 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TCTE1Q5JU00 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TCTE1Q5JU00 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TCTE1Q5JU00 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TCTE1Q5JU00 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TCTE1Q5JU00 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TCTE1Q5JU00 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TCTE1Q5JU00 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TCTE1Q5JU00 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TCTE1Q5JU00 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TCTE1Q5JU00 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TCTE1Q5JU00 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TCTE1Q5JU00 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TCTE1Q5JU00 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TCTE1Q5JU00 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TCTE1Q5JU00 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TCTE1Q5JU00 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TCTE1Q5JU00 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TCTE1Q5JU00 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TCTE1Q5JU00 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TCTE1Q5JU00 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TCTE1Q5JU00 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TCTE1Q5JU00 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TCTE1Q5JU00 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TCTE1Q5JU00 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
TCTE1Q5JU00 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
TCTE1Q5JU00 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TCTE1Q5JU00 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TCTE1Q5JU00 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TCTE1Q5JU00 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
TCTE1Q5JU00 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TCTE1Q5JU00 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TCTE1Q5JU00 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TCTE1Q5JU00 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TCTE1Q5JU00 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TCTE1Q5JU00 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TCTE1Q5JU00 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TCTE1Q5JU00 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TCTE1Q5JU00 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TCTE1Q5JU00 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TCTE1Q5JU00 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TCTE1Q5JU00 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms