Protein–RNA interactions for Protein: Q15438

CYTH1, Cytohesin-1, humanhuman

Predictions only

Length 398 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYTH1Q15438 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CYTH1Q15438 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CYTH1Q15438 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CYTH1Q15438 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
CYTH1Q15438 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CYTH1Q15438 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CYTH1Q15438 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CYTH1Q15438 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CYTH1Q15438 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CYTH1Q15438 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CYTH1Q15438 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CYTH1Q15438 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CYTH1Q15438 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CYTH1Q15438 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CYTH1Q15438 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CYTH1Q15438 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CYTH1Q15438 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CYTH1Q15438 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CYTH1Q15438 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CYTH1Q15438 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CYTH1Q15438 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CYTH1Q15438 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CYTH1Q15438 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
CYTH1Q15438 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CYTH1Q15438 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CYTH1Q15438 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CYTH1Q15438 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CYTH1Q15438 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CYTH1Q15438 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
CYTH1Q15438 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CYTH1Q15438 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CYTH1Q15438 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CYTH1Q15438 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CYTH1Q15438 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CYTH1Q15438 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CYTH1Q15438 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CYTH1Q15438 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CYTH1Q15438 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CYTH1Q15438 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CYTH1Q15438 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CYTH1Q15438 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CYTH1Q15438 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CYTH1Q15438 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CYTH1Q15438 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CYTH1Q15438 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CYTH1Q15438 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CYTH1Q15438 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CYTH1Q15438 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CYTH1Q15438 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
CYTH1Q15438 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CYTH1Q15438 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
CYTH1Q15438 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CYTH1Q15438 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CYTH1Q15438 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CYTH1Q15438 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CYTH1Q15438 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CYTH1Q15438 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CYTH1Q15438 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
CYTH1Q15438 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CYTH1Q15438 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CYTH1Q15438 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
CYTH1Q15438 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CYTH1Q15438 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CYTH1Q15438 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CYTH1Q15438 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CYTH1Q15438 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CYTH1Q15438 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CYTH1Q15438 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CYTH1Q15438 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CYTH1Q15438 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CYTH1Q15438 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CYTH1Q15438 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CYTH1Q15438 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CYTH1Q15438 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CYTH1Q15438 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CYTH1Q15438 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CYTH1Q15438 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CYTH1Q15438 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CYTH1Q15438 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CYTH1Q15438 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CYTH1Q15438 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CYTH1Q15438 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CYTH1Q15438 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CYTH1Q15438 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CYTH1Q15438 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CYTH1Q15438 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
CYTH1Q15438 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
CYTH1Q15438 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CYTH1Q15438 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
CYTH1Q15438 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
CYTH1Q15438 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CYTH1Q15438 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CYTH1Q15438 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CYTH1Q15438 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CYTH1Q15438 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CYTH1Q15438 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CYTH1Q15438 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CYTH1Q15438 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CYTH1Q15438 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CYTH1Q15438 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
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