Protein–RNA interactions for Protein: Q16288

NTRK3, NT-3 growth factor receptor, humanhuman

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Length 839 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NTRK3Q16288 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
NTRK3Q16288 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
NTRK3Q16288 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
NTRK3Q16288 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
NTRK3Q16288 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
NTRK3Q16288 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
NTRK3Q16288 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
NTRK3Q16288 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
NTRK3Q16288 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
NTRK3Q16288 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
NTRK3Q16288 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
NTRK3Q16288 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
NTRK3Q16288 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
NTRK3Q16288 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
NTRK3Q16288 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
NTRK3Q16288 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
NTRK3Q16288 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
NTRK3Q16288 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
NTRK3Q16288 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
NTRK3Q16288 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
NTRK3Q16288 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
NTRK3Q16288 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
NTRK3Q16288 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
NTRK3Q16288 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
NTRK3Q16288 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
NTRK3Q16288 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
NTRK3Q16288 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
NTRK3Q16288 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
NTRK3Q16288 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
NTRK3Q16288 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC19.2■□□□□ 0.66
NTRK3Q16288 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
NTRK3Q16288 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
NTRK3Q16288 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
NTRK3Q16288 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
NTRK3Q16288 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
NTRK3Q16288 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
NTRK3Q16288 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
NTRK3Q16288 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
NTRK3Q16288 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
NTRK3Q16288 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
NTRK3Q16288 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
NTRK3Q16288 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
NTRK3Q16288 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
NTRK3Q16288 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
NTRK3Q16288 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
NTRK3Q16288 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
NTRK3Q16288 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
NTRK3Q16288 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
NTRK3Q16288 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
NTRK3Q16288 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
NTRK3Q16288 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
NTRK3Q16288 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
NTRK3Q16288 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
NTRK3Q16288 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
NTRK3Q16288 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
NTRK3Q16288 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
NTRK3Q16288 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
NTRK3Q16288 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
NTRK3Q16288 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
NTRK3Q16288 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
NTRK3Q16288 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
NTRK3Q16288 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
NTRK3Q16288 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
NTRK3Q16288 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC19.19■□□□□ 0.66
NTRK3Q16288 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
NTRK3Q16288 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
NTRK3Q16288 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
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NTRK3Q16288 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
NTRK3Q16288 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
NTRK3Q16288 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
NTRK3Q16288 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
NTRK3Q16288 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
NTRK3Q16288 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
NTRK3Q16288 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
NTRK3Q16288 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
NTRK3Q16288 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
NTRK3Q16288 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
NTRK3Q16288 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
NTRK3Q16288 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
NTRK3Q16288 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
NTRK3Q16288 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
NTRK3Q16288 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
NTRK3Q16288 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
NTRK3Q16288 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
NTRK3Q16288 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
NTRK3Q16288 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
NTRK3Q16288 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
NTRK3Q16288 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
NTRK3Q16288 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
NTRK3Q16288 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
NTRK3Q16288 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
NTRK3Q16288 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
NTRK3Q16288 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
NTRK3Q16288 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
NTRK3Q16288 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
NTRK3Q16288 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
NTRK3Q16288 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
NTRK3Q16288 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
NTRK3Q16288 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC19.18■□□□□ 0.66
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