Protein–RNA interactions for Protein: Q3UX62

Ccdc114, Coiled-coil domain-containing protein 114, mousemouse

Predictions only

Length 658 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc114Q3UX62 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Ccdc114Q3UX62 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc114Q3UX62 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc114Q3UX62 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc114Q3UX62 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Ccdc114Q3UX62 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc114Q3UX62 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc114Q3UX62 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc114Q3UX62 Lmod3-201ENSMUST00000095655 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Ccdc114Q3UX62 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc114Q3UX62 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Ccdc114Q3UX62 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc114Q3UX62 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc114Q3UX62 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc114Q3UX62 Zhx2-201ENSMUST00000096430 4376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc114Q3UX62 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc114Q3UX62 Pja1-203ENSMUST00000113792 3038 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc114Q3UX62 D630014O11Rik-201ENSMUST00000160562 3019 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc114Q3UX62 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc114Q3UX62 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc114Q3UX62 Ddi2-202ENSMUST00000177592 3539 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Ccdc114Q3UX62 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc114Q3UX62 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Ccdc114Q3UX62 Nol4-208ENSMUST00000164893 2175 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Ccdc114Q3UX62 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc114Q3UX62 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Ccdc114Q3UX62 Pcbp3-203ENSMUST00000105411 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc114Q3UX62 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc114Q3UX62 Aff4-201ENSMUST00000060945 10099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Ccdc114Q3UX62 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc114Q3UX62 Foxred2-202ENSMUST00000117725 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Ccdc114Q3UX62 Smarca4-204ENSMUST00000174008 5405 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccdc114Q3UX62 Zbtb4-202ENSMUST00000108639 7811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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Ccdc114Q3UX62 Dennd6b-201ENSMUST00000078953 4607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccdc114Q3UX62 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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Ccdc114Q3UX62 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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Ccdc114Q3UX62 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccdc114Q3UX62 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccdc114Q3UX62 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccdc114Q3UX62 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccdc114Q3UX62 Rdh10-201ENSMUST00000027053 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccdc114Q3UX62 Map1lc3b-201ENSMUST00000034270 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccdc114Q3UX62 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccdc114Q3UX62 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccdc114Q3UX62 Plcb2-202ENSMUST00000102524 5145 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccdc114Q3UX62 Ccdc85a-204ENSMUST00000109502 5220 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccdc114Q3UX62 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccdc114Q3UX62 Hnrnpf-210ENSMUST00000180341 1922 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccdc114Q3UX62 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccdc114Q3UX62 Grin1-203ENSMUST00000114308 4165 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccdc114Q3UX62 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccdc114Q3UX62 Rnf4-204ENSMUST00000182047 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccdc114Q3UX62 Kcna6-202ENSMUST00000112242 3464 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccdc114Q3UX62 Med28-205ENSMUST00000156481 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccdc114Q3UX62 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccdc114Q3UX62 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccdc114Q3UX62 Cpxm2-201ENSMUST00000033149 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccdc114Q3UX62 Tbx4-201ENSMUST00000000096 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccdc114Q3UX62 Gm7049-201ENSMUST00000223520 1712 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccdc114Q3UX62 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccdc114Q3UX62 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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Ccdc114Q3UX62 Tsku-205ENSMUST00000167405 2597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
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