Protein–RNA interactions for Protein: Q13670

PMS2P11, Putative postmeiotic segregation increased 2-like protein 11, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMS2P11Q13670 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
PMS2P11Q13670 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
PMS2P11Q13670 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
PMS2P11Q13670 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
PMS2P11Q13670 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
PMS2P11Q13670 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
PMS2P11Q13670 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC13.46□□□□□ -0.25
PMS2P11Q13670 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
PMS2P11Q13670 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
PMS2P11Q13670 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
PMS2P11Q13670 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
PMS2P11Q13670 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
PMS2P11Q13670 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
PMS2P11Q13670 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
PMS2P11Q13670 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
PMS2P11Q13670 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
PMS2P11Q13670 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
PMS2P11Q13670 ANKMY1-203ENST00000373318 2449 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
PMS2P11Q13670 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
PMS2P11Q13670 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
PMS2P11Q13670 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
PMS2P11Q13670 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
PMS2P11Q13670 EYA4-205ENST00000430974 2364 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
PMS2P11Q13670 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
PMS2P11Q13670 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
PMS2P11Q13670 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC13.46□□□□□ -0.26
PMS2P11Q13670 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
PMS2P11Q13670 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
PMS2P11Q13670 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
PMS2P11Q13670 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
PMS2P11Q13670 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
PMS2P11Q13670 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
PMS2P11Q13670 GPN1-212ENST00000616939 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
PMS2P11Q13670 XRRA1-202ENST00000340360 5681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
PMS2P11Q13670 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
PMS2P11Q13670 ARHGEF6-202ENST00000370620 4764 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
PMS2P11Q13670 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PMS2P11Q13670 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PMS2P11Q13670 MARVELD1-201ENST00000285605 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
PMS2P11Q13670 ECE1-204ENST00000415912 5099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PMS2P11Q13670 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PMS2P11Q13670 NFATC4-221ENST00000555453 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PMS2P11Q13670 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
PMS2P11Q13670 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
PMS2P11Q13670 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PMS2P11Q13670 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PMS2P11Q13670 AC020659.1-201ENST00000309874 2900 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
PMS2P11Q13670 TRMT2B-201ENST00000372935 2921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PMS2P11Q13670 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PMS2P11Q13670 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PMS2P11Q13670 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PMS2P11Q13670 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PMS2P11Q13670 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PMS2P11Q13670 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PMS2P11Q13670 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PMS2P11Q13670 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
PMS2P11Q13670 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
PMS2P11Q13670 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
PMS2P11Q13670 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
PMS2P11Q13670 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PMS2P11Q13670 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC13.45□□□□□ -0.26
PMS2P11Q13670 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
PMS2P11Q13670 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
PMS2P11Q13670 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
PMS2P11Q13670 SOGA3-201ENST00000465909 3756 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
PMS2P11Q13670 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PMS2P11Q13670 SMARCA4-207ENST00000541122 5139 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
PMS2P11Q13670 MAGI1-216ENST00000497477 3555 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
PMS2P11Q13670 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
PMS2P11Q13670 SPTLC2-201ENST00000216484 8170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PMS2P11Q13670 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PMS2P11Q13670 COMP-203ENST00000542601 2707 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PMS2P11Q13670 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PMS2P11Q13670 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
PMS2P11Q13670 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
PMS2P11Q13670 MTA3-203ENST00000406652 5484 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PMS2P11Q13670 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PMS2P11Q13670 RAI14-202ENST00000428746 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PMS2P11Q13670 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PMS2P11Q13670 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PMS2P11Q13670 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PMS2P11Q13670 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PMS2P11Q13670 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PMS2P11Q13670 NPY5R-203ENST00000515560 3183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
PMS2P11Q13670 NTRK3-203ENST00000357724 2980 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
PMS2P11Q13670 KCNMA1-219ENST00000480683 2963 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PMS2P11Q13670 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
PMS2P11Q13670 IGSF1-204ENST00000370903 4594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PMS2P11Q13670 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
PMS2P11Q13670 ZNF516-201ENST00000443185 8118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PMS2P11Q13670 UHRF2-201ENST00000276893 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PMS2P11Q13670 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
PMS2P11Q13670 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PMS2P11Q13670 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
PMS2P11Q13670 DPYSL3-201ENST00000343218 5476 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PMS2P11Q13670 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PMS2P11Q13670 AP002414.2-201ENST00000591780 3365 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
PMS2P11Q13670 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
PMS2P11Q13670 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PMS2P11Q13670 USP36-201ENST00000312010 5234 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms